Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257
Total Repeats: 80
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_018191 | CTCGAA | 2 | 12 | 783 | 794 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356094 |
2 | NC_018191 | TTGTCG | 2 | 12 | 4325 | 4336 | 0 % | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356099 |
3 | NC_018191 | TGAGCG | 2 | 12 | 4971 | 4982 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356099 |
4 | NC_018191 | GCCGTT | 2 | 12 | 6834 | 6845 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356102 |
5 | NC_018191 | TGTCCA | 2 | 12 | 9361 | 9372 | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356105 |
6 | NC_018191 | ACCGGG | 2 | 12 | 9803 | 9814 | 16.67 % | 0 % | 50 % | 33.33 % | 398356105 |
7 | NC_018191 | TCCACG | 2 | 12 | 10830 | 10841 | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 398356108 |
8 | NC_018191 | GAAGGC | 2 | 12 | 15514 | 15525 | 33.33 % | 0 % | 50 % | 16.67 % | 398356116 |
9 | NC_018191 | TGCACG | 2 | 12 | 16557 | 16568 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356118 |
10 | NC_018191 | GCCGCG | 2 | 12 | 17918 | 17929 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356119 |
11 | NC_018191 | ATCCCG | 2 | 12 | 19111 | 19122 | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 398356120 |
12 | NC_018191 | GATCGA | 2 | 12 | 19729 | 19740 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356121 |
13 | NC_018191 | CCTCGA | 2 | 12 | 20086 | 20097 | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 398356121 |
14 | NC_018191 | CGCGAT | 2 | 12 | 24449 | 24460 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356128 |
15 | NC_018191 | CGCCAA | 2 | 12 | 30252 | 30263 | 33.33 % | 0 % | 16.67 % | 50 % | 398356134 |
16 | NC_018191 | GGACAA | 2 | 12 | 31817 | 31828 | 50 % | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356134 |
17 | NC_018191 | GGCCGC | 2 | 12 | 32996 | 33007 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356135 |
18 | NC_018191 | GCTTCC | 2 | 12 | 35798 | 35809 | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 50 % | 398356138 |
19 | NC_018191 | GCAGAT | 2 | 12 | 40502 | 40513 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356142 |
20 | NC_018191 | AGCATC | 2 | 12 | 43780 | 43791 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356148 |
21 | NC_018191 | GCTTCC | 2 | 12 | 44179 | 44190 | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 50 % | 398356148 |
22 | NC_018191 | ATGGCC | 2 | 12 | 46066 | 46077 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356151 |
23 | NC_018191 | TCGACG | 2 | 12 | 48078 | 48089 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356156 |
24 | NC_018191 | GGGATC | 2 | 12 | 54861 | 54872 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356166 |
25 | NC_018191 | CAGCGG | 2 | 12 | 55423 | 55434 | 16.67 % | 0 % | 50 % | 33.33 % | 398356166 |
26 | NC_018191 | TGACCG | 2 | 12 | 56551 | 56562 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356167 |
27 | NC_018191 | ATACAG | 2 | 12 | 59063 | 59074 | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 398356173 |
28 | NC_018191 | GGCGTC | 2 | 12 | 62666 | 62677 | 0 % | 16.67 % | 50 % | 33.33 % | 398356175 |
29 | NC_018191 | GACGGC | 2 | 12 | 63876 | 63887 | 16.67 % | 0 % | 50 % | 33.33 % | 398356175 |
30 | NC_018191 | CCTCGA | 2 | 12 | 69323 | 69334 | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 398356176 |
31 | NC_018191 | CGGGAA | 2 | 12 | 69356 | 69367 | 33.33 % | 0 % | 50 % | 16.67 % | 398356176 |
32 | NC_018191 | GGCATA | 2 | 12 | 72064 | 72075 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356181 |
33 | NC_018191 | AACGGA | 2 | 12 | 72541 | 72552 | 50 % | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356181 |
34 | NC_018191 | TGGCCG | 2 | 12 | 75023 | 75034 | 0 % | 16.67 % | 50 % | 33.33 % | 398356185 |
35 | NC_018191 | CATTCC | 2 | 12 | 75998 | 76009 | 16.67 % | 33.33 % | 0 % | 50 % | 398356186 |
36 | NC_018191 | CTGACC | 2 | 12 | 82495 | 82506 | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 398356194 |
37 | NC_018191 | ATCGCA | 2 | 12 | 90487 | 90498 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356200 |
38 | NC_018191 | GGTCGA | 2 | 12 | 93033 | 93044 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356203 |
39 | NC_018191 | TCGCCG | 2 | 12 | 94989 | 95000 | 0 % | 16.67 % | 33.33 % | 50 % | 398356205 |
40 | NC_018191 | GCCCCG | 2 | 12 | 95232 | 95243 | 0 % | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 398356205 |
