MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018192	TC	3	6	1374	1379	0 %	50 %	0 %	50 %	398356316
2	NC_018192	GC	3	6	1476	1481	0 %	0 %	50 %	50 %	398356316
3	NC_018192	GC	4	8	1684	1691	0 %	0 %	50 %	50 %	398356316
4	NC_018192	GC	4	8	2123	2130	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
5	NC_018192	CG	3	6	2580	2585	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
6	NC_018192	GC	3	6	2779	2784	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
7	NC_018192	GC	3	6	2909	2914	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
8	NC_018192	CG	3	6	3084	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	398356317
9	NC_018192	CG	3	6	3772	3777	0 %	0 %	50 %	50 %	398356318
10	NC_018192	CG	3	6	4059	4064	0 %	0 %	50 %	50 %	398356318
11	NC_018192	CT	3	6	4658	4663	0 %	50 %	0 %	50 %	398356319
12	NC_018192	CG	3	6	4831	4836	0 %	0 %	50 %	50 %	398356319
13	NC_018192	CG	5	10	5200	5209	0 %	0 %	50 %	50 %	398356319
14	NC_018192	TC	3	6	5266	5271	0 %	50 %	0 %	50 %	398356319
15	NC_018192	CG	3	6	5833	5838	0 %	0 %	50 %	50 %	398356320
16	NC_018192	CG	4	8	6451	6458	0 %	0 %	50 %	50 %	398356321
17	NC_018192	GC	3	6	8253	8258	0 %	0 %	50 %	50 %	398356324
18	NC_018192	CG	3	6	8533	8538	0 %	0 %	50 %	50 %	398356325
19	NC_018192	CG	4	8	8659	8666	0 %	0 %	50 %	50 %	398356325
20	NC_018192	CG	3	6	10309	10314	0 %	0 %	50 %	50 %	398356327
21	NC_018192	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	398356327
22	NC_018192	AG	3	6	11321	11326	50 %	0 %	50 %	0 %	398356327
23	NC_018192	AT	3	6	11424	11429	50 %	50 %	0 %	0 %	398356327
24	NC_018192	GC	4	8	12187	12194	0 %	0 %	50 %	50 %	398356328
25	NC_018192	CG	3	6	12768	12773	0 %	0 %	50 %	50 %	398356329
26	NC_018192	GC	4	8	13184	13191	0 %	0 %	50 %	50 %	398356329
27	NC_018192	GA	3	6	13727	13732	50 %	0 %	50 %	0 %	398356329
28	NC_018192	GC	3	6	14788	14793	0 %	0 %	50 %	50 %	398356330
29	NC_018192	CG	3	6	16545	16550	0 %	0 %	50 %	50 %	398356332
30	NC_018192	CG	3	6	17501	17506	0 %	0 %	50 %	50 %	398356335
31	NC_018192	CG	3	6	18863	18868	0 %	0 %	50 %	50 %	398356336
32	NC_018192	AC	3	6	19346	19351	50 %	0 %	0 %	50 %	398356336
33	NC_018192	CA	3	6	19687	19692	50 %	0 %	0 %	50 %	398356336
34	NC_018192	GC	3	6	19799	19804	0 %	0 %	50 %	50 %	398356336
35	NC_018192	CG	3	6	20495	20500	0 %	0 %	50 %	50 %	398356336
36	NC_018192	CG	4	8	22055	22062	0 %	0 %	50 %	50 %	398356339
37	NC_018192	CG	3	6	22972	22977	0 %	0 %	50 %	50 %	398356340
38	NC_018192	GC	3	6	23200	23205	0 %	0 %	50 %	50 %	398356340
39	NC_018192	AT	3	6	23269	23274	50 %	50 %	0 %	0 %	398356340
40	NC_018192	GC	3	6	24185	24190	0 %	0 %	50 %	50 %	398356341
41	NC_018192	GC	3	6	24644	24649	0 %	0 %	50 %	50 %	398356342
42	NC_018192	CG	3	6	24774	24779	0 %	0 %	50 %	50 %	398356342
43	NC_018192	CG	4	8	25239	25246	0 %	0 %	50 %	50 %	398356343
44	NC_018192	GC	3	6	25272	25277	0 %	0 %	50 %	50 %	398356343
45	NC_018192	GA	3	6	26480	26485	50 %	0 %	50 %	0 %	398356345
46	NC_018192	GC	3	6	27358	27363	0 %	0 %	50 %	50 %	398356347
47	NC_018192	GC	3	6	27468	27473	0 %	0 %	50 %	50 %	398356347
48	NC_018192	GT	3	6	27717	27722	0 %	50 %	50 %	0 %	398356348
49	NC_018192	CT	3	6	28807	28812	0 %	50 %	0 %	50 %	398356351
50	NC_018192	CG	3	6	29103	29108	0 %	0 %	50 %	50 %	398356352
51	NC_018192	TG	3	6	29738	29743	0 %	50 %	50 %	0 %	398356353
52	NC_018192	GT	3	6	30184	30189	0 %	50 %	50 %	0 %	398356353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.