Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257
Total Repeats: 37
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_018182 | GGCT | 2 | 8 | 88 | 95 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 398356014 |
2 | NC_018182 | CTTA | 2 | 8 | 216 | 223 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 398356014 |
3 | NC_018182 | TGGT | 2 | 8 | 547 | 554 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 398356014 |
4 | NC_018182 | CGAG | 2 | 8 | 559 | 566 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 398356014 |
5 | NC_018182 | TGAT | 2 | 8 | 1126 | 1133 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 398356014 |
6 | NC_018182 | CGGC | 2 | 8 | 1384 | 1391 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356014 |
7 | NC_018182 | CGGG | 2 | 8 | 1520 | 1527 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | Non-Coding |
8 | NC_018182 | CCGG | 2 | 8 | 1726 | 1733 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | Non-Coding |
9 | NC_018182 | TCAA | 2 | 8 | 2314 | 2321 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | Non-Coding |
10 | NC_018182 | GAAC | 2 | 8 | 2880 | 2887 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 398356015 |
11 | NC_018182 | GCGG | 2 | 8 | 3357 | 3364 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 398356015 |
12 | NC_018182 | CCTC | 2 | 8 | 3917 | 3924 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 398356015 |
13 | NC_018182 | AAGG | 2 | 8 | 4080 | 4087 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 398356016 |
14 | NC_018182 | GCCC | 2 | 8 | 4309 | 4316 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 398356016 |
15 | NC_018182 | CTTC | 2 | 8 | 4750 | 4757 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 398356016 |
16 | NC_018182 | TGGA | 2 | 8 | 4944 | 4951 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | Non-Coding |
17 | NC_018182 | CGCA | 2 | 8 | 4978 | 4985 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | Non-Coding |
18 | NC_018182 | ACCC | 2 | 8 | 6076 | 6083 | 25 % | 0 % | 0 % | 75 % | 398356019 |
19 | NC_018182 | CTCG | 2 | 8 | 6190 | 6197 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356019 |
20 | NC_018182 | ACCA | 2 | 8 | 6638 | 6645 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 398356019 |
21 | NC_018182 | CCAT | 3 | 12 | 6897 | 6908 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 398356020 |
22 | NC_018182 | TTCA | 2 | 8 | 6958 | 6965 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 398356021 |
23 | NC_018182 | CACG | 2 | 8 | 7234 | 7241 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 398356021 |
24 | NC_018182 | TGGC | 2 | 8 | 7574 | 7581 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 398356022 |
25 | NC_018182 | GCAA | 2 | 8 | 8370 | 8377 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 398356022 |
26 | NC_018182 | ACGA | 2 | 8 | 8552 | 8559 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 398356022 |
27 | NC_018182 | CGGC | 2 | 8 | 8565 | 8572 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356022 |
28 | NC_018182 | CGCT | 2 | 8 | 8734 | 8741 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 398356022 |
29 | NC_018182 | GCCG | 2 | 8 | 8767 | 8774 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356022 |
30 | NC_018182 | CGGC | 2 | 8 | 8919 | 8926 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356022 |
31 | NC_018182 | CCCG | 2 | 8 | 9552 | 9559 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 398356023 |
32 | NC_018182 | GGCG | 3 | 12 | 9610 | 9621 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 398356023 |
33 | NC_018182 | CGCC | 2 | 8 | 9941 | 9948 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 398356023 |
34 | NC_018182 | ATCA | 2 | 8 | 10071 | 10078 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 398356023 |
35 | NC_018182 | TCGT | 2 | 8 | 10145 | 10152 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 398356023 |
36 | NC_018182 | TCCT | 2 | 8 | 11234 | 11241 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 398356023 |
37 | NC_018182 | GGCC | 2 | 8 | 11693 | 11700 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 398356024 |