MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018191	AAAC	2	8	9236	9243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018191	ACGC	2	8	14911	14918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018191	CCGC	2	8	15826	15833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018191	CAAA	2	8	21674	21681	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018191	CGTA	2	8	22989	22996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018191	AGGC	2	8	26811	26818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018191	GGGC	2	8	27082	27089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018191	TGCG	2	8	27495	27502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018191	ACCA	2	8	27606	27613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018191	AAGG	2	8	27752	27759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018191	CCGG	2	8	28922	28929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018191	CCCG	2	8	37637	37644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_018191	TGAC	2	8	37661	37668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018191	CATT	2	8	38630	38637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018191	TGAG	2	8	41182	41189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018191	CTTG	2	8	41243	41250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018191	GAGC	2	8	46058	46065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018191	TGAC	2	8	50187	50194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018191	CCGA	2	8	50527	50534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018191	GGGC	2	8	50776	50783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018191	GCCA	2	8	50944	50951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018191	AGAT	2	8	51019	51026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018191	AGAA	2	8	51496	51503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018191	CGTG	2	8	52362	52369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018191	TATT	2	8	53438	53445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018191	CGGG	2	8	58952	58959	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018191	TGCT	2	8	60441	60448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018191	GTCA	2	8	70087	70094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018191	GGCC	2	8	73522	73529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018191	TGCC	2	8	75179	75186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018191	GACT	2	8	75219	75226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018191	ATCG	2	8	85576	85583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018191	ACCG	2	8	88169	88176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018191	ATTC	2	8	88362	88369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018191	GGAT	2	8	88553	88560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018191	TCGG	2	8	88610	88617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018191	GAAC	2	8	89530	89537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018191	GCCT	2	8	91020	91027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018191	CTGG	2	8	91324	91331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018191	CCAG	2	8	91357	91364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018191	TGCC	2	8	114639	114646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018191	AAGG	2	8	114654	114661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018191	TGAG	2	8	121390	121397	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018191	CGGC	2	8	122871	122878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018191	TTGC	2	8	128421	128428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018191	GCCG	2	8	129676	129683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018191	CTTC	2	8	135001	135008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018191	CGGA	2	8	140811	140818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018191	CGTC	2	8	140934	140941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018191	CGCT	2	8	151948	151955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018191	GGCG	2	8	155388	155395	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018191	TCCA	2	8	157361	157368	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018191	TCAG	2	8	157860	157867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018191	CAGC	2	8	180083	180090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018191	GCGA	2	8	182459	182466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018191	GCAG	2	8	185838	185845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018191	GACG	2	8	194980	194987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018191	CCGC	2	8	195985	195992	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_018191	AGGG	2	8	198514	198521	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018191	CATC	2	8	200385	200392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018191	TTGG	2	8	203484	203491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018191	AGCG	2	8	204518	204525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018191	GGGA	2	8	205166	205173	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018191	CGGG	2	8	205219	205226	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018191	TCGC	2	8	210426	210433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018191	CGGC	3	12	210544	210555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.