MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 478

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018191	CG	3	6	1029	1034	0 %	0 %	50 %	50 %	398356095
2	NC_018191	CG	3	6	2011	2016	0 %	0 %	50 %	50 %	398356095
3	NC_018191	CG	3	6	2212	2217	0 %	0 %	50 %	50 %	398356095
4	NC_018191	CG	3	6	2507	2512	0 %	0 %	50 %	50 %	398356095
5	NC_018191	GC	3	6	2533	2538	0 %	0 %	50 %	50 %	398356095
6	NC_018191	GC	3	6	3082	3087	0 %	0 %	50 %	50 %	398356097
7	NC_018191	GC	3	6	3235	3240	0 %	0 %	50 %	50 %	398356097
8	NC_018191	CG	3	6	3657	3662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018191	GC	3	6	4143	4148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018191	CG	4	8	4485	4492	0 %	0 %	50 %	50 %	398356099
11	NC_018191	GC	3	6	4611	4616	0 %	0 %	50 %	50 %	398356099
12	NC_018191	CG	3	6	4932	4937	0 %	0 %	50 %	50 %	398356099
13	NC_018191	CG	3	6	5048	5053	0 %	0 %	50 %	50 %	398356099
14	NC_018191	CG	3	6	5201	5206	0 %	0 %	50 %	50 %	398356099
15	NC_018191	GC	3	6	5675	5680	0 %	0 %	50 %	50 %	398356101
16	NC_018191	GC	3	6	5798	5803	0 %	0 %	50 %	50 %	398356101
17	NC_018191	GC	3	6	5838	5843	0 %	0 %	50 %	50 %	398356101
18	NC_018191	CT	3	6	5959	5964	0 %	50 %	0 %	50 %	398356101
19	NC_018191	GC	3	6	6056	6061	0 %	0 %	50 %	50 %	398356101
20	NC_018191	TG	3	6	6065	6070	0 %	50 %	50 %	0 %	398356101
21	NC_018191	CG	3	6	6620	6625	0 %	0 %	50 %	50 %	398356102
22	NC_018191	CG	3	6	6782	6787	0 %	0 %	50 %	50 %	398356102
23	NC_018191	GC	4	8	8393	8400	0 %	0 %	50 %	50 %	398356103
24	NC_018191	GC	3	6	8524	8529	0 %	0 %	50 %	50 %	398356104
25	NC_018191	GC	3	6	8839	8844	0 %	0 %	50 %	50 %	398356104
26	NC_018191	GC	3	6	8873	8878	0 %	0 %	50 %	50 %	398356104
27	NC_018191	CT	3	6	9688	9693	0 %	50 %	0 %	50 %	398356105
28	NC_018191	GA	3	6	9819	9824	50 %	0 %	50 %	0 %	398356105
29	NC_018191	GC	3	6	10421	10426	0 %	0 %	50 %	50 %	398356108
30	NC_018191	TC	3	6	11130	11135	0 %	50 %	0 %	50 %	398356108
31	NC_018191	CG	3	6	12172	12177	0 %	0 %	50 %	50 %	398356110
32	NC_018191	GA	3	6	12243	12248	50 %	0 %	50 %	0 %	398356110
33	NC_018191	GA	3	6	12268	12273	50 %	0 %	50 %	0 %	398356110
34	NC_018191	CA	3	6	12934	12939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018191	CG	3	6	13801	13806	0 %	0 %	50 %	50 %	398356114
36	NC_018191	GC	3	6	13995	14000	0 %	0 %	50 %	50 %	398356114
37	NC_018191	GC	3	6	14305	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018191	GC	3	6	14549	14554	0 %	0 %	50 %	50 %	398356115
39	NC_018191	GC	3	6	14776	14781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018191	GC	4	8	15449	15456	0 %	0 %	50 %	50 %	398356116
41	NC_018191	CG	3	6	15499	15504	0 %	0 %	50 %	50 %	398356116
42	NC_018191	GA	3	6	15738	15743	50 %	0 %	50 %	0 %	398356117
43	NC_018191	GC	3	6	16304	16309	0 %	0 %	50 %	50 %	398356118
44	NC_018191	CG	3	6	17258	17263	0 %	0 %	50 %	50 %	398356118
45	NC_018191	CG	3	6	17952	17957	0 %	0 %	50 %	50 %	398356119
46	NC_018191	CG	3	6	18361	18366	0 %	0 %	50 %	50 %	398356119
47	NC_018191	CG	4	8	19079	19086	0 %	0 %	50 %	50 %	398356120
48	NC_018191	AG	3	6	19999	20004	50 %	0 %	50 %	0 %	398356121
49	NC_018191	GC	3	6	21348	21353	0 %	0 %	50 %	50 %	398356123
50	NC_018191	TC	3	6	22071	22076	0 %	50 %	0 %	50 %	398356124
51	NC_018191	CG	3	6	22452	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018191	CG	3	6	22575	22580	0 %	0 %	50 %	50 %	398356125
