MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	CT	3	6	1604	1609	0 %	50 %	0 %	50 %	397771727
2	NC_018225	TG	3	6	1667	1672	0 %	50 %	50 %	0 %	397771727
3	NC_018225	GA	3	6	2687	2692	50 %	0 %	50 %	0 %	397771727
4	NC_018225	GA	3	6	3437	3442	50 %	0 %	50 %	0 %	397771727
5	NC_018225	TG	3	6	5021	5026	0 %	50 %	50 %	0 %	397771729
6	NC_018225	GA	3	6	6426	6431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018225	CT	3	6	6671	6676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018225	GT	3	6	6746	6751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018225	CA	3	6	6970	6975	50 %	0 %	0 %	50 %	397771730
10	NC_018225	CA	3	6	7153	7158	50 %	0 %	0 %	50 %	397771730
11	NC_018225	GA	3	6	7532	7537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018225	AG	3	6	7548	7553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018225	CT	3	6	7834	7839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018225	AG	3	6	8705	8710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018225	AC	3	6	8979	8984	50 %	0 %	0 %	50 %	397771731
16	NC_018225	GC	3	6	9427	9432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018225	GC	3	6	9441	9446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018225	CG	3	6	10040	10045	0 %	0 %	50 %	50 %	397771733
19	NC_018225	GC	3	6	11304	11309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018225	GT	3	6	11419	11424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018225	GC	3	6	11635	11640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018225	GC	3	6	11668	11673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018225	GC	3	6	11718	11723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018225	GC	3	6	11789	11794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018225	GA	3	6	12195	12200	50 %	0 %	50 %	0 %	397771736
26	NC_018225	TC	3	6	12477	12482	0 %	50 %	0 %	50 %	397771736
27	NC_018225	GC	4	8	12776	12783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018225	GA	4	8	14200	14207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018225	GT	3	6	14295	14300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018225	AT	3	6	14335	14340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018225	CG	3	6	15244	15249	0 %	0 %	50 %	50 %	397771737
32	NC_018225	TC	3	6	15869	15874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018225	GC	3	6	16377	16382	0 %	0 %	50 %	50 %	397771738
34	NC_018225	GT	3	6	16794	16799	0 %	50 %	50 %	0 %	397771738
35	NC_018225	GA	4	8	17062	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	397771739
36	NC_018225	GA	3	6	17081	17086	50 %	0 %	50 %	0 %	397771739
37	NC_018225	GC	3	6	18120	18125	0 %	0 %	50 %	50 %	397771741
38	NC_018225	GC	3	6	18524	18529	0 %	0 %	50 %	50 %	397771742
39	NC_018225	CT	4	8	19408	19415	0 %	50 %	0 %	50 %	397771742
40	NC_018225	AG	3	6	19697	19702	50 %	0 %	50 %	0 %	397771742
41	NC_018225	AG	3	6	20170	20175	50 %	0 %	50 %	0 %	397771742
42	NC_018225	GA	3	6	22432	22437	50 %	0 %	50 %	0 %	397771742
43	NC_018225	TG	3	6	23114	23119	0 %	50 %	50 %	0 %	397771742
44	NC_018225	AC	4	8	23638	23645	50 %	0 %	0 %	50 %	397771743
45	NC_018225	CG	3	6	24434	24439	0 %	0 %	50 %	50 %	397771744
46	NC_018225	GA	3	6	25534	25539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018225	TA	4	8	27355	27362	50 %	50 %	0 %	0 %	397771747
48	NC_018225	AG	3	6	27417	27422	50 %	0 %	50 %	0 %	397771747
