Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257
Total Repeats: 159
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_018191 | GCGAT | 2 | 10 | 925 | 934 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356094 |
2 | NC_018191 | CAAGC | 2 | 10 | 1045 | 1054 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 398356095 |
3 | NC_018191 | TCGGC | 2 | 10 | 1267 | 1276 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356095 |
4 | NC_018191 | GGCGT | 2 | 10 | 1464 | 1473 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 398356095 |
5 | NC_018191 | CATCA | 2 | 10 | 3403 | 3412 | 40 % | 20 % | 0 % | 40 % | Non-Coding |
6 | NC_018191 | GGGTT | 2 | 10 | 4038 | 4047 | 0 % | 40 % | 60 % | 0 % | Non-Coding |
7 | NC_018191 | AGATC | 2 | 10 | 4953 | 4962 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 398356099 |
8 | NC_018191 | GCCGC | 2 | 10 | 5018 | 5027 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 398356099 |
9 | NC_018191 | ACATG | 2 | 10 | 5413 | 5422 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 398356099 |
10 | NC_018191 | ATGAA | 2 | 10 | 6167 | 6176 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 398356101 |
11 | NC_018191 | CTTCG | 2 | 10 | 6428 | 6437 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 398356102 |
12 | NC_018191 | ACGGC | 2 | 10 | 6651 | 6660 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356102 |
13 | NC_018191 | TCGGC | 2 | 10 | 7811 | 7820 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356103 |
14 | NC_018191 | TCCAT | 2 | 10 | 9537 | 9546 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 398356105 |
15 | NC_018191 | TCAGG | 2 | 10 | 14077 | 14086 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356114 |
16 | NC_018191 | CGATC | 2 | 10 | 15105 | 15114 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356116 |
17 | NC_018191 | GCTCG | 2 | 10 | 20465 | 20474 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356121 |
18 | NC_018191 | CGAGG | 2 | 10 | 22002 | 22011 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 398356124 |
19 | NC_018191 | CGCGT | 2 | 10 | 24346 | 24355 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356128 |
20 | NC_018191 | AGCTG | 2 | 10 | 25369 | 25378 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356128 |
21 | NC_018191 | ATTGT | 2 | 10 | 29390 | 29399 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | Non-Coding |
22 | NC_018191 | AACGG | 2 | 10 | 30420 | 30429 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | 398356134 |
23 | NC_018191 | CCCCT | 2 | 10 | 30691 | 30700 | 0 % | 20 % | 0 % | 80 % | 398356134 |
24 | NC_018191 | TCCGT | 2 | 10 | 31997 | 32006 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 398356135 |
25 | NC_018191 | GAGAA | 2 | 10 | 32790 | 32799 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 398356135 |
26 | NC_018191 | CGACT | 2 | 10 | 33216 | 33225 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356135 |
27 | NC_018191 | CAAGC | 2 | 10 | 33471 | 33480 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 398356135 |
28 | NC_018191 | GAAGC | 2 | 10 | 33922 | 33931 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | Non-Coding |
29 | NC_018191 | TCGCC | 2 | 10 | 35604 | 35613 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356138 |
30 | NC_018191 | GTCAC | 2 | 10 | 38277 | 38286 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356139 |
31 | NC_018191 | TCCGG | 2 | 10 | 38423 | 38432 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | Non-Coding |
32 | NC_018191 | GCTCG | 2 | 10 | 39335 | 39344 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356141 |
33 | NC_018191 | AGCCA | 2 | 10 | 42204 | 42213 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 398356146 |
34 | NC_018191 | CGAAA | 2 | 10 | 43751 | 43760 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 398356148 |
35 | NC_018191 | GCCAG | 2 | 10 | 44321 | 44330 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356148 |
36 | NC_018191 | GGCCC | 2 | 10 | 46448 | 46457 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 398356151 |
37 | NC_018191 | CGGCA | 2 | 10 | 48023 | 48032 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356156 |
38 | NC_018191 | AACGC | 2 | 10 | 48048 | 48057 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 398356156 |
39 | NC_018191 | CCGCT | 2 | 10 | 49970 | 49979 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | Non-Coding |
