MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 3069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018224	TCGGT	2	10	296	305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018224	GCACA	2	10	1252	1261	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018224	ATACC	2	10	2676	2685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018224	TCTGC	2	10	2991	3000	0 %	40 %	20 %	40 %	397771792
5	NC_018224	TCGAG	2	10	4582	4591	20 %	20 %	40 %	20 %	397771794
6	NC_018224	GCCCT	2	10	4814	4823	0 %	20 %	20 %	60 %	397771794
7	NC_018224	CGATC	2	10	7674	7683	20 %	20 %	20 %	40 %	397771796
8	NC_018224	CCGTC	2	10	8700	8709	0 %	20 %	20 %	60 %	397771796
9	NC_018224	TCGGA	2	10	9504	9513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018224	GGTCC	2	10	10711	10720	0 %	20 %	40 %	40 %	397771797
11	NC_018224	CCGGT	2	10	10898	10907	0 %	20 %	40 %	40 %	397771797
12	NC_018224	TCGTC	2	10	11400	11409	0 %	40 %	20 %	40 %	397771797
13	NC_018224	CGATC	2	10	13847	13856	20 %	20 %	20 %	40 %	397771800
14	NC_018224	TGTTC	2	10	14427	14436	0 %	60 %	20 %	20 %	397771801
15	NC_018224	GACCG	2	10	14530	14539	20 %	0 %	40 %	40 %	397771801
16	NC_018224	GTCCC	2	10	16091	16100	0 %	20 %	20 %	60 %	397771803
17	NC_018224	GCGTT	2	10	16298	16307	0 %	40 %	40 %	20 %	397771803
18	NC_018224	TCGGA	2	10	16876	16885	20 %	20 %	40 %	20 %	397771803
19	NC_018224	TCGTT	2	10	17281	17290	0 %	60 %	20 %	20 %	397771803
20	NC_018224	GGCCG	2	10	17775	17784	0 %	0 %	60 %	40 %	397771803
21	NC_018224	CTCCG	2	10	18072	18081	0 %	20 %	20 %	60 %	397771803
22	NC_018224	TCGCG	2	10	18418	18427	0 %	20 %	40 %	40 %	397771803
23	NC_018224	CGAAC	2	10	18579	18588	40 %	0 %	20 %	40 %	397771803
24	NC_018224	GTCGG	2	10	18625	18634	0 %	20 %	60 %	20 %	397771803
25	NC_018224	GACGC	2	10	19577	19586	20 %	0 %	40 %	40 %	397771803
26	NC_018224	TCCGA	2	10	19687	19696	20 %	20 %	20 %	40 %	397771803
27	NC_018224	GGTCG	2	10	21286	21295	0 %	20 %	60 %	20 %	397771803
28	NC_018224	AGCGG	2	10	22754	22763	20 %	0 %	60 %	20 %	397771804
29	NC_018224	CGCTT	2	10	23456	23465	0 %	40 %	20 %	40 %	397771805
30	NC_018224	ACGGT	2	10	24603	24612	20 %	20 %	40 %	20 %	397771807
31	NC_018224	TCGGA	2	10	25493	25502	20 %	20 %	40 %	20 %	397771808
32	NC_018224	CGGAT	2	10	26212	26221	20 %	20 %	40 %	20 %	397771808
33	NC_018224	GCCGA	2	10	26702	26711	20 %	0 %	40 %	40 %	397771809
34	NC_018224	GACGG	2	10	27302	27311	20 %	0 %	60 %	20 %	397771809
35	NC_018224	GTGCA	2	10	28599	28608	20 %	20 %	40 %	20 %	397771809
36	NC_018224	TCACG	2	10	28984	28993	20 %	20 %	20 %	40 %	397771810
37	NC_018224	GTCGG	2	10	29486	29495	0 %	20 %	60 %	20 %	397771811
38	NC_018224	CGGTC	2	10	29868	29877	0 %	20 %	40 %	40 %	397771811
39	NC_018224	ACCGG	2	10	30227	30236	20 %	0 %	40 %	40 %	397771811
40	NC_018224	CGATG	2	10	30586	30595	20 %	20 %	40 %	20 %	397771812
41	NC_018224	GACCG	2	10	31819	31828	20 %	0 %	40 %	40 %	397771816
42	NC_018224	CGAAG	2	10	32539	32548	40 %	0 %	40 %	20 %	397771817
43	NC_018224	CCGGT	2	10	34318	34327	0 %	20 %	40 %	40 %	397771818