53	NC_018191	CT	3	6	22829	22834	0 %	50 %	0 %	50 %	398356125
54	NC_018191	CG	3	6	23019	23024	0 %	0 %	50 %	50 %	398356126
55	NC_018191	GC	3	6	23272	23277	0 %	0 %	50 %	50 %	398356126
56	NC_018191	GC	3	6	23338	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	398356126
57	NC_018191	CG	4	8	23842	23849	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
58	NC_018191	GC	3	6	24543	24548	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
59	NC_018191	CG	3	6	24607	24612	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
60	NC_018191	CG	4	8	24863	24870	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
61	NC_018191	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
62	NC_018191	CG	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	398356129
63	NC_018191	TG	3	6	25832	25837	0 %	50 %	50 %	0 %	398356130
64	NC_018191	CG	3	6	26001	26006	0 %	0 %	50 %	50 %	398356130
65	NC_018191	GA	3	6	26392	26397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018191	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018191	GC	3	6	27159	27164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018191	GC	4	8	27426	27433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018191	CG	3	6	27727	27732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018191	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	398356131
71	NC_018191	CT	3	6	28810	28815	0 %	50 %	0 %	50 %	398356132
72	NC_018191	CG	3	6	29104	29109	0 %	0 %	50 %	50 %	398356133
73	NC_018191	GC	3	6	29209	29214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018191	CT	4	8	30071	30078	0 %	50 %	0 %	50 %	398356134
75	NC_018191	CG	3	6	30231	30236	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
76	NC_018191	GA	3	6	30290	30295	50 %	0 %	50 %	0 %	398356134
77	NC_018191	CG	3	6	30821	30826	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
78	NC_018191	GC	3	6	30859	30864	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
79	NC_018191	GC	3	6	31354	31359	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
80	NC_018191	CG	3	6	32959	32964	0 %	0 %	50 %	50 %	398356135
81	NC_018191	AC	3	6	33876	33881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018191	CT	3	6	33950	33955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018191	TC	3	6	34545	34550	0 %	50 %	0 %	50 %	398356136
84	NC_018191	TG	3	6	34696	34701	0 %	50 %	50 %	0 %	398356137
85	NC_018191	GC	3	6	34848	34853	0 %	0 %	50 %	50 %	398356137
86	NC_018191	TC	3	6	35092	35097	0 %	50 %	0 %	50 %	398356137
87	NC_018191	CG	3	6	35135	35140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018191	CG	3	6	35231	35236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018191	CG	3	6	35323	35328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018191	TG	3	6	35348	35353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018191	CG	3	6	35414	35419	0 %	0 %	50 %	50 %	398356138
92	NC_018191	CG	3	6	36156	36161	0 %	0 %	50 %	50 %	398356138
93	NC_018191	TC	3	6	36594	36599	0 %	50 %	0 %	50 %	398356138
94	NC_018191	CG	3	6	36943	36948	0 %	0 %	50 %	50 %	398356138
95	NC_018191	GT	3	6	37363	37368	0 %	50 %	50 %	0 %	398356138
96	NC_018191	TC	3	6	37608	37613	0 %	50 %	0 %	50 %	398356138
97	NC_018191	GC	3	6	37915	37920	0 %	0 %	50 %	50 %	398356139
