MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	AACG	2	8	762	769	50 %	0 %	25 %	25 %	397771727
2	NC_018225	CGTC	2	8	779	786	0 %	25 %	25 %	50 %	397771727
3	NC_018225	CTAC	2	8	1677	1684	25 %	25 %	0 %	50 %	397771727
4	NC_018225	AGCG	2	8	2279	2286	25 %	0 %	50 %	25 %	397771727
5	NC_018225	TCGA	2	8	2563	2570	25 %	25 %	25 %	25 %	397771727
6	NC_018225	CCGA	2	8	2611	2618	25 %	0 %	25 %	50 %	397771727
7	NC_018225	CTGG	2	8	2879	2886	0 %	25 %	50 %	25 %	397771727
8	NC_018225	CGAC	2	8	2936	2943	25 %	0 %	25 %	50 %	397771727
9	NC_018225	GACG	2	8	3075	3082	25 %	0 %	50 %	25 %	397771727
10	NC_018225	CAGA	2	8	4059	4066	50 %	0 %	25 %	25 %	397771728
11	NC_018225	CGCC	2	8	4643	4650	0 %	0 %	25 %	75 %	397771728
12	NC_018225	TCGG	2	8	4718	4725	0 %	25 %	50 %	25 %	397771728
13	NC_018225	CTCA	2	8	5113	5120	25 %	25 %	0 %	50 %	397771729
14	NC_018225	GCTC	2	8	5139	5146	0 %	25 %	25 %	50 %	397771729
15	NC_018225	CGGT	2	8	5385	5392	0 %	25 %	50 %	25 %	397771729
16	NC_018225	ACGA	2	8	5495	5502	50 %	0 %	25 %	25 %	397771729
17	NC_018225	CGAG	2	8	6916	6923	25 %	0 %	50 %	25 %	397771730
18	NC_018225	GTCG	2	8	6931	6938	0 %	25 %	50 %	25 %	397771730
19	NC_018225	AGCG	2	8	8869	8876	25 %	0 %	50 %	25 %	397771731
20	NC_018225	GCCG	2	8	9224	9231	0 %	0 %	50 %	50 %	397771731
21	NC_018225	CGGC	2	8	9714	9721	0 %	0 %	50 %	50 %	397771732
22	NC_018225	TCAC	2	8	9839	9846	25 %	25 %	0 %	50 %	397771733
23	NC_018225	CGCT	2	8	9938	9945	0 %	25 %	25 %	50 %	397771733
24	NC_018225	CTCG	2	8	10235	10242	0 %	25 %	25 %	50 %	397771734
25	NC_018225	CGCC	2	8	10806	10813	0 %	0 %	25 %	75 %	397771735
26	NC_018225	CGAC	2	8	11108	11115	25 %	0 %	25 %	50 %	397771735
27	NC_018225	CGGC	2	8	11120	11127	0 %	0 %	50 %	50 %	397771735
28	NC_018225	CTGA	2	8	11226	11233	25 %	25 %	25 %	25 %	397771735
29	NC_018225	GCGG	2	8	11876	11883	0 %	0 %	75 %	25 %	397771736
30	NC_018225	CGAG	2	8	12003	12010	25 %	0 %	50 %	25 %	397771736
31	NC_018225	CGGT	2	8	12414	12421	0 %	25 %	50 %	25 %	397771736
32	NC_018225	CGGT	2	8	12661	12668	0 %	25 %	50 %	25 %	397771736
33	NC_018225	GACG	2	8	15011	15018	25 %	0 %	50 %	25 %	397771737
34	NC_018225	GGCG	2	8	15102	15109	0 %	0 %	75 %	25 %	397771737
35	NC_018225	CGAA	2	8	15127	15134	50 %	0 %	25 %	25 %	397771737
36	NC_018225	GAAC	2	8	15211	15218	50 %	0 %	25 %	25 %	397771737
37	NC_018225	ACCA	2	8	16173	16180	50 %	0 %	0 %	50 %	397771738
38	NC_018225	ACGA	2	8	16203	16210	50 %	0 %	25 %	25 %	397771738
39	NC_018225	GCCG	2	8	16328	16335	0 %	0 %	50 %	50 %	397771738
40	NC_018225	CGAC	2	8	16717	16724	25 %	0 %	25 %	50 %	397771738
41	NC_018225	GCAG	2	8	17304	17311	25 %	0 %	50 %	25 %	397771740
42	NC_018225	CGAG	2	8	18277	18284	25 %	0 %	50 %	25 %	397771741
43	NC_018225	GCTC	2	8	18810	18817	0 %	25 %	25 %	50 %	397771742
44	NC_018225	AGGT	2	8	20540	20547	25 %	25 %	50 %	0 %	397771742
45	NC_018225	CCCA	2	8	21120	21127	25 %	0 %	0 %	75 %	397771742
46	NC_018225	CATA	2	8	21151	21158	50 %	25 %	0 %	25 %	397771742
47	NC_018225	CGAC	2	8	21546	21553	25 %	0 %	25 %	50 %	397771742