44	NC_018224	CCGTT	2	10	34547	34556	0 %	40 %	20 %	40 %	397771818
45	NC_018224	CGGTC	2	10	35171	35180	0 %	20 %	40 %	40 %	397771819
46	NC_018224	TCCCG	2	10	35352	35361	0 %	20 %	20 %	60 %	397771819
47	NC_018224	GGCGT	2	10	36514	36523	0 %	20 %	60 %	20 %	397771820
48	NC_018224	GACCG	2	10	36871	36880	20 %	0 %	40 %	40 %	397771820
49	NC_018224	TCGAC	2	10	36938	36947	20 %	20 %	20 %	40 %	397771820
50	NC_018224	TCGCT	2	10	38520	38529	0 %	40 %	20 %	40 %	397771821
51	NC_018224	GGGTC	2	10	39054	39063	0 %	20 %	60 %	20 %	397771822
52	NC_018224	CGACC	2	10	41117	41126	20 %	0 %	20 %	60 %	397771823
53	NC_018224	CCCGG	2	10	42255	42264	0 %	0 %	40 %	60 %	397771825
54	NC_018224	AGACG	2	10	43555	43564	40 %	0 %	40 %	20 %	397771826
55	NC_018224	TCGAC	2	10	43601	43610	20 %	20 %	20 %	40 %	397771826
56	NC_018224	ACTCG	2	10	48126	48135	20 %	20 %	20 %	40 %	397771828
57	NC_018224	ATCAC	2	10	48233	48242	40 %	20 %	0 %	40 %	397771828
58	NC_018224	ACTCG	2	10	50539	50548	20 %	20 %	20 %	40 %	397771831
59	NC_018224	CGAGA	2	10	50975	50984	40 %	0 %	40 %	20 %	397771831
60	NC_018224	TCGGC	2	10	51812	51821	0 %	20 %	40 %	40 %	397771831
61	NC_018224	ACGCG	2	10	51829	51838	20 %	0 %	40 %	40 %	397771831
62	NC_018224	ACGCG	2	10	51975	51984	20 %	0 %	40 %	40 %	397771831
63	NC_018224	GCGTC	2	10	52116	52125	0 %	20 %	40 %	40 %	397771831
64	NC_018224	ACAGC	2	10	53250	53259	40 %	0 %	20 %	40 %	397771832
65	NC_018224	TCGGG	2	10	53279	53288	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018224	CGAGG	2	10	53866	53875	20 %	0 %	60 %	20 %	397771833
67	NC_018224	CGGAC	2	10	54830	54839	20 %	0 %	40 %	40 %	397771834
68	NC_018224	GCGAT	2	10	55513	55522	20 %	20 %	40 %	20 %	397771835
69	NC_018224	TCGGC	2	10	55999	56008	0 %	20 %	40 %	40 %	397771836
70	NC_018224	CACGA	2	10	59294	59303	40 %	0 %	20 %	40 %	397771841
71	NC_018224	AGCGC	2	10	59755	59764	20 %	0 %	40 %	40 %	397771843
72	NC_018224	ACGGG	2	10	60336	60345	20 %	0 %	60 %	20 %	397771844
73	NC_018224	GACCG	2	10	63281	63290	20 %	0 %	40 %	40 %	397771846
74	NC_018224	GAGCG	2	10	65674	65683	20 %	0 %	60 %	20 %	397771848
75	NC_018224	AGCCG	2	10	65916	65925	20 %	0 %	40 %	40 %	397771848
76	NC_018224	GCGAC	2	10	66093	66102	20 %	0 %	40 %	40 %	397771848
77	NC_018224	CGGCG	2	10	66330	66339	0 %	0 %	60 %	40 %	397771848
78	NC_018224	GCGGT	2	10	67235	67244	0 %	20 %	60 %	20 %	397771850
79	NC_018224	ACCGG	2	10	68597	68606	20 %	0 %	40 %	40 %	397771851
80	NC_018224	CCACG	2	10	68825	68834	20 %	0 %	20 %	60 %	397771851
81	NC_018224	CCGAC	2	10	69332	69341	20 %	0 %	20 %	60 %	397771851
82	NC_018224	CGAGA	2	10	73279	73288	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018224	TCCCG	2	10	73357	73366	0 %	20 %	20 %	60 %	397771853
84	NC_018224	GAAAC	2	10	73757	73766	60 %	0 %	20 %	20 %	397771854
85	NC_018224	ACGCG	2	10	75001	75010	20 %	0 %	40 %	40 %	397771855
86	NC_018224	CGAGC	2	10	77488	77497	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018224	TGTCC	2	10	77534	77543	0 %	40 %	20 %	40 %	397771859
