Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257
Total Repeats: 73
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_018196 | CCG | 2 | 6 | 771 | 776 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356382 |
2 | NC_018196 | CAT | 2 | 6 | 835 | 840 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356382 |
3 | NC_018196 | GGC | 2 | 6 | 904 | 909 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356382 |
4 | NC_018196 | ATC | 2 | 6 | 1055 | 1060 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356382 |
5 | NC_018196 | TCC | 2 | 6 | 1160 | 1165 | 0 % | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 398356382 |
6 | NC_018196 | TCA | 2 | 6 | 1176 | 1181 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356382 |
7 | NC_018196 | GCG | 2 | 6 | 1210 | 1215 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356382 |
8 | NC_018196 | GCA | 2 | 6 | 1269 | 1274 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
9 | NC_018196 | TCG | 2 | 6 | 1334 | 1339 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
10 | NC_018196 | TTG | 2 | 6 | 1352 | 1357 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 398356382 |
11 | NC_018196 | TTC | 2 | 6 | 1370 | 1375 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356382 |
12 | NC_018196 | TGA | 2 | 6 | 1398 | 1403 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356382 |
13 | NC_018196 | TGC | 2 | 6 | 1419 | 1424 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
14 | NC_018196 | GTT | 2 | 6 | 1429 | 1434 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 398356382 |
15 | NC_018196 | CCA | 2 | 6 | 1438 | 1443 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356382 |
16 | NC_018196 | TCG | 2 | 6 | 1578 | 1583 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
17 | NC_018196 | ACG | 3 | 9 | 1691 | 1699 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
18 | NC_018196 | GCG | 2 | 6 | 1715 | 1720 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356382 |
19 | NC_018196 | CCT | 2 | 6 | 1731 | 1736 | 0 % | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 398356382 |
20 | NC_018196 | CCG | 2 | 6 | 1803 | 1808 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356382 |
21 | NC_018196 | CGC | 2 | 6 | 1902 | 1907 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356382 |
22 | NC_018196 | CGG | 2 | 6 | 1944 | 1949 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356382 |
23 | NC_018196 | CGA | 2 | 6 | 1964 | 1969 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
24 | NC_018196 | GCC | 2 | 6 | 2038 | 2043 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356382 |
25 | NC_018196 | CAG | 2 | 6 | 2047 | 2052 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
26 | NC_018196 | GTG | 2 | 6 | 2072 | 2077 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356382 |
27 | NC_018196 | CGG | 2 | 6 | 2079 | 2084 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356382 |
28 | NC_018196 | ATC | 2 | 6 | 2093 | 2098 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356382 |
29 | NC_018196 | GCC | 2 | 6 | 2144 | 2149 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356382 |
30 | NC_018196 | CAG | 2 | 6 | 2161 | 2166 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356382 |
31 | NC_018196 | TCA | 2 | 6 | 2193 | 2198 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356382 |
32 | NC_018196 | GGT | 2 | 6 | 2220 | 2225 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 398356383 |
33 | NC_018196 | ACC | 2 | 6 | 2281 | 2286 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356383 |
34 | NC_018196 | TTG | 2 | 6 | 2305 | 2310 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 398356383 |
35 | NC_018196 | CAG | 2 | 6 | 2319 | 2324 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356383 |
36 | NC_018196 | CTT | 2 | 6 | 2461 | 2466 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356384 |
37 | NC_018196 | CGT | 2 | 6 | 2703 | 2708 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356385 |
38 | NC_018196 | CGT | 2 | 6 | 2744 | 2749 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356385 |
39 | NC_018196 | CGC | 2 | 6 | 2787 | 2792 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356385 |
40 | NC_018196 | AGG | 2 | 6 | 2807 | 2812 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 398356385 |
41 | NC_018196 | GTC | 2 | 6 | 3024 | 3029 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356386 |
42 | NC_018196 | CTG | 2 | 6 | 3056 | 3061 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356386 |
43 | NC_018196 | TCA | 2 | 6 | 3064 | 3069 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356386 |
44 | NC_018196 | CTG | 2 | 6 | 3078 | 3083 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356386 |
45 | NC_018196 | TGC | 2 | 6 | 3119 | 3124 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356386 |
46 | NC_018196 | TCG | 2 | 6 | 3160 | 3165 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356386 |
47 | NC_018196 | CGC | 2 | 6 | 3275 | 3280 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356386 |
48 | NC_018196 | TGA | 2 | 6 | 3289 | 3294 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356386 |
49 | NC_018196 | CTG | 2 | 6 | 3297 | 3302 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356386 |
50 | NC_018196 | GGC | 2 | 6 | 3314 | 3319 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356386 |
51 | NC_018196 | GAC | 2 | 6 | 3341 | 3346 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356386 |
52 | NC_018196 | CAA | 2 | 6 | 3365 | 3370 | 66.67 % | 0 % | 0 % | 33.33 % | 398356386 |
53 | NC_018196 | TGA | 2 | 6 | 3409 | 3414 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 398356386 |
54 | NC_018196 | CGG | 3 | 9 | 3436 | 3444 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356386 |
55 | NC_018196 | AAG | 2 | 6 | 3501 | 3506 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 398356386 |
56 | NC_018196 | CTG | 2 | 6 | 3533 | 3538 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356387 |
57 | NC_018196 | TCG | 2 | 6 | 3540 | 3545 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356387 |
58 | NC_018196 | TTG | 2 | 6 | 3570 | 3575 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 398356387 |
59 | NC_018196 | GGC | 2 | 6 | 3600 | 3605 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356387 |
60 | NC_018196 | GGC | 2 | 6 | 3637 | 3642 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356387 |
61 | NC_018196 | CGG | 2 | 6 | 3646 | 3651 | 0 % | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 398356387 |
62 | NC_018196 | TCT | 2 | 6 | 3709 | 3714 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 398356387 |
63 | NC_018196 | GCA | 3 | 9 | 3727 | 3735 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356387 |
64 | NC_018196 | CGA | 2 | 6 | 3778 | 3783 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356387 |
65 | NC_018196 | CCA | 2 | 6 | 3835 | 3840 | 33.33 % | 0 % | 0 % | 66.67 % | 398356387 |
66 | NC_018196 | TCG | 2 | 6 | 3966 | 3971 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356387 |
67 | NC_018196 | CGT | 2 | 6 | 4027 | 4032 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356387 |
68 | NC_018196 | CTG | 2 | 6 | 4181 | 4186 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356387 |
69 | NC_018196 | GCC | 2 | 6 | 4190 | 4195 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356387 |
70 | NC_018196 | ATC | 2 | 6 | 4243 | 4248 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 398356388 |
71 | NC_018196 | GCT | 2 | 6 | 4257 | 4262 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356388 |
72 | NC_018196 | ACG | 3 | 9 | 4328 | 4336 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356388 |
73 | NC_018196 | GCC | 2 | 6 | 4600 | 4605 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356389 |