MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018183	CGGCG	2	10	1728	1737	0 %	0 %	60 %	40 %	398356029
2	NC_018183	AGCCG	2	10	3021	3030	20 %	0 %	40 %	40 %	398356033
3	NC_018183	ACGGT	2	10	3286	3295	20 %	20 %	40 %	20 %	398356033
4	NC_018183	TCGGA	2	10	4048	4057	20 %	20 %	40 %	20 %	398356033
5	NC_018183	ATCGA	2	10	4502	4511	40 %	20 %	20 %	20 %	398356034
6	NC_018183	CTTGC	2	10	5358	5367	0 %	40 %	20 %	40 %	398356035
7	NC_018183	CAACG	2	10	5637	5646	40 %	0 %	20 %	40 %	398356035
8	NC_018183	CACGC	2	10	5936	5945	20 %	0 %	20 %	60 %	398356035
9	NC_018183	CAGCG	2	10	6978	6987	20 %	0 %	40 %	40 %	398356037
10	NC_018183	GCGCC	2	10	7919	7928	0 %	0 %	40 %	60 %	398356037
11	NC_018183	CACAG	2	10	7960	7969	40 %	0 %	20 %	40 %	398356037
12	NC_018183	GCCGC	2	10	8199	8208	0 %	0 %	40 %	60 %	398356037
13	NC_018183	CGCAG	2	10	9739	9748	20 %	0 %	40 %	40 %	398356039

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.