MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018192	GCCGGC	2	12	5374	5385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018192	ACCGCG	2	12	5468	5479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018192	CGGAAC	2	12	6982	6993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018192	ATCGCC	2	12	7053	7064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018192	GACGAG	2	12	8760	8771	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018192	CATCTC	2	12	10817	10828	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	398356327
7	NC_018192	CGCGTG	2	12	11050	11061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	398356327
8	NC_018192	TCGTAC	2	12	13255	13266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398356329
9	NC_018192	ATTTGT	2	12	14490	14501	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018192	CCGTGG	2	12	15237	15248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	398356330
11	NC_018192	GATCGT	2	12	16870	16881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	398356333
12	NC_018192	AGATCG	2	12	20534	20545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	398356336
13	NC_018192	GCTTGG	2	12	22316	22327	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	398356339
14	NC_018192	CGCCAA	2	12	22838	22849	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	398356339
15	NC_018192	GCAAGG	2	12	23457	23468	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	398356340
16	NC_018192	CATCGT	2	12	24977	24988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398356343
17	NC_018192	CAGCGG	2	12	25317	25328	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	398356343
18	NC_018192	TTGCCA	2	12	27166	27177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398356346
19	NC_018192	GATGGT	2	12	28106	28117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	398356348

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.