MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018193	GC	3	6	23	28	0 %	0 %	50 %	50 %	398356355
2	NC_018193	GC	3	6	734	739	0 %	0 %	50 %	50 %	398356355
3	NC_018193	GA	3	6	2124	2129	50 %	0 %	50 %	0 %	398356357
4	NC_018193	TC	3	6	2447	2452	0 %	50 %	0 %	50 %	398356357
5	NC_018193	CG	3	6	2640	2645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018193	GC	3	6	2764	2769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018193	CT	3	6	2984	2989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018193	AT	3	6	3568	3573	50 %	50 %	0 %	0 %	398356359
9	NC_018193	CT	3	6	3623	3628	0 %	50 %	0 %	50 %	398356359
10	NC_018193	AC	3	6	4472	4477	50 %	0 %	0 %	50 %	398356361
11	NC_018193	CG	3	6	4781	4786	0 %	0 %	50 %	50 %	398356361
12	NC_018193	CA	3	6	4829	4834	50 %	0 %	0 %	50 %	398356361
13	NC_018193	GC	3	6	5486	5491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018193	CG	3	6	5810	5815	0 %	0 %	50 %	50 %	398356362
15	NC_018193	GC	4	8	7191	7198	0 %	0 %	50 %	50 %	398356364
16	NC_018193	CG	3	6	7236	7241	0 %	0 %	50 %	50 %	398356364
17	NC_018193	CG	3	6	7423	7428	0 %	0 %	50 %	50 %	398356364
18	NC_018193	CG	3	6	8465	8470	0 %	0 %	50 %	50 %	398356365
19	NC_018193	CT	3	6	9327	9332	0 %	50 %	0 %	50 %	398356366
20	NC_018193	GT	3	6	9456	9461	0 %	50 %	50 %	0 %	398356366
21	NC_018193	GC	3	6	9823	9828	0 %	0 %	50 %	50 %	398356367
22	NC_018193	CG	3	6	10322	10327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.