MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018194	CGAA	2	8	1270	1277	50 %	0 %	25 %	25 %	398356371
2	NC_018194	CATC	2	8	1414	1421	25 %	25 %	0 %	50 %	398356371
3	NC_018194	AGCC	2	8	1444	1451	25 %	0 %	25 %	50 %	398356371
4	NC_018194	GATT	2	8	2120	2127	25 %	50 %	25 %	0 %	398356372
5	NC_018194	GCAC	2	8	2395	2402	25 %	0 %	25 %	50 %	398356372
6	NC_018194	TCCA	2	8	2502	2509	25 %	25 %	0 %	50 %	398356372
7	NC_018194	TTGA	2	8	2646	2653	25 %	50 %	25 %	0 %	398356372
8	NC_018194	CGTG	2	8	2693	2700	0 %	25 %	50 %	25 %	398356372
9	NC_018194	CCTG	2	8	2765	2772	0 %	25 %	25 %	50 %	398356372
10	NC_018194	TTGT	2	8	2875	2882	0 %	75 %	25 %	0 %	398356372
11	NC_018194	GGCC	2	8	2883	2890	0 %	0 %	50 %	50 %	398356372
12	NC_018194	AATT	2	8	3045	3052	50 %	50 %	0 %	0 %	398356372
13	NC_018194	CAGC	2	8	3169	3176	25 %	0 %	25 %	50 %	398356372
14	NC_018194	AGAT	2	8	3442	3449	50 %	25 %	25 %	0 %	398356372
15	NC_018194	TCCG	2	8	5324	5331	0 %	25 %	25 %	50 %	398356374
16	NC_018194	TGAC	2	8	6141	6148	25 %	25 %	25 %	25 %	398356375
17	NC_018194	GCCT	2	8	6771	6778	0 %	25 %	25 %	50 %	398356376
18	NC_018194	CGCA	2	8	7158	7165	25 %	0 %	25 %	50 %	398356376
19	NC_018194	AGCG	2	8	7504	7511	25 %	0 %	50 %	25 %	398356377
20	NC_018194	GCAG	2	8	7878	7885	25 %	0 %	50 %	25 %	398356377
21	NC_018194	TTCG	2	8	8149	8156	0 %	50 %	25 %	25 %	398356378
22	NC_018194	GCCA	2	8	8282	8289	25 %	0 %	25 %	50 %	398356378
23	NC_018194	GGTT	2	8	9489	9496	0 %	50 %	50 %	0 %	398356379
24	NC_018194	TGGT	2	8	9684	9691	0 %	50 %	50 %	0 %	398356379
25	NC_018194	CGAC	2	8	9843	9850	25 %	0 %	25 %	50 %	398356379
26	NC_018194	TGGA	2	8	9920	9927	25 %	25 %	50 %	0 %	398356380

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.