49	NC_018225	GA	3	6	29572	29577	50 %	0 %	50 %	0 %	397771749
50	NC_018225	GA	3	6	29672	29677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018225	AT	3	6	29722	29727	50 %	50 %	0 %	0 %	397771750
52	NC_018225	TC	3	6	30169	30174	0 %	50 %	0 %	50 %	397771750
53	NC_018225	GC	3	6	30197	30202	0 %	0 %	50 %	50 %	397771750
54	NC_018225	AG	3	6	30356	30361	50 %	0 %	50 %	0 %	397771750
55	NC_018225	GC	3	6	31562	31567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018225	GT	3	6	32229	32234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018225	TC	3	6	34401	34406	0 %	50 %	0 %	50 %	397771753
58	NC_018225	GA	3	6	34751	34756	50 %	0 %	50 %	0 %	397771753
59	NC_018225	CT	3	6	35751	35756	0 %	50 %	0 %	50 %	397771753
60	NC_018225	CT	4	8	36049	36056	0 %	50 %	0 %	50 %	397771753
61	NC_018225	AT	3	6	36059	36064	50 %	50 %	0 %	0 %	397771753
62	NC_018225	GA	4	8	36315	36322	50 %	0 %	50 %	0 %	397771753
63	NC_018225	AT	3	6	36377	36382	50 %	50 %	0 %	0 %	397771753
64	NC_018225	AG	3	6	36727	36732	50 %	0 %	50 %	0 %	397771754
65	NC_018225	TG	3	6	37166	37171	0 %	50 %	50 %	0 %	397771754
66	NC_018225	AG	3	6	37446	37451	50 %	0 %	50 %	0 %	397771754
67	NC_018225	GT	3	6	38235	38240	0 %	50 %	50 %	0 %	397771755
68	NC_018225	TC	3	6	38495	38500	0 %	50 %	0 %	50 %	397771756
69	NC_018225	TC	3	6	39972	39977	0 %	50 %	0 %	50 %	397771758
70	NC_018225	GA	3	6	41446	41451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018225	GT	3	6	42427	42432	0 %	50 %	50 %	0 %	397771760
72	NC_018225	GA	4	8	43018	43025	50 %	0 %	50 %	0 %	397771760
73	NC_018225	GA	3	6	43625	43630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018225	GA	3	6	43952	43957	50 %	0 %	50 %	0 %	397771762
75	NC_018225	GA	3	6	44178	44183	50 %	0 %	50 %	0 %	397771762
76	NC_018225	AT	3	6	44392	44397	50 %	50 %	0 %	0 %	397771762
77	NC_018225	CG	3	6	44569	44574	0 %	0 %	50 %	50 %	397771762
78	NC_018225	GC	3	6	44590	44595	0 %	0 %	50 %	50 %	397771762
79	NC_018225	AC	3	6	44620	44625	50 %	0 %	0 %	50 %	397771762
80	NC_018225	CT	3	6	45194	45199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018225	GA	3	6	45281	45286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018225	GA	3	6	45379	45384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018225	CA	3	6	45652	45657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018225	TC	3	6	45998	46003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018225	GT	3	6	46073	46078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018225	GT	3	6	47785	47790	0 %	50 %	50 %	0 %	397771763
87	NC_018225	GC	3	6	48031	48036	0 %	0 %	50 %	50 %	397771763
88	NC_018225	CG	3	6	49267	49272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018225	GT	3	6	49803	49808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018225	TC	4	8	49853	49860	0 %	50 %	0 %	50 %	397771765
91	NC_018225	CT	3	6	50841	50846	0 %	50 %	0 %	50 %	397771765
92	NC_018225	TC	3	6	51034	51039	0 %	50 %	0 %	50 %	397771765
93	NC_018225	AC	3	6	51346	51351	50 %	0 %	0 %	50 %	397771765
94	NC_018225	TG	3	6	51913	51918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018225	TG	3	6	52076	52081	0 %	50 %	50 %	0 %	397771766
96	NC_018225	AC	3	6	52157	52162	50 %	0 %	0 %	50 %	397771766
97	NC_018225	AG	3	6	55147	55152	50 %	0 %	50 %	0 %	397771767
98	NC_018225	CT	3	6	55303	55308	0 %	50 %	0 %	50 %	397771767
99	NC_018225	CG	3	6	55553	55558	0 %	0 %	50 %	50 %	397771767