48	NC_018225	CCAA	2	8	21593	21600	50 %	0 %	0 %	50 %	397771742
49	NC_018225	CAGC	2	8	22246	22253	25 %	0 %	25 %	50 %	397771742
50	NC_018225	GCAA	2	8	23721	23728	50 %	0 %	25 %	25 %	397771743
51	NC_018225	GCTC	2	8	23870	23877	0 %	25 %	25 %	50 %	397771743
52	NC_018225	GTGA	2	8	24956	24963	25 %	25 %	50 %	0 %	397771745
53	NC_018225	AAGC	2	8	26451	26458	50 %	0 %	25 %	25 %	397771747
54	NC_018225	CGGG	2	8	26529	26536	0 %	0 %	75 %	25 %	397771747
55	NC_018225	CTCC	2	8	27116	27123	0 %	25 %	0 %	75 %	397771747
56	NC_018225	TGTT	2	8	27385	27392	0 %	75 %	25 %	0 %	397771747
57	NC_018225	CGAG	2	8	27808	27815	25 %	0 %	50 %	25 %	397771748
58	NC_018225	CCGA	2	8	28127	28134	25 %	0 %	25 %	50 %	397771748
59	NC_018225	GCCA	2	8	28297	28304	25 %	0 %	25 %	50 %	397771749
60	NC_018225	GATG	2	8	28550	28557	25 %	25 %	50 %	0 %	397771749
61	NC_018225	TCGA	2	8	28663	28670	25 %	25 %	25 %	25 %	397771749
62	NC_018225	CCGG	2	8	29313	29320	0 %	0 %	50 %	50 %	397771749
63	NC_018225	GCCC	2	8	29927	29934	0 %	0 %	25 %	75 %	397771750
64	NC_018225	CCAC	2	8	30423	30430	25 %	0 %	0 %	75 %	397771751
65	NC_018225	CGAC	2	8	30519	30526	25 %	0 %	25 %	50 %	397771751
66	NC_018225	GCTC	2	8	33029	33036	0 %	25 %	25 %	50 %	397771752
67	NC_018225	CGAC	2	8	33084	33091	25 %	0 %	25 %	50 %	397771752
68	NC_018225	CCGG	2	8	33267	33274	0 %	0 %	50 %	50 %	397771752
69	NC_018225	GCTC	2	8	33381	33388	0 %	25 %	25 %	50 %	397771752
70	NC_018225	CGAG	2	8	33868	33875	25 %	0 %	50 %	25 %	397771752
71	NC_018225	TTGC	2	8	34220	34227	0 %	50 %	25 %	25 %	397771753
72	NC_018225	TTGC	2	8	34368	34375	0 %	50 %	25 %	25 %	397771753
73	NC_018225	AATC	2	8	34380	34387	50 %	25 %	0 %	25 %	397771753
74	NC_018225	CACC	2	8	34582	34589	25 %	0 %	0 %	75 %	397771753
75	NC_018225	GTTT	2	8	34872	34879	0 %	75 %	25 %	0 %	397771753
76	NC_018225	CCAC	2	8	34947	34954	25 %	0 %	0 %	75 %	397771753
77	NC_018225	ATAG	2	8	34978	34985	50 %	25 %	25 %	0 %	397771753
78	NC_018225	CTCC	2	8	35109	35116	0 %	25 %	0 %	75 %	397771753
79	NC_018225	GTCA	2	8	35635	35642	25 %	25 %	25 %	25 %	397771753
80	NC_018225	TCAC	2	8	35978	35985	25 %	25 %	0 %	50 %	397771753
81	NC_018225	ATGA	2	8	36074	36081	50 %	25 %	25 %	0 %	397771753
82	NC_018225	CCTG	2	8	36122	36129	0 %	25 %	25 %	50 %	397771753
83	NC_018225	AAAG	2	8	36395	36402	75 %	0 %	25 %	0 %	397771753
84	NC_018225	CATT	2	8	36554	36561	25 %	50 %	0 %	25 %	397771753
85	NC_018225	TCCA	2	8	37154	37161	25 %	25 %	0 %	50 %	397771754
86	NC_018225	CCAT	2	8	37234	37241	25 %	25 %	0 %	50 %	397771754
87	NC_018225	CCAG	2	8	37648	37655	25 %	0 %	25 %	50 %	397771755
88	NC_018225	CCGA	2	8	38063	38070	25 %	0 %	25 %	50 %	397771755
89	NC_018225	GCGA	2	8	38280	38287	25 %	0 %	50 %	25 %	397771755
90	NC_018225	CGGG	2	8	38343	38350	0 %	0 %	75 %	25 %	397771755
91	NC_018225	TAGA	2	8	38389	38396	50 %	25 %	25 %	0 %	397771755
92	NC_018225	TCGG	2	8	38515	38522	0 %	25 %	50 %	25 %	397771756
93	NC_018225	ATGA	2	8	38589	38596	50 %	25 %	25 %	0 %	397771756
