MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018185	CGGT	2	8	105	112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018185	GGTG	2	8	469	476	0 %	25 %	75 %	0 %	398356049
3	NC_018185	ATCG	2	8	626	633	25 %	25 %	25 %	25 %	398356049
4	NC_018185	GCTG	2	8	775	782	0 %	25 %	50 %	25 %	398356049
5	NC_018185	TGCA	2	8	1133	1140	25 %	25 %	25 %	25 %	398356049
6	NC_018185	TCGG	2	8	1237	1244	0 %	25 %	50 %	25 %	398356049
7	NC_018185	GGTT	2	8	1258	1265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018185	ACTG	2	8	2158	2165	25 %	25 %	25 %	25 %	398356052
9	NC_018185	TGGC	2	8	2338	2345	0 %	25 %	50 %	25 %	398356054
10	NC_018185	GTCG	2	8	2583	2590	0 %	25 %	50 %	25 %	398356055
11	NC_018185	AGAA	2	8	2618	2625	75 %	0 %	25 %	0 %	398356055
12	NC_018185	GTCA	2	8	2695	2702	25 %	25 %	25 %	25 %	398356055
13	NC_018185	CCGT	2	8	2743	2750	0 %	25 %	25 %	50 %	398356055
14	NC_018185	CATT	2	8	2756	2763	25 %	50 %	0 %	25 %	398356055
15	NC_018185	CGGC	2	8	2868	2875	0 %	0 %	50 %	50 %	398356055
16	NC_018185	CTGG	2	8	2972	2979	0 %	25 %	50 %	25 %	398356056
17	NC_018185	TGCC	2	8	3131	3138	0 %	25 %	25 %	50 %	398356056
18	NC_018185	GCCA	2	8	3594	3601	25 %	0 %	25 %	50 %	398356057
19	NC_018185	TCCT	2	8	4683	4690	0 %	50 %	0 %	50 %	398356057
20	NC_018185	AGAA	2	8	5862	5869	75 %	0 %	25 %	0 %	398356058
21	NC_018185	ACGA	2	8	6811	6818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018185	CATA	2	8	7363	7370	50 %	25 %	0 %	25 %	398356061
23	NC_018185	GCGA	2	8	7434	7441	25 %	0 %	50 %	25 %	398356061
24	NC_018185	GCCG	2	8	7936	7943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.