MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018183	CG	3	6	940	945	0 %	0 %	50 %	50 %	398356028
2	NC_018183	AG	3	6	1018	1023	50 %	0 %	50 %	0 %	398356028
3	NC_018183	GC	3	6	1135	1140	0 %	0 %	50 %	50 %	398356028
4	NC_018183	GA	3	6	1786	1791	50 %	0 %	50 %	0 %	398356029
5	NC_018183	TC	3	6	2102	2107	0 %	50 %	0 %	50 %	398356029
6	NC_018183	GC	3	6	2994	2999	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
7	NC_018183	GC	3	6	3310	3315	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
8	NC_018183	GC	3	6	3456	3461	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
9	NC_018183	GC	3	6	3582	3587	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
10	NC_018183	GC	4	8	3668	3675	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
11	NC_018183	GC	4	8	3824	3831	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
12	NC_018183	GC	3	6	3853	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
13	NC_018183	GC	3	6	4067	4072	0 %	0 %	50 %	50 %	398356033
14	NC_018183	GC	3	6	4167	4172	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
15	NC_018183	CG	4	8	4433	4440	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
16	NC_018183	GC	3	6	4574	4579	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
17	NC_018183	GC	3	6	4658	4663	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
18	NC_018183	GC	3	6	4692	4697	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
19	NC_018183	GC	3	6	4977	4982	0 %	0 %	50 %	50 %	398356034
20	NC_018183	CG	3	6	5277	5282	0 %	0 %	50 %	50 %	398356035
21	NC_018183	CG	3	6	5334	5339	0 %	0 %	50 %	50 %	398356035
22	NC_018183	GC	3	6	5893	5898	0 %	0 %	50 %	50 %	398356035
23	NC_018183	TG	3	6	5920	5925	0 %	50 %	50 %	0 %	398356035
24	NC_018183	GC	3	6	6675	6680	0 %	0 %	50 %	50 %	398356036
25	NC_018183	GC	3	6	6810	6815	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
26	NC_018183	GC	3	6	7016	7021	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
27	NC_018183	GC	3	6	7036	7041	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
28	NC_018183	GC	3	6	7817	7822	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
29	NC_018183	GC	3	6	8127	8132	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
30	NC_018183	GC	5	10	8138	8147	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
31	NC_018183	CG	3	6	8474	8479	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
32	NC_018183	GC	3	6	8489	8494	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
33	NC_018183	CG	3	6	8667	8672	0 %	0 %	50 %	50 %	398356037
34	NC_018183	CG	3	6	8838	8843	0 %	0 %	50 %	50 %	398356038
35	NC_018183	GC	3	6	9104	9109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018183	GC	3	6	9358	9363	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039
37	NC_018183	GC	3	6	9428	9433	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039
38	NC_018183	CG	3	6	9579	9584	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039
39	NC_018183	GC	3	6	10235	10240	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039
40	NC_018183	GC	3	6	10250	10255	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039
41	NC_018183	CG	3	6	10297	10302	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039
42	NC_018183	GC	3	6	10403	10408	0 %	0 %	50 %	50 %	398356039
43	NC_018183	AG	3	6	10729	10734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018183	CG	3	6	10788	10793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.