Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257
Total Repeats: 24
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_018184 | AGGT | 2 | 8 | 352 | 359 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 398356041 |
2 | NC_018184 | TCGA | 2 | 8 | 767 | 774 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356041 |
3 | NC_018184 | GGCA | 2 | 8 | 796 | 803 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 398356041 |
4 | NC_018184 | GATG | 2 | 8 | 926 | 933 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 398356041 |
5 | NC_018184 | TCCG | 2 | 8 | 2041 | 2048 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356041 |
6 | NC_018184 | GATC | 2 | 8 | 2150 | 2157 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356041 |
7 | NC_018184 | ATGC | 2 | 8 | 2476 | 2483 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356041 |
8 | NC_018184 | TACC | 2 | 8 | 2690 | 2697 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 398356041 |
9 | NC_018184 | GCCT | 2 | 8 | 3723 | 3730 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | Non-Coding |
10 | NC_018184 | CCGT | 2 | 8 | 4162 | 4169 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356042 |
11 | NC_018184 | GGTG | 2 | 8 | 4405 | 4412 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | Non-Coding |
12 | NC_018184 | GATA | 2 | 8 | 4977 | 4984 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 398356044 |
13 | NC_018184 | ATTT | 2 | 8 | 5653 | 5660 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 398356044 |
14 | NC_018184 | GGCA | 2 | 8 | 5865 | 5872 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 398356044 |
15 | NC_018184 | GTCA | 2 | 8 | 6099 | 6106 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 398356045 |
16 | NC_018184 | CGCT | 2 | 8 | 6784 | 6791 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356045 |
17 | NC_018184 | TGGA | 2 | 8 | 8081 | 8088 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 398356046 |
18 | NC_018184 | CGTC | 2 | 8 | 8302 | 8309 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356046 |
19 | NC_018184 | ATGT | 2 | 8 | 8814 | 8821 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 398356047 |
20 | NC_018184 | TCCC | 2 | 8 | 8853 | 8860 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 398356047 |
21 | NC_018184 | AAAC | 2 | 8 | 8894 | 8901 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 398356047 |
22 | NC_018184 | GCAG | 2 | 8 | 9494 | 9501 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 398356047 |
23 | NC_018184 | CATT | 2 | 8 | 9563 | 9570 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 398356047 |
24 | NC_018184 | CGCA | 2 | 8 | 9772 | 9779 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 398356047 |