MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pA

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018222	TGT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
2	NC_018222	CTT	2	6	309	314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698493
3	NC_018222	AAG	2	6	341	346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
4	NC_018222	AAC	2	6	369	374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698493
5	NC_018222	CTA	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698493
6	NC_018222	AGC	2	6	495	500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
7	NC_018222	AAT	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
8	NC_018222	ATA	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
9	NC_018222	TTA	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698493
10	NC_018222	TAG	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698493
11	NC_018222	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
12	NC_018222	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
13	NC_018222	AAG	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
14	NC_018222	GGT	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
15	NC_018222	AGA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
16	NC_018222	CGA	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
17	NC_018222	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
18	NC_018222	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
19	NC_018222	TTG	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
20	NC_018222	GAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
21	NC_018222	GTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018222	AAT	2	6	1756	1761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018222	ATT	2	6	1778	1783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018222	TAA	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018222	ATT	2	6	1917	1922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018222	GTA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018222	ATA	2	6	2254	2259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018222	GGA	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018222	GTG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698494
30	NC_018222	CAA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698494
31	NC_018222	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698495
32	NC_018222	TGA	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698495
33	NC_018222	GTC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397698495
34	NC_018222	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698495
35	NC_018222	TTG	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
36	NC_018222	ATT	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
37	NC_018222	AAG	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
38	NC_018222	ACA	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
39	NC_018222	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698496
40	NC_018222	AGA	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
41	NC_018222	AGT	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
42	NC_018222	ATT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
43	NC_018222	TTA	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
44	NC_018222	GTA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
45	NC_018222	CAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
46	NC_018222	GAA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
47	NC_018222	AAG	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
48	NC_018222	ACA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
49	NC_018222	AGA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
50	NC_018222	ATT	2	6	4547	4552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
51	NC_018222	TGA	3	9	4583	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
52	NC_018222	AAG	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
53	NC_018222	TAT	2	6	4652	4657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
54	NC_018222	TTG	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
55	NC_018222	ATT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
56	NC_018222	TTA	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
57	NC_018222	AAG	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
58	NC_018222	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
59	NC_018222	GTT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
60	NC_018222	TTG	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018222	AAG	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698497
62	NC_018222	AAG	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018222	ATA	2	6	5894	5899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
64	NC_018222	ACG	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698498
65	NC_018222	TTG	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
66	NC_018222	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
67	NC_018222	TTG	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
68	NC_018222	AAG	2	6	6213	6218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698498
69	NC_018222	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
70	NC_018222	TCA	2	6	6466	6471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698498
71	NC_018222	TAT	2	6	6549	6554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
72	NC_018222	GGA	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397698498
73	NC_018222	AAT	2	6	6567	6572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
74	NC_018222	ATT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018222	TAC	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018222	AAG	2	6	6660	6665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018222	CAA	2	6	6767	6772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018222	GTT	2	6	6799	6804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018222	GAA	2	6	7173	7178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
80	NC_018222	ATT	2	6	7212	7217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698499
81	NC_018222	AAT	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
82	NC_018222	GGT	2	6	7239	7244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698499
83	NC_018222	CTT	2	6	7420	7425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698499
84	NC_018222	ATT	3	9	7575	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698499
85	NC_018222	AAT	2	6	7614	7619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
86	NC_018222	AGA	3	9	7661	7669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
87	NC_018222	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
88	NC_018222	AGA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
89	NC_018222	TAA	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
90	NC_018222	TGA	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018222	AAG	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018222	AAG	2	6	8247	8252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698500
93	NC_018222	AGA	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698500
94	NC_018222	AAG	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698501
95	NC_018222	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698501
96	NC_018222	GAA	2	6	8515	8520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698501
97	NC_018222	TGG	2	6	8713	8718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698502
98	NC_018222	GAA	2	6	8762	8767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698502
99	NC_018222	ACA	2	6	8809	8814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698502
100	NC_018222	GTA	2	6	8858	8863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698502
101	NC_018222	TTA	2	6	8904	8909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698502
102	NC_018222	AAC	2	6	8959	8964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698502
103	NC_018222	GAT	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698502
104	NC_018222	TTG	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698502
105	NC_018222	AAT	2	6	9410	9415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018222	GGA	2	6	9431	9436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018222	CTA	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698503
108	NC_018222	CAC	2	6	9574	9579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397698503
109	NC_018222	ATT	2	6	9702	9707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698503
110	NC_018222	GAA	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698503
111	NC_018222	ACA	2	6	9899	9904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698503
112	NC_018222	AAT	2	6	9929	9934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698503
113	NC_018222	GAA	2	6	9966	9971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698503
114	NC_018222	AAG	2	6	10056	10061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698503
115	NC_018222	ATC	2	6	10130	10135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018222	ATC	2	6	10211	10216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018222	TTC	2	6	10218	10223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018222	TCA	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018222	TTG	2	6	10300	10305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018222	TTG	2	6	10429	10434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018222	CTT	2	6	10568	10573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018222	ATT	2	6	10604	10609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018222	TTA	2	6	10611	10616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018222	TTA	2	6	10628	10633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018222	TCT	2	6	10742	10747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018222	ATG	2	6	10787	10792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018222	TTA	2	6	10819	10824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018222	AAT	2	6	11015	11020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698505
129	NC_018222	ATG	2	6	11062	11067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698505
130	NC_018222	TTA	2	6	11160	11165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698505
131	NC_018222	TAA	2	6	11180	11185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698505
132	NC_018222	TAT	2	6	11324	11329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698505
133	NC_018222	TCG	2	6	11727	11732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018222	GTG	2	6	11785	11790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018222	GTT	2	6	11809	11814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.