MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	CGG	2	6	20	25	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018225	AGC	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018225	GTC	2	6	6497	6502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018225	ATT	2	6	6525	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018225	TCG	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018225	TTC	2	6	6580	6585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018225	GCC	2	6	6663	6668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018225	ACC	2	6	7268	7273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018225	TTG	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018225	ATA	2	6	7410	7415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018225	GAT	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018225	ATC	2	6	7563	7568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018225	GTC	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018225	CCT	2	6	7613	7618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018225	AAT	2	6	7740	7745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018225	TCC	2	6	7750	7755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018225	TTC	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018225	GAT	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018225	AGT	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018225	TCC	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018225	CTT	2	6	8285	8290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018225	ATA	2	6	8418	8423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018225	TCA	2	6	8692	8697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018225	AGT	2	6	8800	8805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018225	AGG	2	6	9415	9420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018225	AAC	2	6	10125	10130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018225	CCG	2	6	11296	11301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018225	GAC	2	6	11340	11345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018225	GGC	2	6	11349	11354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018225	CGC	2	6	11445	11450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018225	GCC	2	6	11452	11457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018225	GCG	2	6	11576	11581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018225	GCT	2	6	11584	11589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018225	GTC	2	6	11744	11749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018225	GTA	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018225	GCG	2	6	12689	12694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018225	CGC	2	6	12733	12738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018225	AGG	3	9	12861	12869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018225	GAA	2	6	12872	12877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018225	GTT	2	6	13007	13012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018225	GAG	2	6	13079	13084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018225	GGA	2	6	13090	13095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018225	TGA	3	9	13165	13173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018225	CCA	3	9	13280	13288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018225	CAG	2	6	13571	13576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018225	GCC	2	6	13685	13690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018225	TCC	2	6	13714	13719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018225	CGA	2	6	13803	13808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018225	CTG	2	6	13815	13820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018225	CGA	2	6	13824	13829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018225	CAG	2	6	13961	13966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018225	CTA	2	6	13999	14004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018225	TGA	2	6	14046	14051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018225	TGC	2	6	14087	14092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018225	TCA	2	6	14096	14101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018225	TTC	2	6	14287	14292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018225	ACC	2	6	14308	14313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018225	CTT	2	6	14341	14346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018225	CAG	2	6	14391	14396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018225	TAC	2	6	14398	14403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018225	CCA	2	6	14495	14500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018225	GTT	2	6	14534	14539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018225	GCG	2	6	14576	14581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018225	GCA	2	6	14669	14674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018225	TCT	2	6	14773	14778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018225	CCA	2	6	14802	14807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018225	AGG	2	6	17182	17187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018225	GTT	2	6	17630	17635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018225	CTC	2	6	18385	18390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018225	AAT	2	6	18405	18410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018225	GGT	2	6	18433	18438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018225	AGA	2	6	23494	23499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018225	CCG	2	6	23999	24004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018225	GAG	2	6	24009	24014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018225	GGT	2	6	24999	25004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018225	TCT	2	6	25444	25449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018225	ACA	2	6	25545	25550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018225	AGT	2	6	25646	25651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018225	GCA	2	6	27515	27520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018225	CCA	2	6	30698	30703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018225	CAG	2	6	30706	30711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018225	CCA	2	6	30726	30731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018225	TCG	2	6	30809	30814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018225	TCG	2	6	30824	30829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018225	TCC	3	9	30860	30868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018225	TCG	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018225	AGA	2	6	30983	30988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018225	AGC	2	6	30995	31000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018225	GCC	2	6	31120	31125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018225	CAT	2	6	31126	31131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018225	GAG	2	6	31156	31161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018225	GGA	2	6	31185	31190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018225	GTA	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018225	TCT	2	6	31223	31228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018225	GTC	2	6	31249	31254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018225	AAT	2	6	31300	31305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018225	CTT	2	6	31350	31355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018225	ATG	2	6	31429	31434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018225	GTC	2	6	31504	31509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018225	TGA	2	6	31515	31520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018225	TGC	2	6	31541	31546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018225	GTT	2	6	31577	31582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018225	GCC	2	6	31849	31854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_018225	ATG	2	6	31870	31875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018225	TTC	2	6	31888	31893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018225	ATC	2	6	31918	31923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018225	CTC	2	6	32047	32052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018225	CGT	2	6	32066	32071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018225	TCC	2	6	32111	32116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018225	TGA	2	6	32214	32219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018225	TCA	2	6	32243	32248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018225	CAG	2	6	32253	32258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018225	AGC	2	6	32341	32346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018225	CTC	2	6	32536	32541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018225	GCT	2	6	32559	32564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018225	CAG	2	6	32664	32669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018225	AAC	2	6	32685	32690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018225	ACC	2	6	32697	32702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018225	GTT	2	6	32716	32721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018225	TCG	2	6	32767	32772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018225	TGC	2	6	32794	32799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018225	CGG	2	6	33969	33974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018225	AAG	2	6	37541	37546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018225	TGA	2	6	38931	38936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018225	GCG	2	6	39478	39483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018225	TTG	2	6	40505	40510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018225	CCG	2	6	40527	40532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018225	ACT	2	6	41393	41398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018225	TCG	2	6	41473	41478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018225	CGG	2	6	41495	41500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018225	TTC	2	6	41505	41510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018225	TCG	2	6	41524	41529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018225	GGA	2	6	41537	41542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018225	GTA	2	6	41556	41561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018225	CTC	2	6	41616	41621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018225	GAC	2	6	41703	41708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018225	GTC	3	9	41754	41762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018225	CTG	2	6	41892	41897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018225	TCG	2	6	41923	41928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018225	TCG	2	6	41942	41947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.