MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018183	CATT	2	8	543	550	25 %	50 %	0 %	25 %	398356027
2	NC_018183	CGCC	2	8	856	863	0 %	0 %	25 %	75 %	398356028
3	NC_018183	GCCG	2	8	3120	3127	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
4	NC_018183	CCCG	2	8	3189	3196	0 %	0 %	25 %	75 %	398356033
5	NC_018183	CGCC	2	8	3374	3381	0 %	0 %	25 %	75 %	398356033
6	NC_018183	GCGA	2	8	3465	3472	25 %	0 %	50 %	25 %	398356033
7	NC_018183	GATG	2	8	3539	3546	25 %	25 %	50 %	0 %	398356033
8	NC_018183	GCTC	2	8	4011	4018	0 %	25 %	25 %	50 %	398356033
9	NC_018183	GGCC	2	8	4257	4264	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
10	NC_018183	GCCG	2	8	4342	4349	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
11	NC_018183	GCCA	2	8	5047	5054	25 %	0 %	25 %	50 %	398356035
12	NC_018183	ATGC	2	8	5135	5142	25 %	25 %	25 %	25 %	398356035
13	NC_018183	GGCG	2	8	5150	5157	0 %	0 %	75 %	25 %	398356035
14	NC_018183	GGCG	2	8	5705	5712	0 %	0 %	75 %	25 %	398356035
15	NC_018183	CCGC	2	8	6065	6072	0 %	0 %	25 %	75 %	398356035
16	NC_018183	GACG	2	8	6459	6466	25 %	0 %	50 %	25 %	398356035
17	NC_018183	CCGC	2	8	7154	7161	0 %	0 %	25 %	75 %	398356037
18	NC_018183	CAGA	2	8	7431	7438	50 %	0 %	25 %	25 %	398356037
19	NC_018183	CGGC	2	8	7718	7725	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
20	NC_018183	AGCA	2	8	8028	8035	50 %	0 %	25 %	25 %	398356037
21	NC_018183	CCAG	2	8	8636	8643	25 %	0 %	25 %	50 %	398356037
22	NC_018183	GTCG	2	8	9530	9537	0 %	25 %	50 %	25 %	398356039
23	NC_018183	GCCG	2	8	9629	9636	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.