MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pA

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018222	CTCA	2	8	78	85	25 %	25 %	0 %	50 %	397698493
2	NC_018222	CAAA	2	8	663	670	75 %	0 %	0 %	25 %	397698493
3	NC_018222	ATTT	2	8	1037	1044	25 %	75 %	0 %	0 %	397698493
4	NC_018222	TTTG	2	8	1467	1474	0 %	75 %	25 %	0 %	397698493
5	NC_018222	GTTT	2	8	1537	1544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018222	TGAT	2	8	1562	1569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018222	TATT	2	8	1596	1603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018222	TATT	2	8	1818	1825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018222	AAGT	2	8	1836	1843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018222	TTTA	2	8	2280	2287	25 %	75 %	0 %	0 %	397698494
11	NC_018222	GGTT	2	8	2443	2450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018222	AATG	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	397698495
13	NC_018222	AATC	2	8	2985	2992	50 %	25 %	0 %	25 %	397698495
14	NC_018222	GAAT	2	8	3538	3545	50 %	25 %	25 %	0 %	397698496
15	NC_018222	GTTT	2	8	3931	3938	0 %	75 %	25 %	0 %	397698496
16	NC_018222	TACC	2	8	4222	4229	25 %	25 %	0 %	50 %	397698496
17	NC_018222	ATCG	2	8	4370	4377	25 %	25 %	25 %	25 %	397698496
18	NC_018222	AGAA	2	8	4930	4937	75 %	0 %	25 %	0 %	397698496
19	NC_018222	AGAA	2	8	5061	5068	75 %	0 %	25 %	0 %	397698496
20	NC_018222	AGAA	2	8	5324	5331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018222	GTGA	2	8	5332	5339	25 %	25 %	50 %	0 %	397698497
22	NC_018222	ATAA	2	8	5702	5709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018222	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018222	TATT	2	8	5796	5803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018222	AACA	2	8	6104	6111	75 %	0 %	0 %	25 %	397698498
26	NC_018222	ATCT	2	8	6197	6204	25 %	50 %	0 %	25 %	397698498
27	NC_018222	AGAA	2	8	6846	6853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018222	GACA	2	8	7283	7290	50 %	0 %	25 %	25 %	397698499
29	NC_018222	TTGC	2	8	7530	7537	0 %	50 %	25 %	25 %	397698499
30	NC_018222	ACAA	2	8	7674	7681	75 %	0 %	0 %	25 %	397698499
31	NC_018222	TGAT	2	8	7705	7712	25 %	50 %	25 %	0 %	397698499
32	NC_018222	AGTA	2	8	7871	7878	50 %	25 %	25 %	0 %	397698499
33	NC_018222	TATG	2	8	7934	7941	25 %	50 %	25 %	0 %	397698499
34	NC_018222	AGAA	2	8	8081	8088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018222	ATTT	2	8	8495	8502	25 %	75 %	0 %	0 %	397698501
36	NC_018222	ACTA	2	8	8665	8672	50 %	25 %	0 %	25 %	397698502
37	NC_018222	GAAA	2	8	9307	9314	75 %	0 %	25 %	0 %	397698502
38	NC_018222	CTTA	2	8	10288	10295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018222	ACTC	2	8	10448	10455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018222	ATTT	2	8	10634	10641	25 %	75 %	0 %	0 %	397698504
41	NC_018222	GGAA	2	8	10859	10866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018222	GAAA	2	8	11077	11084	75 %	0 %	25 %	0 %	397698505
43	NC_018222	TAAT	2	8	11113	11120	50 %	50 %	0 %	0 %	397698505
44	NC_018222	CTAT	2	8	11137	11144	25 %	50 %	0 %	25 %	397698505
45	NC_018222	AATG	2	8	11596	11603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018222	CAAT	2	8	11794	11801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018222	ATAA	2	8	11955	11962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018222	ATCA	2	8	12446	12453	50 %	25 %	0 %	25 %	397698506
49	NC_018222	ACCA	2	8	12619	12626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018222	CAAA	2	8	12721	12728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018222	ATCA	2	8	12799	12806	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018222	TGAT	2	8	12814	12821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.