40 | NC_018191 | TGAGA | 2 | 10 | 50627 | 50636 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | Non-Coding |
41 | NC_018191 | TGGCG | 2 | 10 | 52511 | 52520 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 398356163 |
42 | NC_018191 | CCCTC | 2 | 10 | 56221 | 56230 | 0 % | 20 % | 0 % | 80 % | 398356167 |
43 | NC_018191 | TCGCC | 2 | 10 | 57004 | 57013 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356167 |
44 | NC_018191 | GCTCG | 2 | 10 | 57206 | 57215 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356168 |
45 | NC_018191 | GGCGC | 2 | 10 | 59001 | 59010 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 398356173 |
46 | NC_018191 | ACGCA | 2 | 10 | 59537 | 59546 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | Non-Coding |
47 | NC_018191 | GGCCA | 2 | 10 | 60075 | 60084 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356174 |
48 | NC_018191 | CGGAT | 2 | 10 | 60941 | 60950 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356175 |
49 | NC_018191 | GGGGC | 2 | 10 | 63972 | 63981 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 398356175 |
50 | NC_018191 | CGATC | 2 | 10 | 65175 | 65184 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356175 |
51 | NC_018191 | CGGCG | 2 | 10 | 66322 | 66331 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 398356175 |
52 | NC_018191 | GCTGC | 2 | 10 | 66805 | 66814 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356175 |
53 | NC_018191 | CCGCT | 2 | 10 | 69581 | 69590 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356176 |
54 | NC_018191 | GATCG | 2 | 10 | 71570 | 71579 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356180 |
55 | NC_018191 | GTGCC | 2 | 10 | 72401 | 72410 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356181 |
56 | NC_018191 | CCCCG | 2 | 10 | 73067 | 73076 | 0 % | 0 % | 20 % | 80 % | 398356181 |
57 | NC_018191 | AGCCG | 2 | 10 | 76338 | 76347 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356187 |
58 | NC_018191 | ATGCA | 2 | 10 | 76467 | 76476 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 398356187 |
59 | NC_018191 | CCAGG | 2 | 10 | 77024 | 77033 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356188 |
60 | NC_018191 | CATCG | 2 | 10 | 78852 | 78861 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356190 |
61 | NC_018191 | TTCTT | 2 | 10 | 79731 | 79740 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 398356191 |
62 | NC_018191 | CCGGA | 2 | 10 | 83713 | 83722 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356196 |
63 | NC_018191 | GCGTC | 2 | 10 | 85168 | 85177 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356197 |
64 | NC_018191 | CGTCC | 2 | 10 | 85666 | 85675 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | Non-Coding |
65 | NC_018191 | CGGCA | 2 | 10 | 87065 | 87074 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356198 |
66 | NC_018191 | AGGCG | 2 | 10 | 87700 | 87709 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 398356199 |
67 | NC_018191 | CGGGC | 2 | 10 | 89117 | 89126 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | Non-Coding |
68 | NC_018191 | GCAGT | 2 | 10 | 89909 | 89918 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | Non-Coding |
69 | NC_018191 | CGCGA | 2 | 10 | 90664 | 90673 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356200 |
70 | NC_018191 | CCGAC | 2 | 10 | 94548 | 94557 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 398356205 |
71 | NC_018191 | GCTTC | 2 | 10 | 98951 | 98960 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 398356207 |
72 | NC_018191 | ACCGC | 2 | 10 | 99525 | 99534 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 398356208 |
73 | NC_018191 | TCGCC | 2 | 10 | 102539 | 102548 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356210 |
74 | NC_018191 | GGGCT | 2 | 10 | 102924 | 102933 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | Non-Coding |
75 | NC_018191 | CGGTC | 2 | 10 | 103043 | 103052 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356211 |
76 | NC_018191 | GATGA | 2 | 10 | 104849 | 104858 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 398356214 |
77 | NC_018191 | CGGCC | 2 | 10 | 107378 | 107387 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 398356216 |
78 | NC_018191 | ATCAG | 2 | 10 | 109676 | 109685 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 398356216 |
79 | NC_018191 | CGACG | 2 | 10 | 110761 | 110770 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356217 |
