MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pA

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018222	TGT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
2	NC_018222	CTT	2	6	309	314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698493
3	NC_018222	AAG	2	6	341	346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
4	NC_018222	AAC	2	6	369	374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698493
5	NC_018222	CTA	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698493
6	NC_018222	AGC	2	6	495	500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
7	NC_018222	AAT	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
8	NC_018222	ATA	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
9	NC_018222	TTA	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698493
10	NC_018222	TAG	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698493
11	NC_018222	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
12	NC_018222	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
13	NC_018222	AAG	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
14	NC_018222	GGT	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
15	NC_018222	AGA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
16	NC_018222	CGA	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
17	NC_018222	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
18	NC_018222	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
19	NC_018222	TTG	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
20	NC_018222	GAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
21	NC_018222	GTG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698494
22	NC_018222	CAA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698494
23	NC_018222	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698495
24	NC_018222	TGA	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698495
25	NC_018222	GTC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397698495
26	NC_018222	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698495
27	NC_018222	TTG	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
28	NC_018222	ATT	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
29	NC_018222	AAG	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
30	NC_018222	ACA	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
31	NC_018222	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698496
32	NC_018222	AGA	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
33	NC_018222	AGT	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
34	NC_018222	ATT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
35	NC_018222	TTA	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
36	NC_018222	GTA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
37	NC_018222	CAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
38	NC_018222	GAA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
39	NC_018222	AAG	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
40	NC_018222	ACA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
41	NC_018222	AGA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
42	NC_018222	ATT	2	6	4547	4552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
43	NC_018222	TGA	3	9	4583	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
44	NC_018222	AAG	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
45	NC_018222	TAT	2	6	4652	4657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
46	NC_018222	TTG	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
47	NC_018222	ATT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
48	NC_018222	TTA	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
49	NC_018222	AAG	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
50	NC_018222	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
51	NC_018222	GTT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
52	NC_018222	AAG	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698497
53	NC_018222	ATA	2	6	5894	5899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
54	NC_018222	ACG	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698498
55	NC_018222	TTG	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
56	NC_018222	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
57	NC_018222	TTG	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
58	NC_018222	AAG	2	6	6213	6218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698498
59	NC_018222	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
60	NC_018222	TCA	2	6	6466	6471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698498
61	NC_018222	TAT	2	6	6549	6554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
62	NC_018222	GGA	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397698498
63	NC_018222	AAT	2	6	6567	6572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
64	NC_018222	GAA	2	6	7173	7178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
65	NC_018222	ATT	2	6	7212	7217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698499
66	NC_018222	AAT	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
67	NC_018222	GGT	2	6	7239	7244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698499
68	NC_018222	CTT	2	6	7420	7425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698499
69	NC_018222	ATT	3	9	7575	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698499
70	NC_018222	AAT	2	6	7614	7619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
71	NC_018222	AGA	3	9	7661	7669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
72	NC_018222	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
73	NC_018222	AGA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
74	NC_018222	TAA	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
75	NC_018222	AAG	2	6	8247	8252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698500
76	NC_018222	AGA	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698500
77	NC_018222	AAG	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698501
78	NC_018222	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698501
79	NC_018222	GAA	2	6	8515	8520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698501
80	NC_018222	TGG	2	6	8713	8718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698502
81	NC_018222	GAA	2	6	8762	8767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698502
82	NC_018222	ACA	2	6	8809	8814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698502
83	NC_018222	GTA	2	6	8858	8863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698502
84	NC_018222	TTA	2	6	8904	8909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698502
85	NC_018222	AAC	2	6	8959	8964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698502
86	NC_018222	GAT	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698502
87	NC_018222	TTG	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698502
88	NC_018222	CTA	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698503
89	NC_018222	CAC	2	6	9574	9579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397698503
90	NC_018222	ATT	2	6	9702	9707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698503
91	NC_018222	GAA	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698503
92	NC_018222	ACA	2	6	9899	9904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698503
93	NC_018222	AAT	2	6	9929	9934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698503
94	NC_018222	GAA	2	6	9966	9971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698503
95	NC_018222	AAG	2	6	10056	10061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698503
96	NC_018222	AAT	2	6	11015	11020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698505
97	NC_018222	ATG	2	6	11062	11067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698505
98	NC_018222	TTA	2	6	11160	11165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698505
99	NC_018222	TAA	2	6	11180	11185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698505
100	NC_018222	TAT	2	6	11324	11329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698505
101	NC_018222	GAA	2	6	12310	12315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698506
102	NC_018222	ATT	2	6	12335	12340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698506
103	NC_018222	GAA	2	6	12356	12361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698506
104	NC_018222	ACA	2	6	12376	12381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698506
105	NC_018222	TAG	2	6	12416	12421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698506
106	NC_018222	AAT	2	6	12488	12493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698506

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.