98	NC_018191	TC	3	6	38552	38557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018191	TC	3	6	38611	38616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018191	CG	3	6	39730	39735	0 %	0 %	50 %	50 %	398356142
101	NC_018191	CG	3	6	39847	39852	0 %	0 %	50 %	50 %	398356142
102	NC_018191	GC	3	6	39864	39869	0 %	0 %	50 %	50 %	398356142
103	NC_018191	CT	3	6	39879	39884	0 %	50 %	0 %	50 %	398356142
104	NC_018191	GC	3	6	39919	39924	0 %	0 %	50 %	50 %	398356142
105	NC_018191	GC	3	6	40197	40202	0 %	0 %	50 %	50 %	398356142
106	NC_018191	CG	3	6	40278	40283	0 %	0 %	50 %	50 %	398356142
107	NC_018191	CG	3	6	40791	40796	0 %	0 %	50 %	50 %	398356142
108	NC_018191	GT	3	6	41220	41225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018191	AC	3	6	41641	41646	50 %	0 %	0 %	50 %	398356145
110	NC_018191	AC	3	6	41787	41792	50 %	0 %	0 %	50 %	398356146
111	NC_018191	CG	3	6	42049	42054	0 %	0 %	50 %	50 %	398356146
112	NC_018191	AG	3	6	42716	42721	50 %	0 %	50 %	0 %	398356146
113	NC_018191	CG	3	6	42997	43002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018191	TC	3	6	43638	43643	0 %	50 %	0 %	50 %	398356147
115	NC_018191	CG	3	6	43773	43778	0 %	0 %	50 %	50 %	398356148
116	NC_018191	CG	3	6	44087	44092	0 %	0 %	50 %	50 %	398356148
117	NC_018191	GC	3	6	44302	44307	0 %	0 %	50 %	50 %	398356148
118	NC_018191	GC	3	6	44335	44340	0 %	0 %	50 %	50 %	398356148
119	NC_018191	AG	3	6	44603	44608	50 %	0 %	50 %	0 %	398356148
120	NC_018191	GC	3	6	44637	44642	0 %	0 %	50 %	50 %	398356148
121	NC_018191	GC	3	6	44963	44968	0 %	0 %	50 %	50 %	398356149
122	NC_018191	GC	3	6	45132	45137	0 %	0 %	50 %	50 %	398356149
123	NC_018191	CG	3	6	45609	45614	0 %	0 %	50 %	50 %	398356149
124	NC_018191	GC	3	6	45648	45653	0 %	0 %	50 %	50 %	398356149
125	NC_018191	AT	3	6	46200	46205	50 %	50 %	0 %	0 %	398356151
126	NC_018191	AC	3	6	46282	46287	50 %	0 %	0 %	50 %	398356151
127	NC_018191	AC	3	6	46742	46747	50 %	0 %	0 %	50 %	398356152
128	NC_018191	CA	3	6	46767	46772	50 %	0 %	0 %	50 %	398356152
129	NC_018191	AG	3	6	46798	46803	50 %	0 %	50 %	0 %	398356152
130	NC_018191	GC	3	6	46944	46949	0 %	0 %	50 %	50 %	398356152
131	NC_018191	CG	3	6	47081	47086	0 %	0 %	50 %	50 %	398356152
132	NC_018191	GC	3	6	47443	47448	0 %	0 %	50 %	50 %	398356154
133	NC_018191	CA	3	6	47473	47478	50 %	0 %	0 %	50 %	398356154
134	NC_018191	GC	3	6	47843	47848	0 %	0 %	50 %	50 %	398356156
135	NC_018191	CG	3	6	48246	48251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018191	CG	3	6	49263	49268	0 %	0 %	50 %	50 %	398356159
137	NC_018191	CG	3	6	49551	49556	0 %	0 %	50 %	50 %	398356159
138	NC_018191	TG	3	6	49987	49992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018191	CG	3	6	50029	50034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018191	TC	3	6	50144	50149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018191	GC	3	6	50620	50625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018191	GC	3	6	51543	51548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018191	CG	3	6	51624	51629	0 %	0 %	50 %	50 %	398356161
144	NC_018191	CG	3	6	52754	52759	0 %	0 %	50 %	50 %	398356163
145	NC_018191	CG	3	6	53001	53006	0 %	0 %	50 %	50 %	398356163
146	NC_018191	TC	3	6	53133	53138	0 %	50 %	0 %	50 %	398356163
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