MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018181	AT	3	6	42	47	50 %	50 %	0 %	0 %	400752884
2	NC_018181	GA	3	6	524	529	50 %	0 %	50 %	0 %	400752886
3	NC_018181	CG	3	6	1759	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	400752888
4	NC_018181	GA	4	8	1896	1903	50 %	0 %	50 %	0 %	400752888
5	NC_018181	GA	3	6	1999	2004	50 %	0 %	50 %	0 %	400752888
6	NC_018181	AG	3	6	2115	2120	50 %	0 %	50 %	0 %	400752889
7	NC_018181	CG	3	6	2133	2138	0 %	0 %	50 %	50 %	400752889
8	NC_018181	CG	3	6	3379	3384	0 %	0 %	50 %	50 %	400752890
9	NC_018181	GC	3	6	3385	3390	0 %	0 %	50 %	50 %	400752890
10	NC_018181	CG	3	6	3595	3600	0 %	0 %	50 %	50 %	400752890
11	NC_018181	CG	3	6	4823	4828	0 %	0 %	50 %	50 %	400752891
12	NC_018181	GC	3	6	5583	5588	0 %	0 %	50 %	50 %	400752891
13	NC_018181	CG	3	6	5877	5882	0 %	0 %	50 %	50 %	400752892
14	NC_018181	CG	3	6	6085	6090	0 %	0 %	50 %	50 %	400752892
15	NC_018181	CG	3	6	6545	6550	0 %	0 %	50 %	50 %	400752892
16	NC_018181	CT	3	6	6654	6659	0 %	50 %	0 %	50 %	400752892
17	NC_018181	GC	3	6	6934	6939	0 %	0 %	50 %	50 %	400752892
18	NC_018181	CG	3	6	7288	7293	0 %	0 %	50 %	50 %	400752893
19	NC_018181	GC	3	6	7352	7357	0 %	0 %	50 %	50 %	400752893
20	NC_018181	TG	3	6	7381	7386	0 %	50 %	50 %	0 %	400752893
21	NC_018181	CG	4	8	7668	7675	0 %	0 %	50 %	50 %	400752893
22	NC_018181	CG	3	6	7802	7807	0 %	0 %	50 %	50 %	400752893
23	NC_018181	GC	3	6	7900	7905	0 %	0 %	50 %	50 %	400752893
24	NC_018181	GC	3	6	8458	8463	0 %	0 %	50 %	50 %	400752894
25	NC_018181	CG	3	6	9993	9998	0 %	0 %	50 %	50 %	400752896
26	NC_018181	CG	3	6	10295	10300	0 %	0 %	50 %	50 %	400752896
27	NC_018181	TG	3	6	10515	10520	0 %	50 %	50 %	0 %	400752897
28	NC_018181	CT	3	6	11127	11132	0 %	50 %	0 %	50 %	400752897
29	NC_018181	GC	4	8	11662	11669	0 %	0 %	50 %	50 %	400752898
30	NC_018181	TC	3	6	11719	11724	0 %	50 %	0 %	50 %	400752898
31	NC_018181	TC	3	6	13808	13813	0 %	50 %	0 %	50 %	400752902
32	NC_018181	CG	3	6	13845	13850	0 %	0 %	50 %	50 %	400752902
33	NC_018181	GC	3	6	14607	14612	0 %	0 %	50 %	50 %	400752904
34	NC_018181	CG	3	6	14645	14650	0 %	0 %	50 %	50 %	400752904
35	NC_018181	CG	3	6	14977	14982	0 %	0 %	50 %	50 %	400752904
36	NC_018181	GC	3	6	16857	16862	0 %	0 %	50 %	50 %	400752907
37	NC_018181	GC	3	6	17703	17708	0 %	0 %	50 %	50 %	400752907
38	NC_018181	GC	3	6	17759	17764	0 %	0 %	50 %	50 %	400752907
39	NC_018181	CG	3	6	18054	18059	0 %	0 %	50 %	50 %	400752907
40	NC_018181	CG	3	6	18970	18975	0 %	0 %	50 %	50 %	400752907

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.