80 | NC_018191 | CGGTC | 2 | 10 | 111733 | 111742 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356217 |
81 | NC_018191 | ACGCT | 2 | 10 | 113003 | 113012 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356218 |
82 | NC_018191 | CCTGG | 2 | 10 | 113150 | 113159 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356218 |
83 | NC_018191 | ACGTT | 2 | 10 | 114125 | 114134 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 398356220 |
84 | NC_018191 | GGCAT | 2 | 10 | 115758 | 115767 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356222 |
85 | NC_018191 | TCCGG | 2 | 10 | 116512 | 116521 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356223 |
86 | NC_018191 | AAATG | 2 | 10 | 122139 | 122148 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 398356226 |
87 | NC_018191 | AAGCA | 2 | 10 | 123631 | 123640 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 398356228 |
88 | NC_018191 | GATCG | 2 | 10 | 125160 | 125169 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356228 |
89 | NC_018191 | CGGCT | 2 | 10 | 129488 | 129497 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356234 |
90 | NC_018191 | GACGC | 2 | 10 | 131161 | 131170 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356236 |
91 | NC_018191 | CGATC | 2 | 10 | 133366 | 133375 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356236 |
92 | NC_018191 | TCAGG | 2 | 10 | 136955 | 136964 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356240 |
93 | NC_018191 | AGGGC | 2 | 10 | 137173 | 137182 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 398356240 |
94 | NC_018191 | CCCGG | 2 | 10 | 137191 | 137200 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 398356240 |
95 | NC_018191 | CGCTT | 2 | 10 | 137746 | 137755 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 398356242 |
96 | NC_018191 | GCATC | 2 | 10 | 138315 | 138324 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356242 |
97 | NC_018191 | CTCGC | 2 | 10 | 139575 | 139584 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356246 |
98 | NC_018191 | CGGTA | 2 | 10 | 141717 | 141726 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356248 |
99 | NC_018191 | CGTCG | 2 | 10 | 142141 | 142150 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356248 |
100 | NC_018191 | CTCGG | 2 | 10 | 142242 | 142251 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356249 |
101 | NC_018191 | TTCCC | 2 | 10 | 143190 | 143199 | 0 % | 40 % | 0 % | 60 % | 398356249 |
102 | NC_018191 | CCGCG | 2 | 10 | 143251 | 143260 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | Non-Coding |
103 | NC_018191 | TCCCC | 2 | 10 | 143472 | 143481 | 0 % | 20 % | 0 % | 80 % | 398356250 |
104 | NC_018191 | CGCGC | 2 | 10 | 144131 | 144140 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 398356250 |
105 | NC_018191 | GCGCC | 2 | 10 | 144437 | 144446 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 398356251 |
106 | NC_018191 | GCGTC | 2 | 10 | 145568 | 145577 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356253 |
107 | NC_018191 | CTGCC | 2 | 10 | 146991 | 147000 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356255 |
108 | NC_018191 | CCCTC | 2 | 10 | 147719 | 147728 | 0 % | 20 % | 0 % | 80 % | 398356256 |
109 | NC_018191 | GCCCC | 2 | 10 | 149500 | 149509 | 0 % | 0 % | 20 % | 80 % | 398356257 |
110 | NC_018191 | CCCCT | 2 | 10 | 150241 | 150250 | 0 % | 20 % | 0 % | 80 % | 398356259 |
111 | NC_018191 | CGTCC | 2 | 10 | 150353 | 150362 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356259 |
112 | NC_018191 | GAGCA | 2 | 10 | 151711 | 151720 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | 398356261 |
113 | NC_018191 | TCGAA | 2 | 10 | 152189 | 152198 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 398356262 |
114 | NC_018191 | TCGAA | 2 | 10 | 153119 | 153128 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 398356264 |
115 | NC_018191 | AGGAC | 2 | 10 | 156954 | 156963 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | Non-Coding |
116 | NC_018191 | ACGTC | 2 | 10 | 157224 | 157233 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | Non-Coding |
117 | NC_018191 | CGGTA | 2 | 10 | 158918 | 158927 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356267 |
118 | NC_018191 | CTCCG | 2 | 10 | 160864 | 160873 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356271 |
119 | NC_018191 | CGCGT | 2 | 10 | 163450 | 163459 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356273 |