100	NC_018225	AG	3	6	56046	56051	50 %	0 %	50 %	0 %	397771767
101	NC_018225	TG	3	6	56621	56626	0 %	50 %	50 %	0 %	397771767
102	NC_018225	GC	3	6	56889	56894	0 %	0 %	50 %	50 %	397771767
103	NC_018225	TG	3	6	59273	59278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018225	TC	3	6	60696	60701	0 %	50 %	0 %	50 %	397771768
105	NC_018225	AG	4	8	60714	60721	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
106	NC_018225	CG	3	6	60850	60855	0 %	0 %	50 %	50 %	397771768
107	NC_018225	AG	3	6	60970	60975	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
108	NC_018225	GA	3	6	62929	62934	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
109	NC_018225	GA	4	8	63696	63703	50 %	0 %	50 %	0 %	397771768
110	NC_018225	CA	3	6	63745	63750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018225	CT	3	6	63981	63986	0 %	50 %	0 %	50 %	397771769
112	NC_018225	TC	3	6	64097	64102	0 %	50 %	0 %	50 %	397771769
113	NC_018225	AG	3	6	64814	64819	50 %	0 %	50 %	0 %	397771770
114	NC_018225	CA	3	6	64927	64932	50 %	0 %	0 %	50 %	397771770
115	NC_018225	GC	3	6	66075	66080	0 %	0 %	50 %	50 %	397771770
116	NC_018225	CT	3	6	68154	68159	0 %	50 %	0 %	50 %	397771770
117	NC_018225	AG	3	6	69070	69075	50 %	0 %	50 %	0 %	397771772
118	NC_018225	GA	3	6	70310	70315	50 %	0 %	50 %	0 %	397771772
119	NC_018225	TC	3	6	72930	72935	0 %	50 %	0 %	50 %	397771773
120	NC_018225	GA	3	6	73391	73396	50 %	0 %	50 %	0 %	397771773
121	NC_018225	CT	3	6	73818	73823	0 %	50 %	0 %	50 %	397771774
122	NC_018225	GA	3	6	74106	74111	50 %	0 %	50 %	0 %	397771774
123	NC_018225	CT	4	8	74151	74158	0 %	50 %	0 %	50 %	397771774
124	NC_018225	GA	3	6	74342	74347	50 %	0 %	50 %	0 %	397771774
125	NC_018225	GC	3	6	78123	78128	0 %	0 %	50 %	50 %	397771775
126	NC_018225	GC	3	6	78454	78459	0 %	0 %	50 %	50 %	397771775
127	NC_018225	GC	3	6	78626	78631	0 %	0 %	50 %	50 %	397771775
128	NC_018225	CA	3	6	79490	79495	50 %	0 %	0 %	50 %	397771775
129	NC_018225	TC	3	6	80180	80185	0 %	50 %	0 %	50 %	397771775
130	NC_018225	GA	3	6	80634	80639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018225	CT	3	6	81174	81179	0 %	50 %	0 %	50 %	397771776
132	NC_018225	GA	3	6	81194	81199	50 %	0 %	50 %	0 %	397771776
133	NC_018225	CT	3	6	81282	81287	0 %	50 %	0 %	50 %	397771776
134	NC_018225	CT	3	6	81813	81818	0 %	50 %	0 %	50 %	397771777
135	NC_018225	CT	3	6	84303	84308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018225	CA	3	6	84413	84418	50 %	0 %	0 %	50 %	397771780
137	NC_018225	TG	3	6	86592	86597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018225	TA	3	6	86620	86625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018225	AC	3	6	87636	87641	50 %	0 %	0 %	50 %	397771782
140	NC_018225	GC	3	6	88139	88144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018225	GC	3	6	90653	90658	0 %	0 %	50 %	50 %	397771786
142	NC_018225	AC	3	6	91895	91900	50 %	0 %	0 %	50 %	397771788
143	NC_018225	CT	3	6	92253	92258	0 %	50 %	0 %	50 %	397771788
144	NC_018225	GC	3	6	93140	93145	0 %	0 %	50 %	50 %	397771789
145	NC_018225	CA	3	6	94070	94075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018225	TC	3	6	94191	94196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018225	GC	3	6	94353	94358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018225	GC	3	6	94484	94489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018225	CG	3	6	94722	94727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.