MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018192	TC	3	6	1374	1379	0 %	50 %	0 %	50 %	398356316
2	NC_018192	GC	3	6	1476	1481	0 %	0 %	50 %	50 %	398356316
3	NC_018192	GC	4	8	1684	1691	0 %	0 %	50 %	50 %	398356316
4	NC_018192	GC	4	8	2123	2130	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
5	NC_018192	CG	3	6	2580	2585	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
6	NC_018192	GC	3	6	2779	2784	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
7	NC_018192	GC	3	6	2909	2914	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
8	NC_018192	CG	3	6	3084	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
9	NC_018192	CG	3	6	3772	3777	0 %	0 %	50 %	50 %	398356318
10	NC_018192	CG	3	6	4059	4064	0 %	0 %	50 %	50 %	398356318
11	NC_018192	CT	3	6	4658	4663	0 %	50 %	0 %	50 %	398356319
12	NC_018192	CG	3	6	4831	4836	0 %	0 %	50 %	50 %	398356319
13	NC_018192	CG	5	10	5200	5209	0 %	0 %	50 %	50 %	398356319
14	NC_018192	TC	3	6	5266	5271	0 %	50 %	0 %	50 %	398356319
15	NC_018192	GC	3	6	5434	5439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018192	CG	3	6	5833	5838	0 %	0 %	50 %	50 %	398356320
17	NC_018192	GC	3	6	6136	6141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018192	CA	3	6	6243	6248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018192	CG	4	8	6451	6458	0 %	0 %	50 %	50 %	398356321
20	NC_018192	GC	3	6	6726	6731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018192	CG	3	6	6783	6788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018192	CG	3	6	6799	6804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018192	CG	3	6	7623	7628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018192	GC	3	6	7894	7899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018192	CG	3	6	7989	7994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018192	GC	3	6	8253	8258	0 %	0 %	50 %	50 %	398356324
27	NC_018192	CG	3	6	8533	8538	0 %	0 %	50 %	50 %	398356325
28	NC_018192	CG	4	8	8659	8666	0 %	0 %	50 %	50 %	398356325
29	NC_018192	GC	3	6	9204	9209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018192	CG	3	6	10309	10314	0 %	0 %	50 %	50 %	398356327
31	NC_018192	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	398356327
32	NC_018192	AG	3	6	11321	11326	50 %	0 %	50 %	0 %	398356327
33	NC_018192	AT	3	6	11424	11429	50 %	50 %	0 %	0 %	398356327
34	NC_018192	GA	3	6	11603	11608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018192	GC	4	8	12187	12194	0 %	0 %	50 %	50 %	398356328
36	NC_018192	CG	3	6	12768	12773	0 %	0 %	50 %	50 %	398356329
37	NC_018192	GC	4	8	13184	13191	0 %	0 %	50 %	50 %	398356329
38	NC_018192	GA	3	6	13727	13732	50 %	0 %	50 %	0 %	398356329
39	NC_018192	AT	3	6	14225	14230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018192	AG	3	6	14262	14267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018192	GC	3	6	14788	14793	0 %	0 %	50 %	50 %	398356330
42	NC_018192	GC	3	6	15865	15870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018192	CG	3	6	16545	16550	0 %	0 %	50 %	50 %	398356332
44	NC_018192	GC	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018192	CG	3	6	17501	17506	0 %	0 %	50 %	50 %	398356335
46	NC_018192	CG	3	6	18614	18619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018192	CG	4	8	18648	18655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018192	CG	3	6	18863	18868	0 %	0 %	50 %	50 %	398356336
49	NC_018192	AC	3	6	19346	19351	50 %	0 %	0 %	50 %	398356336
50	NC_018192	CA	3	6	19687	19692	50 %	0 %	0 %	50 %	398356336
51	NC_018192	GC	3	6	19799	19804	0 %	0 %	50 %	50 %	398356336
52	NC_018192	CG	3	6	20495	20500	0 %	0 %	50 %	50 %	398356336
53	NC_018192	CG	4	8	22055	22062	0 %	0 %	50 %	50 %	398356339
54	NC_018192	CG	3	6	22972	22977	0 %	0 %	50 %	50 %	398356340
55	NC_018192	GC	3	6	23200	23205	0 %	0 %	50 %	50 %	398356340
56	NC_018192	AT	3	6	23269	23274	50 %	50 %	0 %	0 %	398356340
57	NC_018192	GC	3	6	24185	24190	0 %	0 %	50 %	50 %	398356341
58	NC_018192	GC	3	6	24644	24649	0 %	0 %	50 %	50 %	398356342
59	NC_018192	CG	3	6	24774	24779	0 %	0 %	50 %	50 %	398356342
60	NC_018192	CG	4	8	25239	25246	0 %	0 %	50 %	50 %	398356343
61	NC_018192	GC	3	6	25272	25277	0 %	0 %	50 %	50 %	398356343
62	NC_018192	GC	3	6	26228	26233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018192	TG	3	6	26396	26401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018192	GA	3	6	26480	26485	50 %	0 %	50 %	0 %	398356345
65	NC_018192	GC	3	6	27358	27363	0 %	0 %	50 %	50 %	398356347
66	NC_018192	GC	3	6	27468	27473	0 %	0 %	50 %	50 %	398356347
67	NC_018192	GT	3	6	27717	27722	0 %	50 %	50 %	0 %	398356348
68	NC_018192	CT	3	6	28807	28812	0 %	50 %	0 %	50 %	398356351
69	NC_018192	CG	3	6	29103	29108	0 %	0 %	50 %	50 %	398356352
70	NC_018192	GC	3	6	29327	29332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018192	TG	3	6	29738	29743	0 %	50 %	50 %	0 %	398356353
72	NC_018192	GT	3	6	30184	30189	0 %	50 %	50 %	0 %	398356353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.