MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Mycoplasma haemolamae str. Purdue chromosome

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018219	TCAAT	2	10	1395	1404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018219	ACTAA	2	10	6438	6447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018219	AAATA	2	10	22479	22488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018219	AAAAT	2	10	46193	46202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018219	TAAGG	2	10	57441	57450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018219	TTACT	2	10	57569	57578	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018219	AAATT	2	10	73217	73226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018219	ATGAA	2	10	74174	74183	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018219	AAGGA	2	10	81854	81863	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018219	TTCTT	2	10	87557	87566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018219	TGCTT	2	10	93016	93025	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018219	AGGGA	2	10	115135	115144	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018219	CACAC	2	10	116961	116970	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_018219	TAAAT	2	10	131097	131106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018219	AAAGA	2	10	133219	133228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018219	TTCCT	2	10	145422	145431	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018219	GAAGA	2	10	199040	199049	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018219	AATTT	2	10	219490	219499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018219	AAGAA	2	10	219511	219520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018219	CTTAA	2	10	252581	252590	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018219	AACAG	2	10	253278	253287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018219	ATTTT	2	10	273815	273824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018219	ACTAA	2	10	290868	290877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018219	ACTAA	2	10	290951	290960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018219	TTTTG	2	10	293300	293309	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018219	TTACT	2	10	293320	293329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018219	TTCCT	2	10	311970	311979	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018219	ATCTA	2	10	319803	319812	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018219	TAAAA	2	10	329077	329086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018219	TAGAA	2	10	335874	335883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018219	AGTAA	2	10	337229	337238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018219	TAGAA	2	10	337289	337298	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018219	TAGAA	2	10	339351	339360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018219	ACGAA	2	10	366245	366254	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018219	TGTTT	2	10	375504	375513	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018219	GGAAG	2	10	376350	376359	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018219	ACTTA	2	10	379190	379199	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018219	GAATT	2	10	379273	379282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018219	TTCTT	2	10	380113	380122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018219	AAATT	2	10	393298	393307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018219	TTCTT	2	10	406170	406179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018219	TAAAG	2	10	409504	409513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018219	TGCAG	2	10	410417	410426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018219	CTAAC	2	10	410486	410495	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018219	TTAAC	2	10	411000	411009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018219	TAATC	2	10	417744	417753	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018219	AGTCC	2	10	439279	439288	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018219	TTCTA	2	10	441770	441779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018219	CAATA	2	10	442757	442766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018219	TTCTT	2	10	460135	460144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018219	ACTTG	2	10	462755	462764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018219	AAAAC	2	10	464867	464876	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018219	ACATC	2	10	467522	467531	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018219	AACTA	2	10	477582	477591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018219	AATTT	2	10	479642	479651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018219	CTTTA	2	10	484267	484276	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018219	AAATT	2	10	486377	486386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018219	AGTTA	2	10	496053	496062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018219	TTCTT	2	10	496596	496605	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018219	TTAGT	2	10	497929	497938	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018219	TTAAG	2	10	499898	499907	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018219	TCGTT	2	10	503147	503156	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018219	TTTAA	2	10	503162	503171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018219	TAAAT	2	10	505548	505557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018219	ACTTG	2	10	521055	521064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018219	GATTT	2	10	523099	523108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018219	GACTA	2	10	564385	564394	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018219	TTAAA	2	10	564450	564459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018219	AATAT	2	10	565689	565698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018219	CTCTT	2	10	570990	570999	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018219	TCTTT	2	10	572858	572867	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018219	ATCTT	2	10	577161	577170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018219	AAAAG	2	10	582163	582172	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018219	TTATT	2	10	594782	594791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018219	GGCTG	2	10	595039	595048	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018219	TTTTA	2	10	595230	595239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018219	CAGGT	2	10	598031	598040	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018219	CCTGA	2	10	603035	603044	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_018219	TTGAG	2	10	621963	621972	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018219	TCACA	2	10	624808	624817	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018219	CTTAT	2	10	636001	636010	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018219	TTCCC	2	10	654102	654111	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_018219	GAAAA	2	10	654441	654450	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018219	CTAAG	2	10	655271	655280	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018219	CTAGT	2	10	655362	655371	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018219	TTCTT	2	10	660190	660199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018219	TGCTA	2	10	668599	668608	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018219	GTTCT	2	10	676557	676566	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018219	TTTTA	2	10	677585	677594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018219	CCTAA	2	10	678885	678894	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018219	GCACT	2	10	680895	680904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018219	GCAAA	2	10	681613	681622	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018219	TCTGT	2	10	703975	703984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018219	TTAAA	2	10	717751	717760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018219	GACCT	2	10	755079	755088	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.