MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 1355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	TCG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
2	NC_018225	ACC	2	6	189	194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
3	NC_018225	GAC	2	6	229	234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
4	NC_018225	TTC	2	6	244	249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771727
5	NC_018225	TCG	2	6	386	391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
6	NC_018225	GGC	2	6	407	412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
7	NC_018225	TCG	2	6	449	454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
8	NC_018225	CGT	2	6	495	500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
9	NC_018225	CGG	2	6	504	509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
10	NC_018225	ATC	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
11	NC_018225	GCC	2	6	573	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
12	NC_018225	GAC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
13	NC_018225	CGA	2	6	607	612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
14	NC_018225	CGA	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
15	NC_018225	CGC	2	6	680	685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
16	NC_018225	GGT	2	6	695	700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771727
17	NC_018225	GTC	2	6	859	864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
18	NC_018225	GCG	2	6	870	875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
19	NC_018225	TCG	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
20	NC_018225	TTC	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771727
21	NC_018225	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771727
22	NC_018225	TCG	2	6	950	955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
23	NC_018225	GAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
24	NC_018225	GAC	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
25	NC_018225	GAA	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771727
26	NC_018225	CGA	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
27	NC_018225	ACG	2	6	1112	1117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
28	NC_018225	CTC	2	6	1141	1146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
29	NC_018225	GAA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771727
30	NC_018225	CCT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
31	NC_018225	GAC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
32	NC_018225	CAG	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
33	NC_018225	CAG	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
34	NC_018225	CGA	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
35	NC_018225	CCG	2	6	1525	1530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
36	NC_018225	TGG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771727
37	NC_018225	CAT	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
38	NC_018225	ACG	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
39	NC_018225	TGG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771727
40	NC_018225	CGT	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
41	NC_018225	TCG	2	6	1643	1648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
42	NC_018225	CGA	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
43	NC_018225	GGA	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
44	NC_018225	TCC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
45	NC_018225	GAT	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771727
46	NC_018225	TCG	2	6	1886	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
47	NC_018225	CGA	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
48	NC_018225	GAC	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
49	NC_018225	CGC	3	9	1974	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
50	NC_018225	ACC	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
51	NC_018225	CGG	2	6	2146	2151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
52	NC_018225	ACG	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
53	NC_018225	CCA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
54	NC_018225	GCT	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
55	NC_018225	TCA	2	6	2375	2380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
56	NC_018225	GAG	2	6	2383	2388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
57	NC_018225	CGA	2	6	2405	2410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
58	NC_018225	AGC	2	6	2423	2428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
59	NC_018225	ACG	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
60	NC_018225	AAC	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771727
61	NC_018225	GCG	2	6	2648	2653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
62	NC_018225	GCC	3	9	2697	2705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
63	NC_018225	GGA	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
64	NC_018225	GTA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771727
65	NC_018225	TCA	2	6	2960	2965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
66	NC_018225	CGA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
67	NC_018225	CGA	2	6	3192	3197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
68	NC_018225	TGA	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771727
69	NC_018225	CCT	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
70	NC_018225	GAG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
71	NC_018225	TAC	2	6	3361	3366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
72	NC_018225	CGC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
73	NC_018225	CCT	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
74	NC_018225	CAG	3	9	3487	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
75	NC_018225	TAC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
76	NC_018225	CAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771727
77	NC_018225	CGA	2	6	3633	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
78	NC_018225	CAA	2	6	3684	3689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771727
79	NC_018225	GAG	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
80	NC_018225	CGA	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
81	NC_018225	CAG	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
82	NC_018225	ACC	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
83	NC_018225	AGG	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
84	NC_018225	GAG	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771728
85	NC_018225	CTA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771728
86	NC_018225	TCA	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771728
87	NC_018225	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771728
88	NC_018225	CGG	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771728
89	NC_018225	TAC	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771728
90	NC_018225	CGA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
91	NC_018225	GAC	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
92	NC_018225	CTC	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771728
93	NC_018225	CGC	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771728
94	NC_018225	GCT	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771728
95	NC_018225	GAG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771728
96	NC_018225	CCT	2	6	4520	4525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771728
97	NC_018225	ACG	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
98	NC_018225	CCT	3	9	4580	4588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771728
99	NC_018225	CGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771728
100	NC_018225	CCG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771728
101	NC_018225	CGA	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
102	NC_018225	CGA	3	9	4768	4776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
103	NC_018225	CGT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771729
104	NC_018225	CGG	2	6	4923	4928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771729
105	NC_018225	GAG	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771729
106	NC_018225	TCG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771729
107	NC_018225	CAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771729
108	NC_018225	CAG	2	6	5147	5152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
109	NC_018225	GGC	2	6	5275	5280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771729
110	NC_018225	GAG	2	6	5342	5347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771729
111	NC_018225	ACA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771729
112	NC_018225	AAG	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771729
113	NC_018225	CGA	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
114	NC_018225	TCC	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771729
115	NC_018225	GAC	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
116	NC_018225	ACG	2	6	5691	5696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
117	NC_018225	GGA	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771729
118	NC_018225	GAA	2	6	5929	5934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771729
119	NC_018225	CAG	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
120	NC_018225	CGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
121	NC_018225	TCG	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771729
122	NC_018225	TCT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771729
123	NC_018225	CGG	2	6	6109	6114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771729
124	NC_018225	ACG	2	6	6144	6149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
125	NC_018225	ACG	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771730
126	NC_018225	CGA	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771730
127	NC_018225	GGT	3	9	6901	6909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771730
128	NC_018225	TCG	2	6	6960	6965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771730
129	NC_018225	CGA	3	9	7042	7050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771730
130	NC_018225	CGA	2	6	7081	7086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771730
131	NC_018225	ACC	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771730
132	NC_018225	CGA	2	6	7132	7137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771730
133	NC_018225	CGA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771730
134	NC_018225	CGG	2	6	7173	7178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771730
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153	NC_018225	CGA	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771732
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250	NC_018225	CGA	2	6	18027	18032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771741
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252	NC_018225	CGT	2	6	18202	18207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771741
253	NC_018225	CGA	3	9	18243	18251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771741
254	NC_018225	GCT	2	6	18301	18306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771741
255	NC_018225	AGA	2	6	18357	18362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771741
256	NC_018225	CTC	2	6	18508	18513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771742
257	NC_018225	CAA	2	6	18531	18536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771742
258	NC_018225	CGC	2	6	18660	18665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771742
259	NC_018225	GCC	2	6	18762	18767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771742
260	NC_018225	CCA	2	6	18828	18833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771742
261	NC_018225	CTC	2	6	18877	18882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771742
262	NC_018225	GTC	2	6	18910	18915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771742
263	NC_018225	CTC	2	6	18985	18990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771742
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265	NC_018225	ACT	2	6	19105	19110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771742
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268	NC_018225	CCG	2	6	19638	19643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771742
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273	NC_018225	TCG	2	6	19853	19858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771742
274	NC_018225	ATC	2	6	19895	19900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771742
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277	NC_018225	CGC	2	6	20155	20160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771742
278	NC_018225	ATA	2	6	20176	20181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397771742
279	NC_018225	CGA	2	6	20285	20290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771742
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281	NC_018225	GTT	2	6	20566	20571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771742
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499	NC_018225	GAC	2	6	35521	35526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771753
500	NC_018225	CTC	2	6	35665	35670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771753

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