88	NC_018224	CCGGG	2	10	77720	77729	0 %	0 %	60 %	40 %	397771859
89	NC_018224	CAGTC	2	10	78028	78037	20 %	20 %	20 %	40 %	397771859
90	NC_018224	AAGCG	2	10	80325	80334	40 %	0 %	40 %	20 %	397771862
91	NC_018224	GCTCG	2	10	80670	80679	0 %	20 %	40 %	40 %	397771862
92	NC_018224	TCCCG	2	10	82451	82460	0 %	20 %	20 %	60 %	397771864
93	NC_018224	GAGCG	2	10	82866	82875	20 %	0 %	60 %	20 %	397771864
94	NC_018224	ACCAC	2	10	87738	87747	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_018224	TCGAA	2	10	90225	90234	40 %	20 %	20 %	20 %	397771869
96	NC_018224	CCGCG	2	10	90391	90400	0 %	0 %	40 %	60 %	397771869
97	NC_018224	CCGTC	2	10	90786	90795	0 %	20 %	20 %	60 %	397771869
98	NC_018224	TTAAT	2	10	93872	93881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018224	CCGTC	2	10	97654	97663	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_018224	AGCGA	2	10	97729	97738	40 %	0 %	40 %	20 %	397771877
101	NC_018224	CGCGA	2	10	97763	97772	20 %	0 %	40 %	40 %	397771877
102	NC_018224	CCGTC	2	10	97896	97905	0 %	20 %	20 %	60 %	397771878
103	NC_018224	GAGGG	2	10	99995	100004	20 %	0 %	80 %	0 %	397771881
104	NC_018224	TCGTC	2	10	100067	100076	0 %	40 %	20 %	40 %	397771881
105	NC_018224	CGTCG	2	10	100995	101004	0 %	20 %	40 %	40 %	397771882
106	NC_018224	CGTCC	2	10	102119	102128	0 %	20 %	20 %	60 %	397771882
107	NC_018224	TCCGA	2	10	102620	102629	20 %	20 %	20 %	40 %	397771883
108	NC_018224	GACGG	2	10	102723	102732	20 %	0 %	60 %	20 %	397771883
109	NC_018224	CGCGG	2	10	104372	104381	0 %	0 %	60 %	40 %	397771886
110	NC_018224	GACAG	2	10	107023	107032	40 %	0 %	40 %	20 %	397771891
111	NC_018224	TCGCC	2	10	107374	107383	0 %	20 %	20 %	60 %	397771891
112	NC_018224	CGGAC	2	10	107876	107885	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018224	GGGAC	2	10	110567	110576	20 %	0 %	60 %	20 %	397771894
114	NC_018224	GCGCT	2	10	112177	112186	0 %	20 %	40 %	40 %	397771895
115	NC_018224	TCGGC	2	10	113294	113303	0 %	20 %	40 %	40 %	397771896
116	NC_018224	CCGCG	2	10	113943	113952	0 %	0 %	40 %	60 %	397771896
117	NC_018224	GACCG	2	10	114604	114613	20 %	0 %	40 %	40 %	397771898
118	NC_018224	TGAGG	2	10	115656	115665	20 %	20 %	60 %	0 %	397771899
119	NC_018224	ACGGG	2	10	117029	117038	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018224	ATCGC	2	10	118070	118079	20 %	20 %	20 %	40 %	397771901
121	NC_018224	CGACA	2	10	118789	118798	40 %	0 %	20 %	40 %	397771901
122	NC_018224	GTTTC	2	10	120580	120589	0 %	60 %	20 %	20 %	397771902
123	NC_018224	CGGAC	2	10	122892	122901	20 %	0 %	40 %	40 %	397771904
124	NC_018224	GACCG	2	10	122995	123004	20 %	0 %	40 %	40 %	397771904
125	NC_018224	GTCGG	2	10	123220	123229	0 %	20 %	60 %	20 %	397771905
126	NC_018224	ACCGA	2	10	123892	123901	40 %	0 %	20 %	40 %	397771905
127	NC_018224	CCGAT	2	10	124685	124694	20 %	20 %	20 %	40 %	397771907
128	NC_018224	AACGG	2	10	125525	125534	40 %	0 %	40 %	20 %	397771909
129	NC_018224	GTCGC	2	10	127848	127857	0 %	20 %	40 %	40 %	397771911
130	NC_018224	TCGGC	2	10	127866	127875	0 %	20 %	40 %	40 %	397771911
