MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018191	TTTC	2	8	44	51	0 %	75 %	0 %	25 %	398356093
2	NC_018191	AGGA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	50 %	0 %	398356095
3	NC_018191	CTGG	2	8	2312	2319	0 %	25 %	50 %	25 %	398356095
4	NC_018191	CAGG	2	8	2774	2781	25 %	0 %	50 %	25 %	398356096
5	NC_018191	GCCA	2	8	2934	2941	25 %	0 %	25 %	50 %	398356096
6	NC_018191	GCCG	2	8	3039	3046	0 %	0 %	50 %	50 %	398356097
7	NC_018191	GAAT	2	8	3150	3157	50 %	25 %	25 %	0 %	398356097
8	NC_018191	ACGG	2	8	3164	3171	25 %	0 %	50 %	25 %	398356097
9	NC_018191	CTGA	2	8	3211	3218	25 %	25 %	25 %	25 %	398356097
10	NC_018191	TTCT	2	8	3289	3296	0 %	75 %	0 %	25 %	398356097
11	NC_018191	CGAC	2	8	3324	3331	25 %	0 %	25 %	50 %	398356097
12	NC_018191	TGGC	2	8	4528	4535	0 %	25 %	50 %	25 %	398356099
13	NC_018191	GACC	2	8	4620	4627	25 %	0 %	25 %	50 %	398356099
14	NC_018191	GGCT	2	8	4663	4670	0 %	25 %	50 %	25 %	398356099
15	NC_018191	GGCG	2	8	5399	5406	0 %	0 %	75 %	25 %	398356099
16	NC_018191	GCCC	2	8	5716	5723	0 %	0 %	25 %	75 %	398356101
17	NC_018191	TTCG	2	8	7078	7085	0 %	50 %	25 %	25 %	398356102
18	NC_018191	TGAG	2	8	7165	7172	25 %	25 %	50 %	0 %	398356102
19	NC_018191	TCGA	2	8	7511	7518	25 %	25 %	25 %	25 %	398356102
20	NC_018191	GCCG	2	8	7856	7863	0 %	0 %	50 %	50 %	398356103
21	NC_018191	TCGC	2	8	8500	8507	0 %	25 %	25 %	50 %	398356104
22	NC_018191	AAAC	2	8	9236	9243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018191	GAAT	2	8	9743	9750	50 %	25 %	25 %	0 %	398356105
24	NC_018191	TGCT	2	8	10476	10483	0 %	50 %	25 %	25 %	398356108
25	NC_018191	GGTA	2	8	10579	10586	25 %	25 %	50 %	0 %	398356108
26	NC_018191	CCAG	2	8	10690	10697	25 %	0 %	25 %	50 %	398356108
27	NC_018191	TCGA	2	8	11364	11371	25 %	25 %	25 %	25 %	398356108
28	NC_018191	GTTT	2	8	11960	11967	0 %	75 %	25 %	0 %	398356109
29	NC_018191	CGAA	2	8	11972	11979	50 %	0 %	25 %	25 %	398356109
30	NC_018191	TCCA	2	8	13205	13212	25 %	25 %	0 %	50 %	398356113
31	NC_018191	TCAA	2	8	13605	13612	50 %	25 %	0 %	25 %	398356114
32	NC_018191	ACTA	2	8	14752	14759	50 %	25 %	0 %	25 %	398356115
33	NC_018191	ACGC	2	8	14911	14918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018191	TGCA	2	8	15310	15317	25 %	25 %	25 %	25 %	398356116
35	NC_018191	CCGC	2	8	15826	15833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_018191	GCCT	2	8	17577	17584	0 %	25 %	25 %	50 %	398356118
37	NC_018191	GGGA	2	8	18071	18078	25 %	0 %	75 %	0 %	398356119
38	NC_018191	GCCC	2	8	19097	19104	0 %	0 %	25 %	75 %	398356120
39	NC_018191	CCGA	2	8	19170	19177	25 %	0 %	25 %	50 %	398356120
40	NC_018191	CCTT	2	8	19940	19947	0 %	50 %	0 %	50 %	398356121
41	NC_018191	CGCC	2	8	19956	19963	0 %	0 %	25 %	75 %	398356121
42	NC_018191	ACGA	2	8	21162	21169	50 %	0 %	25 %	25 %	398356123
43	NC_018191	TGCC	2	8	21206	21213	0 %	25 %	25 %	50 %	398356123
44	NC_018191	GGCC	2	8	21216	21223	0 %	0 %	50 %	50 %	398356123
45	NC_018191	CAAA	2	8	21674	21681	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018191	CGTA	2	8	22989	22996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018191	GATC	2	8	23062	23069	25 %	25 %	25 %	25 %	398356126
48	NC_018191	CATC	2	8	23140	23147	25 %	25 %	0 %	50 %	398356126
49	NC_018191	CGTC	2	8	23206	23213	0 %	25 %	25 %	50 %	398356126