94	NC_018225	TCGA	2	8	39126	39133	25 %	25 %	25 %	25 %	397771757
95	NC_018225	CGAC	2	8	39349	39356	25 %	0 %	25 %	50 %	397771757
96	NC_018225	TTCC	2	8	41369	41376	0 %	50 %	0 %	50 %	397771759
97	NC_018225	CGAG	2	8	42531	42538	25 %	0 %	50 %	25 %	397771760
98	NC_018225	GTCG	2	8	42725	42732	0 %	25 %	50 %	25 %	397771760
99	NC_018225	GCCG	2	8	42961	42968	0 %	0 %	50 %	50 %	397771760
100	NC_018225	TCGT	2	8	43889	43896	0 %	50 %	25 %	25 %	397771762
101	NC_018225	CGTT	2	8	44289	44296	0 %	50 %	25 %	25 %	397771762
102	NC_018225	AGTC	2	8	44521	44528	25 %	25 %	25 %	25 %	397771762
103	NC_018225	CGTC	2	8	44530	44537	0 %	25 %	25 %	50 %	397771762
104	NC_018225	TCGG	2	8	44852	44859	0 %	25 %	50 %	25 %	397771762
105	NC_018225	GTTA	2	8	46157	46164	25 %	50 %	25 %	0 %	397771763
106	NC_018225	TCCG	2	8	46232	46239	0 %	25 %	25 %	50 %	397771763
107	NC_018225	GCGA	2	8	46945	46952	25 %	0 %	50 %	25 %	397771763
108	NC_018225	CCGG	2	8	47590	47597	0 %	0 %	50 %	50 %	397771763
109	NC_018225	CGTC	2	8	47718	47725	0 %	25 %	25 %	50 %	397771763
110	NC_018225	GCTC	2	8	47922	47929	0 %	25 %	25 %	50 %	397771763
111	NC_018225	CCAC	2	8	48575	48582	25 %	0 %	0 %	75 %	397771764
112	NC_018225	GATT	2	8	50849	50856	25 %	50 %	25 %	0 %	397771765
113	NC_018225	CTGT	2	8	50992	50999	0 %	50 %	25 %	25 %	397771765
114	NC_018225	CCTC	2	8	52054	52061	0 %	25 %	0 %	75 %	397771766
115	NC_018225	ACGA	2	8	52204	52211	50 %	0 %	25 %	25 %	397771766
116	NC_018225	CGCT	2	8	52290	52297	0 %	25 %	25 %	50 %	397771766
117	NC_018225	GGCC	2	8	52452	52459	0 %	0 %	50 %	50 %	397771766
118	NC_018225	TCCA	2	8	52540	52547	25 %	25 %	0 %	50 %	397771766
119	NC_018225	GCGT	2	8	55358	55365	0 %	25 %	50 %	25 %	397771767
120	NC_018225	TGGA	2	8	55426	55433	25 %	25 %	50 %	0 %	397771767
121	NC_018225	GCCG	2	8	55616	55623	0 %	0 %	50 %	50 %	397771767
122	NC_018225	GATC	2	8	55694	55701	25 %	25 %	25 %	25 %	397771767
123	NC_018225	GCTG	2	8	55707	55714	0 %	25 %	50 %	25 %	397771767
124	NC_018225	GCGA	2	8	55972	55979	25 %	0 %	50 %	25 %	397771767
125	NC_018225	AAGG	2	8	56466	56473	50 %	0 %	50 %	0 %	397771767
126	NC_018225	CGGC	2	8	56789	56796	0 %	0 %	50 %	50 %	397771767
127	NC_018225	CGTT	2	8	60591	60598	0 %	50 %	25 %	25 %	397771768
128	NC_018225	TGTC	2	8	60795	60802	0 %	50 %	25 %	25 %	397771768
129	NC_018225	CAAA	2	8	60956	60963	75 %	0 %	0 %	25 %	397771768
130	NC_018225	TATG	2	8	61397	61404	25 %	50 %	25 %	0 %	397771768
131	NC_018225	TCCC	2	8	61640	61647	0 %	25 %	0 %	75 %	397771768
132	NC_018225	GAAT	2	8	61861	61868	50 %	25 %	25 %	0 %	397771768
133	NC_018225	AGTC	2	8	62143	62150	25 %	25 %	25 %	25 %	397771768
134	NC_018225	GAAT	2	8	62264	62271	50 %	25 %	25 %	0 %	397771768
135	NC_018225	GTCG	2	8	62510	62517	0 %	25 %	50 %	25 %	397771768
136	NC_018225	CAGG	2	8	62784	62791	25 %	0 %	50 %	25 %	397771768
137	NC_018225	GTAC	2	8	62861	62868	25 %	25 %	25 %	25 %	397771768
138	NC_018225	CGAG	2	8	62992	62999	25 %	0 %	50 %	25 %	397771768
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.