MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018192	CAGCG	2	10	173	182	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018192	ATCCA	2	10	734	743	40 %	20 %	0 %	40 %	398356315
3	NC_018192	CGGGT	2	10	1234	1243	0 %	20 %	60 %	20 %	398356316
4	NC_018192	GGCGC	2	10	2287	2296	0 %	0 %	60 %	40 %	398356317
5	NC_018192	GCCCA	2	10	7683	7692	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_018192	GCCCG	2	10	8178	8187	0 %	0 %	40 %	60 %	398356323
7	NC_018192	GCCAT	2	10	11211	11220	20 %	20 %	20 %	40 %	398356327
8	NC_018192	GACGC	2	10	14606	14615	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018192	CCGCC	2	10	15289	15298	0 %	0 %	20 %	80 %	398356330
10	NC_018192	CCTCG	2	10	15375	15384	0 %	20 %	20 %	60 %	398356331
11	NC_018192	AGGGG	2	10	16683	16692	20 %	0 %	80 %	0 %	398356332
12	NC_018192	GCCGG	2	10	17133	17142	0 %	0 %	60 %	40 %	398356334
13	NC_018192	CAGCG	2	10	17875	17884	20 %	0 %	40 %	40 %	398356335
14	NC_018192	ATCCA	2	10	18436	18445	40 %	20 %	0 %	40 %	398356335
15	NC_018192	GAGGG	2	10	18879	18888	20 %	0 %	80 %	0 %	398356336
16	NC_018192	ATCCG	2	10	18953	18962	20 %	20 %	20 %	40 %	398356336
17	NC_018192	GGCTT	2	10	21774	21783	0 %	40 %	40 %	20 %	398356339
18	NC_018192	CGGCG	2	10	22718	22727	0 %	0 %	60 %	40 %	398356339
19	NC_018192	CAATC	2	10	23545	23554	40 %	20 %	0 %	40 %	398356340
20	NC_018192	GATCT	2	10	26199	26208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018192	GGAAA	2	10	26889	26898	60 %	0 %	40 %	0 %	398356345
22	NC_018192	CCGGA	2	10	27329	27338	20 %	0 %	40 %	40 %	398356347
23	NC_018192	TGATT	2	10	27536	27545	20 %	60 %	20 %	0 %	398356348
24	NC_018192	AGGCA	2	10	27616	27625	40 %	0 %	40 %	20 %	398356348
25	NC_018192	CCGAC	2	10	30008	30017	20 %	0 %	20 %	60 %	398356353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.