MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 376

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018191	ACT	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018191	ACC	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018191	GCT	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018191	CCA	2	6	3676	3681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018191	ACG	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018191	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018191	GGC	2	6	3967	3972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018191	GGA	2	6	3983	3988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018191	CCG	2	6	4057	4062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018191	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018191	GAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018191	CGG	2	6	4151	4156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018191	TGA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018191	ATC	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018191	GAA	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018191	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018191	TGC	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018191	CTC	2	6	11502	11507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018191	CAT	2	6	11529	11534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018191	AAG	2	6	11555	11560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018191	CGG	2	6	11629	11634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018191	GCC	2	6	11645	11650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018191	CAG	2	6	11692	11697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018191	GCC	3	9	12005	12013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018191	GAT	2	6	12748	12753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018191	GAT	2	6	12833	12838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018191	TCC	2	6	12849	12854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018191	CGC	2	6	14191	14196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018191	CAT	2	6	14272	14277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018191	CTG	2	6	14324	14329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018191	GTC	2	6	14392	14397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018191	ACG	2	6	14840	14845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018191	AAG	2	6	15621	15626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018191	TGC	2	6	15820	15825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018191	GAG	2	6	15854	15859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018191	AGG	2	6	15861	15866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018191	TCC	2	6	21497	21502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018191	ATG	2	6	21608	21613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018191	GCC	2	6	21691	21696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018191	CGA	2	6	22225	22230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018191	GCC	2	6	22314	22319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018191	GGC	2	6	22385	22390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018191	TCC	2	6	22428	22433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018191	TCG	2	6	22465	22470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018191	GCA	2	6	22929	22934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018191	CGA	2	6	26457	26462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018191	GAT	2	6	26464	26469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018191	AGC	2	6	26685	26690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018191	TCG	2	6	26696	26701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018191	CGT	2	6	26721	26726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018191	CGC	3	9	26760	26768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018191	TGC	2	6	26770	26775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018191	ACA	2	6	26924	26929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018191	GTG	2	6	27114	27119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018191	ATG	2	6	27194	27199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018191	GCC	2	6	27215	27220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018191	GAC	2	6	27381	27386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018191	CTT	2	6	27389	27394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018191	TGG	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018191	CAG	2	6	27538	27543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018191	CGT	2	6	27575	27580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018191	TGC	2	6	27583	27588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018191	GTT	2	6	27595	27600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018191	CTC	2	6	27743	27748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018191	TCG	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018191	AGC	2	6	27871	27876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018191	GCC	2	6	27909	27914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018191	CAC	2	6	28249	28254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018191	AGA	2	6	28257	28262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018191	CTC	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018191	TGG	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018191	CGC	2	6	28907	28912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018191	TGA	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018191	CGC	2	6	28981	28986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018191	CTT	2	6	29011	29016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018191	TCA	2	6	29270	29275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018191	CCG	2	6	29355	29360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018191	CGA	2	6	29483	29488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018191	GCC	2	6	29500	29505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018191	TCA	2	6	33655	33660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018191	CCG	2	6	33663	33668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018191	CAA	2	6	33707	33712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018191	GAT	2	6	33780	33785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018191	TCG	2	6	33802	33807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018191	GCT	2	6	33946	33951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018191	TAT	2	6	35118	35123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018191	GGC	2	6	35142	35147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018191	CGT	2	6	35193	35198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018191	ATA	2	6	37685	37690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018191	ATT	2	6	38491	38496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018191	CGA	2	6	38521	38526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018191	GTG	2	6	38531	38536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018191	GCT	2	6	41102	41107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018191	TGC	2	6	41734	41739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018191	AGG	2	6	41764	41769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018191	CCG	2	6	42993	42998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018191	CGT	2	6	43032	43037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018191	CAT	2	6	43098	43103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018191	CGA	2	6	43125	43130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018191	GTC	2	6	43673	43678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018191	CCG	2	6	46052	46057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018191	CGA	2	6	47501	47506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018191	TAC	2	6	47522	47527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018191	GAG	2	6	47560	47565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018191	GAA	2	6	50017	50022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018191	CCG	2	6	50165	50170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018191	GGA	2	6	50199	50204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018191	ATG	2	6	50263	50268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018191	CGC	2	6	50269	50274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018191	TTC	2	6	50350	50355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018191	CCG	2	6	50393	50398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018191	TTC	2	6	50417	50422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018191	CAC	2	6	50436	50441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018191	CGC	2	6	50488	50493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018191	GCT	2	6	50506	50511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018191	CGC	2	6	50637	50642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018191	AAG	2	6	50727	50732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018191	GCA	2	6	50788	50793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018191	TGC	2	6	50910	50915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018191	TCT	2	6	51034	51039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018191	CTG	2	6	51078	51083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018191	GAT	2	6	51090	51095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018191	AGC	2	6	51199	51204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018191	ACG	2	6	51229	51234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018191	GCT	2	6	51262	51267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018191	CTC	2	6	51306	51311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018191	GCC	2	6	51481	51486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018191	GGC	2	6	52246	52251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018191	CAT	2	6	52266	52271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018191	CCG	2	6	52313	52318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018191	CCA	3	9	52393	52401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018191	CCG	2	6	52457	52462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018191	GGC	3	9	53367	53375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018191	TCT	2	6	53448	53453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018191	AGG	2	6	54291	54296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018191	GGA	2	6	54665	54670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018191	GCC	2	6	54672	54677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018191	GGC	2	6	54712	54717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018191	CGC	2	6	57602	57607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.