50	NC_018191	CGCC	2	8	23607	23614	0 %	0 %	25 %	75 %	398356128
51	NC_018191	ATAA	2	8	24029	24036	75 %	25 %	0 %	0 %	398356128
52	NC_018191	CGGC	2	8	24051	24058	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
53	NC_018191	ATTG	2	8	24640	24647	25 %	50 %	25 %	0 %	398356128
54	NC_018191	GCCA	2	8	25007	25014	25 %	0 %	25 %	50 %	398356128
55	NC_018191	ACAA	2	8	25137	25144	75 %	0 %	0 %	25 %	398356128
56	NC_018191	TCAA	2	8	25299	25306	50 %	25 %	0 %	25 %	398356128
57	NC_018191	CGGC	2	8	25475	25482	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
58	NC_018191	TTCG	2	8	25490	25497	0 %	50 %	25 %	25 %	398356128
59	NC_018191	AGGC	2	8	26811	26818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018191	GGGC	2	8	27082	27089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018191	TGCG	2	8	27495	27502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018191	ACCA	2	8	27606	27613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018191	AAGG	2	8	27752	27759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018191	CGGC	2	8	28740	28747	0 %	0 %	50 %	50 %	398356132
65	NC_018191	CCGG	2	8	28922	28929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018191	GAAA	2	8	29929	29936	75 %	0 %	25 %	0 %	398356134
67	NC_018191	CGGC	2	8	30544	30551	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
68	NC_018191	GGTC	2	8	30613	30620	0 %	25 %	50 %	25 %	398356134
69	NC_018191	CTGC	2	8	30724	30731	0 %	25 %	25 %	50 %	398356134
70	NC_018191	CCAG	2	8	30838	30845	25 %	0 %	25 %	50 %	398356134
71	NC_018191	GCCG	2	8	30890	30897	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
72	NC_018191	GTCG	2	8	30934	30941	0 %	25 %	50 %	25 %	398356134
73	NC_018191	TGGC	2	8	30992	30999	0 %	25 %	50 %	25 %	398356134
74	NC_018191	GGCA	2	8	31472	31479	25 %	0 %	50 %	25 %	398356134
75	NC_018191	GGCG	2	8	32020	32027	0 %	0 %	75 %	25 %	398356135
76	NC_018191	GCAC	2	8	32181	32188	25 %	0 %	25 %	50 %	398356135
77	NC_018191	TCGA	2	8	34569	34576	25 %	25 %	25 %	25 %	398356136
78	NC_018191	AGAA	2	8	35704	35711	75 %	0 %	25 %	0 %	398356138
79	NC_018191	CTCC	2	8	36483	36490	0 %	25 %	0 %	75 %	398356138
80	NC_018191	TCGG	2	8	37201	37208	0 %	25 %	50 %	25 %	398356138
81	NC_018191	CCTT	2	8	37435	37442	0 %	50 %	0 %	50 %	398356138
82	NC_018191	CCCG	2	8	37637	37644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_018191	TGAC	2	8	37661	37668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018191	GAAC	2	8	37771	37778	50 %	0 %	25 %	25 %	398356139
85	NC_018191	CATT	2	8	38630	38637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018191	CCGT	2	8	39706	39713	0 %	25 %	25 %	50 %	398356142
87	NC_018191	CGAG	2	8	40177	40184	25 %	0 %	50 %	25 %	398356142
88	NC_018191	TGAG	2	8	41182	41189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018191	CTTG	2	8	41243	41250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018191	ATCT	2	8	42540	42547	25 %	50 %	0 %	25 %	398356146
91	NC_018191	CTGG	2	8	42636	42643	0 %	25 %	50 %	25 %	398356146
92	NC_018191	CTGC	2	8	42855	42862	0 %	25 %	25 %	50 %	398356146
93	NC_018191	ATTC	2	8	44042	44049	25 %	50 %	0 %	25 %	398356148
94	NC_018191	TGCC	2	8	44271	44278	0 %	25 %	25 %	50 %	398356148
95	NC_018191	GCCG	2	8	45292	45299	0 %	0 %	50 %	50 %	398356149
96	NC_018191	AAGC	2	8	45301	45308	50 %	0 %	25 %	25 %	398356149