131	NC_018224	GCGAC	2	10	128666	128675	20 %	0 %	40 %	40 %	397771912
132	NC_018224	GCCGA	2	10	128769	128778	20 %	0 %	40 %	40 %	397771912
133	NC_018224	CGACC	2	10	130086	130095	20 %	0 %	20 %	60 %	397771913
134	NC_018224	CGCGA	2	10	130170	130179	20 %	0 %	40 %	40 %	397771913
135	NC_018224	CGGCG	2	10	133322	133331	0 %	0 %	60 %	40 %	397771917
136	NC_018224	GCGAA	2	10	133546	133555	40 %	0 %	40 %	20 %	397771917
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253	NC_018224	CGGCC	2	10	271643	271652	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
254	NC_018224	GGCCG	2	10	273246	273255	0 %	0 %	60 %	40 %	397772067
255	NC_018224	CCGGA	2	10	275259	275268	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
256	NC_018224	ACAGT	2	10	275880	275889	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_018224	CACGA	2	10	277039	277048	40 %	0 %	20 %	40 %	397772071
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263	NC_018224	CCGGT	2	10	281026	281035	0 %	20 %	40 %	40 %	397772075
264	NC_018224	CACCG	2	10	281690	281699	20 %	0 %	20 %	60 %	397772075
265	NC_018224	GATGC	2	10	281770	281779	20 %	20 %	40 %	20 %	397772075
266	NC_018224	CGGAG	2	10	281828	281837	20 %	0 %	60 %	20 %	397772076
267	NC_018224	GCGTG	2	10	285788	285797	0 %	20 %	60 %	20 %	397772081
268	NC_018224	GTCAG	2	10	287957	287966	20 %	20 %	40 %	20 %	397772084
269	NC_018224	CTTCC	2	10	295692	295701	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
270	NC_018224	AGGCG	2	10	296963	296972	20 %	0 %	60 %	20 %	397772094
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275	NC_018224	CCACT	2	10	304007	304016	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
276	NC_018224	CAAGC	2	10	304104	304113	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
277	NC_018224	CCTCG	2	10	305256	305265	0 %	20 %	20 %	60 %	397772103
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335	NC_018224	TCGTC	2	10	366846	366855	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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381	NC_018224	CCGAT	2	10	412757	412766	20 %	20 %	20 %	40 %	397772227
382	NC_018224	CACGA	2	10	414370	414379	40 %	0 %	20 %	40 %	397772230
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387	NC_018224	GCGCG	2	10	426720	426729	0 %	0 %	60 %	40 %	397772241
388	NC_018224	CCCGA	2	10	428734	428743	20 %	0 %	20 %	60 %	397772243
389	NC_018224	TTCGA	2	10	430192	430201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
390	NC_018224	AAGCC	2	10	431627	431636	40 %	0 %	20 %	40 %	397772246
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392	NC_018224	GCTCG	2	10	432417	432426	0 %	20 %	40 %	40 %	397772248
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394	NC_018224	TTGTG	2	10	433674	433683	0 %	60 %	40 %	0 %	397772250
395	NC_018224	CCAGT	2	10	434088	434097	20 %	20 %	20 %	40 %	397772250
396	NC_018224	GATAG	2	10	434452	434461	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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