120 | NC_018191 | ACATG | 2 | 10 | 163978 | 163987 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 398356273 |
121 | NC_018191 | CGGTT | 2 | 10 | 165272 | 165281 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 398356273 |
122 | NC_018191 | CCGTC | 2 | 10 | 167501 | 167510 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356275 |
123 | NC_018191 | GGGCG | 2 | 10 | 167780 | 167789 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 398356275 |
124 | NC_018191 | CGGGG | 2 | 10 | 169125 | 169134 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 398356278 |
125 | NC_018191 | CGTCC | 2 | 10 | 169291 | 169300 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356278 |
126 | NC_018191 | ATTTC | 2 | 10 | 170404 | 170413 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 398356279 |
127 | NC_018191 | GGGTC | 2 | 10 | 170600 | 170609 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 398356279 |
128 | NC_018191 | GGCAT | 2 | 10 | 173252 | 173261 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356280 |
129 | NC_018191 | CGTTT | 2 | 10 | 174600 | 174609 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 398356280 |
130 | NC_018191 | TTTCC | 2 | 10 | 177759 | 177768 | 0 % | 60 % | 0 % | 40 % | 398356282 |
131 | NC_018191 | GGCAG | 2 | 10 | 178642 | 178651 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 398356282 |
132 | NC_018191 | ATCGG | 2 | 10 | 180468 | 180477 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356284 |
133 | NC_018191 | CGGCC | 2 | 10 | 181173 | 181182 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 398356285 |
134 | NC_018191 | CGTCC | 2 | 10 | 181631 | 181640 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 398356286 |
135 | NC_018191 | GCGGA | 2 | 10 | 181841 | 181850 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 398356286 |
136 | NC_018191 | TCGCG | 2 | 10 | 182257 | 182266 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356287 |
137 | NC_018191 | AAGGA | 2 | 10 | 185533 | 185542 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 398356289 |
138 | NC_018191 | AGTGC | 2 | 10 | 185582 | 185591 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356289 |
139 | NC_018191 | TGCAA | 2 | 10 | 185691 | 185700 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | Non-Coding |
140 | NC_018191 | GAATT | 2 | 10 | 186284 | 186293 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 398356291 |
141 | NC_018191 | TCTTT | 2 | 10 | 188910 | 188919 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 398356296 |
142 | NC_018191 | GCCGA | 2 | 10 | 190001 | 190010 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356297 |
143 | NC_018191 | CGATC | 2 | 10 | 190012 | 190021 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356297 |
144 | NC_018191 | GCCGA | 2 | 10 | 190058 | 190067 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356297 |
145 | NC_018191 | CAGGG | 2 | 10 | 191818 | 191827 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 398356298 |
146 | NC_018191 | TGCAG | 2 | 10 | 195679 | 195688 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 398356301 |
147 | NC_018191 | CCACC | 2 | 10 | 199103 | 199112 | 20 % | 0 % | 0 % | 80 % | Non-Coding |
148 | NC_018191 | CCCAT | 2 | 10 | 200486 | 200495 | 20 % | 20 % | 0 % | 60 % | 398356305 |
149 | NC_018191 | ATCCG | 2 | 10 | 200598 | 200607 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356305 |
150 | NC_018191 | CTGGT | 2 | 10 | 201301 | 201310 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 398356306 |
151 | NC_018191 | GAATG | 2 | 10 | 201699 | 201708 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 398356307 |
152 | NC_018191 | CGATC | 2 | 10 | 203965 | 203974 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 398356310 |
153 | NC_018191 | CGTCC | 2 | 10 | 204539 | 204548 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | Non-Coding |
154 | NC_018191 | CTCAC | 2 | 10 | 204619 | 204628 | 20 % | 20 % | 0 % | 60 % | 398356311 |
155 | NC_018191 | CGGCG | 2 | 10 | 205518 | 205527 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 398356313 |
156 | NC_018191 | GTCGC | 2 | 10 | 205579 | 205588 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 398356313 |
157 | NC_018191 | GTTCG | 2 | 10 | 205877 | 205886 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 398356313 |
158 | NC_018191 | CGGCA | 2 | 10 | 206131 | 206140 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 398356313 |
159 | NC_018191 | CTTTC | 2 | 10 | 207369 | 207378 | 0 % | 60 % | 0 % | 40 % | 398356313 |