MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018197	TGC	2	6	24	29	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018197	CCG	2	6	43	48	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018197	CCA	2	6	346	351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356391
4	NC_018197	CAG	2	6	421	426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356391
5	NC_018197	GCA	2	6	447	452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356391
6	NC_018197	TCA	2	6	541	546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356391
7	NC_018197	TGG	2	6	547	552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356391
8	NC_018197	ATG	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356391
9	NC_018197	TCC	2	6	655	660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356391
10	NC_018197	GCT	2	6	690	695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356391
11	NC_018197	GTT	2	6	759	764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356391
12	NC_018197	CGC	2	6	765	770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356391
13	NC_018197	CTC	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356392
14	NC_018197	GAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356392
15	NC_018197	CGA	2	6	1065	1070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356392
16	NC_018197	GAG	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356392
17	NC_018197	ATG	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356392
18	NC_018197	TAG	2	6	1546	1551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018197	CAC	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018197	TGG	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018197	TGG	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018197	TCG	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018197	CGT	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018197	TGT	2	6	1677	1682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018197	GAC	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018197	TGG	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018197	CAT	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018197	GCG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356393
29	NC_018197	CGG	2	6	1899	1904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356393
30	NC_018197	GTC	3	9	1927	1935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356393
31	NC_018197	CGT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356393
32	NC_018197	CTT	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356394
33	NC_018197	CGC	2	6	2071	2076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356394
34	NC_018197	AAG	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356394
35	NC_018197	ACA	2	6	2211	2216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356394
36	NC_018197	TCA	3	9	2277	2285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356394
37	NC_018197	CGG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356394
38	NC_018197	CAT	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356394
39	NC_018197	GCA	3	9	2700	2708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356394
40	NC_018197	TGG	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356394
41	NC_018197	GAC	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356394
42	NC_018197	AGC	2	6	2923	2928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018197	CGC	2	6	2933	2938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018197	CGT	2	6	2986	2991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.