41 | NC_018191 | GCCTCG | 2 | 12 | 95475 | 95486 | 0 % | 16.67 % | 33.33 % | 50 % | 398356205 |
42 | NC_018191 | CCAAGT | 2 | 12 | 98046 | 98057 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356207 |
43 | NC_018191 | TTCGAT | 2 | 12 | 99037 | 99048 | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 398356207 |
44 | NC_018191 | TCGAAG | 2 | 12 | 104616 | 104627 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356214 |
45 | NC_018191 | ACACAG | 2 | 12 | 105449 | 105460 | 50 % | 0 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356215 |
46 | NC_018191 | ATGGGC | 2 | 12 | 125499 | 125510 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356228 |
47 | NC_018191 | CCGCGG | 2 | 12 | 128573 | 128584 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356232 |
48 | NC_018191 | AAGCAT | 2 | 12 | 134925 | 134936 | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 398356239 |
49 | NC_018191 | CATGGA | 2 | 12 | 135311 | 135322 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356240 |
50 | NC_018191 | GTAGCC | 2 | 12 | 136752 | 136763 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356240 |
51 | NC_018191 | CGGCGA | 2 | 12 | 144729 | 144740 | 16.67 % | 0 % | 50 % | 33.33 % | 398356251 |
52 | NC_018191 | CTGTTT | 2 | 12 | 145007 | 145018 | 0 % | 66.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 398356252 |
53 | NC_018191 | CCGTAG | 2 | 12 | 145320 | 145331 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356253 |
54 | NC_018191 | GAAGGA | 2 | 12 | 148619 | 148630 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 398356256 |
55 | NC_018191 | GATCAC | 2 | 12 | 149899 | 149910 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356258 |
56 | NC_018191 | AGCTTC | 2 | 12 | 150499 | 150510 | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356259 |
57 | NC_018191 | TTCGGC | 2 | 12 | 158381 | 158392 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356267 |
58 | NC_018191 | GACGAG | 2 | 12 | 161140 | 161151 | 33.33 % | 0 % | 50 % | 16.67 % | 398356271 |
59 | NC_018191 | ATCGCG | 2 | 12 | 161381 | 161392 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356271 |
60 | NC_018191 | GCTGGC | 2 | 12 | 161463 | 161474 | 0 % | 16.67 % | 50 % | 33.33 % | 398356271 |
61 | NC_018191 | TGTGGA | 2 | 12 | 162146 | 162157 | 16.67 % | 33.33 % | 50 % | 0 % | 398356272 |
62 | NC_018191 | GTCCTC | 2 | 12 | 163529 | 163540 | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 50 % | 398356273 |
63 | NC_018191 | TCGACG | 2 | 12 | 164001 | 164012 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356273 |
64 | NC_018191 | GTCGAG | 2 | 12 | 164546 | 164557 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356273 |
65 | NC_018191 | CGGTCG | 2 | 12 | 166015 | 166026 | 0 % | 16.67 % | 50 % | 33.33 % | 398356273 |
66 | NC_018191 | CACGAG | 2 | 12 | 170178 | 170189 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356279 |
67 | NC_018191 | GCAGAT | 2 | 12 | 171565 | 171576 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 398356279 |
68 | NC_018191 | CGATGG | 2 | 12 | 174278 | 174289 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356280 |
69 | NC_018191 | ACTCGA | 2 | 12 | 177664 | 177675 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356282 |
70 | NC_018191 | AGCCAG | 2 | 12 | 177684 | 177695 | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356282 |
71 | NC_018191 | CCTTCA | 2 | 12 | 180770 | 180781 | 16.67 % | 33.33 % | 0 % | 50 % | 398356284 |
72 | NC_018191 | GGCTTG | 2 | 12 | 181019 | 181030 | 0 % | 33.33 % | 50 % | 16.67 % | 398356285 |
73 | NC_018191 | AGTCGG | 2 | 12 | 184442 | 184453 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 398356289 |
74 | NC_018191 | TCGTCA | 2 | 12 | 184987 | 184998 | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356289 |
75 | NC_018191 | GATCTT | 2 | 12 | 186472 | 186483 | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 398356291 |
76 | NC_018191 | AGCTTC | 2 | 12 | 186817 | 186828 | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356292 |
77 | NC_018191 | CTGGTC | 2 | 12 | 192129 | 192140 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 398356298 |
78 | NC_018191 | GCTGGT | 2 | 12 | 193680 | 193691 | 0 % | 33.33 % | 50 % | 16.67 % | 398356298 |
79 | NC_018191 | CAGTTC | 2 | 12 | 202536 | 202547 | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356309 |
80 | NC_018191 | TGCACA | 2 | 12 | 203228 | 203239 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 398356309 |