MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 63274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018224	TCG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771791
2	NC_018224	CGG	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771791
3	NC_018224	CCG	2	6	2311	2316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771791
4	NC_018224	CGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771791
5	NC_018224	ATC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771792
6	NC_018224	GAG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
7	NC_018224	GCT	2	6	3133	3138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771792
8	NC_018224	GAG	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
9	NC_018224	CCA	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771792
10	NC_018224	CGA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771792
11	NC_018224	GAG	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
12	NC_018224	CGG	2	6	3267	3272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771792
13	NC_018224	CCG	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771793
14	NC_018224	CGT	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771793
15	NC_018224	CAT	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771793
16	NC_018224	TCG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771793
17	NC_018224	TGT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771793
18	NC_018224	CGG	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
19	NC_018224	CGA	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
20	NC_018224	CGT	2	6	3955	3960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
21	NC_018224	CGA	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
22	NC_018224	GGT	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
23	NC_018224	TGG	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
24	NC_018224	TGC	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
25	NC_018224	TCG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
26	NC_018224	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
27	NC_018224	CGA	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
28	NC_018224	CGG	2	6	4423	4428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
29	NC_018224	TCG	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
30	NC_018224	CCG	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771794
31	NC_018224	GTT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771794
32	NC_018224	TCG	3	9	4560	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
33	NC_018224	CGA	3	9	4666	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
34	NC_018224	TCG	3	9	4731	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
35	NC_018224	CGA	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
36	NC_018224	CGC	2	6	4918	4923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771794
37	NC_018224	CGA	2	6	4936	4941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
38	NC_018224	CAT	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771794
39	NC_018224	CGG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
40	NC_018224	GGC	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
41	NC_018224	CGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
42	NC_018224	GTG	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
43	NC_018224	CGT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
44	NC_018224	CGT	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
45	NC_018224	TCG	3	9	5414	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
46	NC_018224	CGA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
47	NC_018224	GGA	2	6	5461	5466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771795
48	NC_018224	TCG	3	9	5492	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
49	NC_018224	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
50	NC_018224	GTC	4	12	5596	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
51	NC_018224	GAA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771795
52	NC_018224	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
53	NC_018224	GGT	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771795
54	NC_018224	TCG	3	9	5717	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
55	NC_018224	GCC	2	6	5728	5733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
56	NC_018224	CGT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
57	NC_018224	CCG	2	6	5869	5874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
58	NC_018224	TCG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
59	NC_018224	GTC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
60	NC_018224	GCG	2	6	6132	6137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
61	NC_018224	CGA	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
62	NC_018224	AAG	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771795
63	NC_018224	CGT	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
64	NC_018224	GTC	2	6	6233	6238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
65	NC_018224	GCC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
66	NC_018224	TCG	2	6	6459	6464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
67	NC_018224	GTC	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
68	NC_018224	CGC	2	6	6590	6595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
69	NC_018224	GTC	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
70	NC_018224	GCG	2	6	6698	6703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
71	NC_018224	GTC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
72	NC_018224	ACC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771795
73	NC_018224	CGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
74	NC_018224	GTC	2	6	6895	6900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
75	NC_018224	CGT	2	6	6903	6908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
76	NC_018224	CGT	2	6	6939	6944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
77	NC_018224	CCA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771795
78	NC_018224	GAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771795
79	NC_018224	GGC	2	6	7083	7088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
80	NC_018224	GCG	2	6	7158	7163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
81	NC_018224	GTC	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
82	NC_018224	TCG	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
83	NC_018224	CGG	2	6	7251	7256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
84	NC_018224	CGA	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
85	NC_018224	CGT	2	6	7371	7376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
86	NC_018224	CGT	2	6	7402	7407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
87	NC_018224	CTC	2	6	7423	7428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771795
88	NC_018224	TCG	4	12	7476	7487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
89	NC_018224	CGT	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
90	NC_018224	GTC	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
91	NC_018224	CGT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
92	NC_018224	GCC	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
93	NC_018224	CGA	2	6	7629	7634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
94	NC_018224	CAT	2	6	7731	7736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771796
95	NC_018224	CTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771796
96	NC_018224	CCG	2	6	7796	7801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
97	NC_018224	CAG	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
98	NC_018224	TGC	2	6	7904	7909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
99	NC_018224	GCG	2	6	7959	7964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
100	NC_018224	GAC	4	12	7972	7983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
101	NC_018224	CGA	2	6	8001	8006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
102	NC_018224	GCG	2	6	8045	8050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
103	NC_018224	GTC	2	6	8062	8067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
104	NC_018224	CGG	2	6	8093	8098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
105	NC_018224	CGT	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
106	NC_018224	GCC	2	6	8159	8164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
107	NC_018224	CGC	3	9	8265	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
108	NC_018224	CGA	2	6	8289	8294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
109	NC_018224	CGG	2	6	8304	8309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
110	NC_018224	GAG	2	6	8365	8370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771796
111	NC_018224	CGA	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
112	NC_018224	GGC	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
113	NC_018224	TCG	2	6	8534	8539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
114	NC_018224	GAC	2	6	8566	8571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
115	NC_018224	GCG	2	6	8595	8600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
116	NC_018224	GAC	2	6	8625	8630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
117	NC_018224	CGA	2	6	8650	8655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771796
118	NC_018224	CGG	2	6	8668	8673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
119	NC_018224	CGC	2	6	8688	8693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
120	NC_018224	CGT	3	9	8790	8798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
121	NC_018224	CGG	2	6	8804	8809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
122	NC_018224	AAC	2	6	8840	8845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771796
123	NC_018224	CGG	2	6	9162	9167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771796
124	NC_018224	GTC	2	6	9171	9176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
125	NC_018224	TCG	2	6	9278	9283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
126	NC_018224	TCG	2	6	9380	9385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
127	NC_018224	GTC	2	6	9439	9444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
128	NC_018224	CGT	2	6	9555	9560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
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252	NC_018224	ACT	2	6	16587	16592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771803
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495	NC_018224	GTC	2	6	32687	32692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771817
496	NC_018224	CGA	2	6	32788	32793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771817
497	NC_018224	GAC	2	6	32951	32956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771818
498	NC_018224	CGA	2	6	32992	32997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771818
499	NC_018224	GTC	2	6	33017	33022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771818
500	NC_018224	TCG	2	6	33063	33068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771818

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