97	NC_018191	TCCG	2	8	45332	45339	0 %	25 %	25 %	50 %	398356149
98	NC_018191	TGCT	2	8	45582	45589	0 %	50 %	25 %	25 %	398356149
99	NC_018191	GAGC	2	8	46058	46065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018191	ACGG	2	8	46298	46305	25 %	0 %	50 %	25 %	398356151
101	NC_018191	TCGA	2	8	46683	46690	25 %	25 %	25 %	25 %	398356152
102	NC_018191	CAGC	2	8	46820	46827	25 %	0 %	25 %	50 %	398356152
103	NC_018191	CGAC	2	8	46837	46844	25 %	0 %	25 %	50 %	398356152
104	NC_018191	CGAG	2	8	47221	47228	25 %	0 %	50 %	25 %	398356153
105	NC_018191	CGAA	2	8	47339	47346	50 %	0 %	25 %	25 %	398356154
106	NC_018191	CCAG	2	8	47422	47429	25 %	0 %	25 %	50 %	398356154
107	NC_018191	GAAC	2	8	47604	47611	50 %	0 %	25 %	25 %	398356155
108	NC_018191	CGCA	2	8	48414	48421	25 %	0 %	25 %	50 %	398356157
109	NC_018191	TCCA	2	8	48464	48471	25 %	25 %	0 %	50 %	398356157
110	NC_018191	TGAG	2	8	48592	48599	25 %	25 %	50 %	0 %	398356158
111	NC_018191	GCCT	2	8	49667	49674	0 %	25 %	25 %	50 %	398356160
112	NC_018191	CCTG	2	8	49791	49798	0 %	25 %	25 %	50 %	398356160
113	NC_018191	CGTG	2	8	49899	49906	0 %	25 %	50 %	25 %	398356160
114	NC_018191	TGAC	2	8	50187	50194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018191	CCGA	2	8	50527	50534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018191	GGGC	2	8	50776	50783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018191	GCCA	2	8	50944	50951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018191	AGAT	2	8	51019	51026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018191	AGAA	2	8	51496	51503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018191	GTCA	2	8	52012	52019	25 %	25 %	25 %	25 %	398356162
121	NC_018191	CGTG	2	8	52362	52369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018191	CAGC	2	8	52636	52643	25 %	0 %	25 %	50 %	398356163
123	NC_018191	CGCT	2	8	52888	52895	0 %	25 %	25 %	50 %	398356163
124	NC_018191	CTGC	2	8	53145	53152	0 %	25 %	25 %	50 %	398356163
125	NC_018191	TATT	2	8	53438	53445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018191	GAGC	2	8	53971	53978	25 %	0 %	50 %	25 %	398356164
127	NC_018191	CGAT	2	8	53982	53989	25 %	25 %	25 %	25 %	398356164
128	NC_018191	AGCC	2	8	54364	54371	25 %	0 %	25 %	50 %	398356165
129	NC_018191	CTGC	2	8	54425	54432	0 %	25 %	25 %	50 %	398356165
130	NC_018191	CGCT	2	8	54577	54584	0 %	25 %	25 %	50 %	398356165
131	NC_018191	ACAA	2	8	54929	54936	75 %	0 %	0 %	25 %	398356166
132	NC_018191	TGCC	2	8	54940	54947	0 %	25 %	25 %	50 %	398356166
133	NC_018191	AAGC	2	8	55282	55289	50 %	0 %	25 %	25 %	398356166
134	NC_018191	TGCC	2	8	55929	55936	0 %	25 %	25 %	50 %	398356166
135	NC_018191	GCCC	2	8	56319	56326	0 %	0 %	25 %	75 %	398356167
136	NC_018191	TCGC	2	8	56380	56387	0 %	25 %	25 %	50 %	398356167
137	NC_018191	GGCG	2	8	56468	56475	0 %	0 %	75 %	25 %	398356167
138	NC_018191	TCAG	2	8	56520	56527	25 %	25 %	25 %	25 %	398356167
139	NC_018191	TGCC	2	8	56708	56715	0 %	25 %	25 %	50 %	398356167
140	NC_018191	AGCA	2	8	56771	56778	50 %	0 %	25 %	25 %	398356167
141	NC_018191	GAGG	2	8	56795	56802	25 %	0 %	75 %	0 %	398356167
142	NC_018191	CGGC	2	8	58241	58248	0 %	0 %	50 %	50 %	398356171
143	NC_018191	CGGG	2	8	58952	58959	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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