MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018191	GAT	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356093
2	NC_018191	TCA	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356093
3	NC_018191	AGC	2	6	189	194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356093
4	NC_018191	AAG	2	6	230	235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356093
5	NC_018191	TCA	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356093
6	NC_018191	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356093
7	NC_018191	TGC	2	6	337	342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
8	NC_018191	CGG	2	6	385	390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356094
9	NC_018191	TCT	2	6	433	438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356094
10	NC_018191	CCA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356094
11	NC_018191	TGC	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
12	NC_018191	TGC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
13	NC_018191	CGG	2	6	549	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356094
14	NC_018191	TCC	2	6	607	612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356094
15	NC_018191	GCC	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356094
16	NC_018191	AGC	2	6	717	722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356094
17	NC_018191	TCT	2	6	745	750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356094
18	NC_018191	GAT	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356094
19	NC_018191	TCG	2	6	901	906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
20	NC_018191	ATG	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356094
21	NC_018191	CAT	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
22	NC_018191	GCA	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
23	NC_018191	TGT	2	6	1007	1012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356095
24	NC_018191	CGT	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356095
25	NC_018191	ATC	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
26	NC_018191	GGC	2	6	1106	1111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
27	NC_018191	CAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356095
28	NC_018191	CGG	2	6	1186	1191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
29	NC_018191	TTG	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356095
30	NC_018191	GAC	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
31	NC_018191	TGG	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356095
32	NC_018191	GAA	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356095
33	NC_018191	GCC	2	6	1598	1603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356095
34	NC_018191	GCC	2	6	1663	1668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356095
35	NC_018191	TAG	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356095
36	NC_018191	GGC	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
37	NC_018191	CGG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
38	NC_018191	ATC	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
39	NC_018191	CAG	2	6	1988	1993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
40	NC_018191	TCT	2	6	2050	2055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356095
41	NC_018191	GCA	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
42	NC_018191	TTG	2	6	2185	2190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356095
43	NC_018191	GAC	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
44	NC_018191	GCC	2	6	2286	2291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356095
45	NC_018191	AAG	2	6	2360	2365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356095
46	NC_018191	GCA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
47	NC_018191	ATC	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
48	NC_018191	GTC	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356095
49	NC_018191	CAG	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356096
50	NC_018191	CAC	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356096
51	NC_018191	CTT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356096
52	NC_018191	CGT	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356096
53	NC_018191	GCC	2	6	2816	2821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356096
54	NC_018191	CGC	2	6	2950	2955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356096
55	NC_018191	ATC	2	6	2967	2972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356096
56	NC_018191	CTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356097
57	NC_018191	GTG	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356097
58	NC_018191	GTC	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356097
59	NC_018191	CGC	2	6	3130	3135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356097
60	NC_018191	GAC	2	6	3136	3141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356097
61	NC_018191	AAC	2	6	3250	3255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356097
62	NC_018191	CGC	3	9	3271	3279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356097
63	NC_018191	TGC	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356097
64	NC_018191	ACT	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018191	ACC	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018191	GAA	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356098
67	NC_018191	AAG	2	6	3593	3598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356098
68	NC_018191	CTT	2	6	3601	3606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356098
69	NC_018191	GCT	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018191	CCA	2	6	3676	3681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018191	ACG	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018191	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018191	GGC	2	6	3967	3972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018191	GGA	2	6	3983	3988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018191	CCG	2	6	4057	4062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018191	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018191	GAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018191	CGG	2	6	4151	4156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018191	TGA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018191	ATC	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018191	TGC	2	6	4268	4273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
82	NC_018191	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356099
83	NC_018191	GCC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356099
84	NC_018191	CTC	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356099
85	NC_018191	GAA	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356099
86	NC_018191	CTG	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
87	NC_018191	AAG	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356099
88	NC_018191	TGG	2	6	4493	4498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356099
89	NC_018191	TTC	2	6	4655	4660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356099
90	NC_018191	GCC	2	6	4699	4704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356099
91	NC_018191	GAG	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356099
92	NC_018191	TCG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
93	NC_018191	CGG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356099
94	NC_018191	GTC	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
95	NC_018191	TCG	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
96	NC_018191	GAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356099
97	NC_018191	CCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356100
98	NC_018191	GTC	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356100
99	NC_018191	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356100
100	NC_018191	ACC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356100
101	NC_018191	GCT	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356101
102	NC_018191	CCT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356101
103	NC_018191	TCG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356101
104	NC_018191	CGA	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356101
105	NC_018191	CGA	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356101
106	NC_018191	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356101
107	NC_018191	ATG	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356101
108	NC_018191	GCG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356101
109	NC_018191	GCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356101
110	NC_018191	GAC	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356101
111	NC_018191	GAA	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018191	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018191	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356102
114	NC_018191	CGA	2	6	6513	6518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356102
115	NC_018191	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356102
116	NC_018191	GCG	2	6	6722	6727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356102
117	NC_018191	GAC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356102
118	NC_018191	CGC	2	6	6946	6951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356102
119	NC_018191	CAT	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356102
120	NC_018191	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356102
121	NC_018191	ACG	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356102
122	NC_018191	GAA	2	6	7396	7401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356102
123	NC_018191	CGC	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356102
124	NC_018191	CCT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356102
125	NC_018191	CTT	2	6	7662	7667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356103
126	NC_018191	GCC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
127	NC_018191	GAC	2	6	7749	7754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356103
128	NC_018191	CGC	2	6	7763	7768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
129	NC_018191	GAT	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356103
130	NC_018191	GCC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
131	NC_018191	CGG	2	6	7918	7923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
132	NC_018191	GTC	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356103
133	NC_018191	CCG	2	6	8123	8128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
134	NC_018191	TCT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356103
135	NC_018191	GGC	2	6	8292	8297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
136	NC_018191	GGC	2	6	8304	8309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
137	NC_018191	CGG	2	6	8336	8341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
138	NC_018191	ATC	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356103
139	NC_018191	TCT	2	6	8381	8386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356103
140	NC_018191	TCA	2	6	8405	8410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356103
141	NC_018191	GTC	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356103
142	NC_018191	ACC	2	6	8484	8489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356104
143	NC_018191	CGC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356104
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145	NC_018191	CCT	2	6	8699	8704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356104
146	NC_018191	GTC	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356104
147	NC_018191	TTC	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356104
148	NC_018191	TGG	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356104
149	NC_018191	GGA	2	6	8900	8905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356104
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151	NC_018191	TGC	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018191	GAG	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356105
153	NC_018191	TCA	2	6	9486	9491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356105
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157	NC_018191	CCT	2	6	9762	9767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356105
158	NC_018191	GCC	2	6	9797	9802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356105
159	NC_018191	CTT	2	6	9850	9855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356105
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182	NC_018191	GCC	2	6	11299	11304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356108
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188	NC_018191	CTC	2	6	11502	11507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_018191	CAT	2	6	11529	11534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_018191	CGG	2	6	11629	11634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_018191	GCC	2	6	11645	11650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_018191	CAG	2	6	11692	11697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_018191	TGA	2	6	11815	11820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356109
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197	NC_018191	CGG	2	6	12072	12077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356110
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208	NC_018191	GAT	2	6	12833	12838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
209	NC_018191	TCC	2	6	12849	12854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
210	NC_018191	ATG	2	6	13073	13078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356113
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229	NC_018191	CGC	2	6	14191	14196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
230	NC_018191	CAT	2	6	14272	14277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_018191	CTG	2	6	14324	14329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_018191	GTC	2	6	14392	14397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_018191	CCT	2	6	14481	14486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356115
234	NC_018191	TCC	2	6	14520	14525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356115
235	NC_018191	AGC	2	6	14556	14561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356115
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238	NC_018191	ACG	2	6	14840	14845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
239	NC_018191	AGT	2	6	14956	14961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356116
240	NC_018191	GCG	3	9	14979	14987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356116
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242	NC_018191	GCC	2	6	15219	15224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356116
243	NC_018191	GAG	2	6	15386	15391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356116
244	NC_018191	GCG	2	6	15541	15546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356116
245	NC_018191	TTG	2	6	15580	15585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356116
246	NC_018191	AAG	2	6	15621	15626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_018191	CGT	2	6	15766	15771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356117
248	NC_018191	TGC	2	6	15820	15825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_018191	GAG	2	6	15854	15859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
250	NC_018191	AGG	2	6	15861	15866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_018191	GTC	2	6	15910	15915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356118
252	NC_018191	GGA	2	6	15970	15975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356118
253	NC_018191	CGC	2	6	15986	15991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356118
254	NC_018191	GCT	2	6	16005	16010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356118
255	NC_018191	CGA	2	6	16101	16106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356118
256	NC_018191	ATC	2	6	16406	16411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356118
257	NC_018191	CGG	3	9	16417	16425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356118
258	NC_018191	TGG	2	6	16429	16434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356118
259	NC_018191	CAC	2	6	16531	16536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356118
260	NC_018191	GGC	2	6	16539	16544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356118
261	NC_018191	CGG	2	6	16593	16598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356118
262	NC_018191	GAC	2	6	16622	16627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356118
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270	NC_018191	CAT	2	6	16972	16977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356118
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283	NC_018191	GAG	2	6	17770	17775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356119
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308	NC_018191	GGC	2	6	19205	19210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356120
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361	NC_018191	CTC	2	6	23040	23045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356126
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374	NC_018191	TGA	2	6	24097	24102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356128
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379	NC_018191	TCC	2	6	24429	24434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356128
380	NC_018191	TGC	2	6	24485	24490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356128
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