MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018180	TGC	2	6	74	79	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018180	TTC	2	6	223	228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018180	CTC	2	6	307	312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018180	GCC	2	6	336	341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018180	CGC	2	6	372	377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018180	CGC	2	6	392	397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018180	CAT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018180	CGA	2	6	475	480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018180	CAC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018180	GAG	2	6	590	595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018180	CTC	2	6	842	847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018180	GCC	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018180	GAT	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018180	CGC	3	9	1001	1009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018180	CGG	3	9	1054	1062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018180	GGC	2	6	1145	1150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018180	CGC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018180	CTG	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018180	GGC	2	6	1246	1251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018180	CCG	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018180	ACG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018180	TCA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018180	GCA	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018180	CGC	2	6	1514	1519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018180	CAT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752837
26	NC_018180	CCG	2	6	1628	1633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752837
27	NC_018180	CGT	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752837
28	NC_018180	GGA	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752837
29	NC_018180	GCT	3	9	1749	1757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752838
30	NC_018180	TTG	2	6	1771	1776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752838
31	NC_018180	TGG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752838
32	NC_018180	ACG	3	9	1787	1795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752838
33	NC_018180	ACG	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752838
34	NC_018180	AGA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752838
35	NC_018180	TCA	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752838
36	NC_018180	ATC	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752838
37	NC_018180	GGC	2	6	2330	2335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018180	CAA	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018180	GAT	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018180	CTG	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018180	ATG	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018180	GAC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018180	GCA	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752840
44	NC_018180	CCA	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752841
45	NC_018180	AGA	2	6	2786	2791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752841
46	NC_018180	CCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752841
47	NC_018180	GAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752841
48	NC_018180	CGG	2	6	3033	3038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752841
49	NC_018180	AAG	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752841
50	NC_018180	GCA	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018180	CTC	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018180	CGC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018180	TCC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018180	CGC	2	6	3321	3326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018180	CGG	2	6	3330	3335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018180	GAC	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752842
57	NC_018180	GAA	2	6	3443	3448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752842
58	NC_018180	CGC	2	6	3485	3490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752842
59	NC_018180	GGC	3	9	3529	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752842
60	NC_018180	AGG	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752842
61	NC_018180	CGC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752842
62	NC_018180	CGC	2	6	3689	3694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752843
63	NC_018180	GCA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752843
64	NC_018180	CGC	2	6	3855	3860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752843
65	NC_018180	TCG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752843
66	NC_018180	CCT	2	6	4031	4036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018180	GTT	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752844
68	NC_018180	AAT	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018180	GCC	2	6	4198	4203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018180	GAG	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018180	CGA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752845
72	NC_018180	CGT	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752845
73	NC_018180	GCG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752845
74	NC_018180	ATG	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752845
75	NC_018180	TCG	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752845
76	NC_018180	GCG	2	6	4582	4587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752845
77	NC_018180	CGC	2	6	4676	4681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752845
78	NC_018180	GGA	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752845
79	NC_018180	GGC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018180	TCA	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752846
81	NC_018180	CCG	2	6	4813	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
82	NC_018180	GAT	3	9	4864	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752846
83	NC_018180	TTC	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752846
84	NC_018180	CGC	2	6	5022	5027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
85	NC_018180	AGG	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752846
86	NC_018180	ACG	2	6	5103	5108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
87	NC_018180	CAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752846
88	NC_018180	CCT	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752846
89	NC_018180	GAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752846
90	NC_018180	GCC	2	6	5272	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
91	NC_018180	GAT	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752846
92	NC_018180	TTG	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752846
93	NC_018180	GCG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752846
94	NC_018180	GCA	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
95	NC_018180	CGA	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
96	NC_018180	TCG	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752846
97	NC_018180	ACC	2	6	5891	5896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752846
98	NC_018180	CAC	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752846
99	NC_018180	TCG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752846
100	NC_018180	AGA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752846
101	NC_018180	GCC	2	6	6058	6063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
102	NC_018180	CGG	2	6	6160	6165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752846
103	NC_018180	CGC	2	6	6178	6183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
104	NC_018180	ACG	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
105	NC_018180	CGA	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
106	NC_018180	CGA	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
107	NC_018180	GAT	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752847
108	NC_018180	GCC	2	6	6755	6760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752847
109	NC_018180	GCC	2	6	6804	6809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752847
110	NC_018180	GAC	2	6	6849	6854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752847
111	NC_018180	GCC	2	6	6858	6863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752847
112	NC_018180	CCT	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752847
113	NC_018180	CCG	2	6	6918	6923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018180	CAG	2	6	6972	6977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018180	CTT	2	6	6982	6987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018180	CTC	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018180	CGG	2	6	7098	7103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018180	GAT	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752848
119	NC_018180	ATC	2	6	7270	7275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752848
120	NC_018180	CAG	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752848
121	NC_018180	GCC	3	9	7473	7481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752848
122	NC_018180	GAT	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752848
123	NC_018180	GGC	2	6	7604	7609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752848
124	NC_018180	ATC	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752848
125	NC_018180	GAA	2	6	7722	7727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752848
126	NC_018180	TGA	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752848
127	NC_018180	GGA	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752848
128	NC_018180	GAA	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752848
129	NC_018180	GTC	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752848
130	NC_018180	GGC	2	6	8138	8143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752848
131	NC_018180	CTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752848
132	NC_018180	AGC	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752848
133	NC_018180	CGA	2	6	8312	8317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752848
134	NC_018180	TGC	2	6	8371	8376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752848
135	NC_018180	AGG	2	6	8386	8391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752848
136	NC_018180	CGG	2	6	8422	8427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752848
137	NC_018180	CAC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752848
138	NC_018180	CGG	2	6	8712	8717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018180	GCG	2	6	8727	8732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018180	GGC	2	6	8744	8749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018180	GGA	2	6	8759	8764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018180	CGA	2	6	8857	8862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
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164	NC_018180	CGA	2	6	10015	10020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
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246	NC_018180	TCT	2	6	15454	15459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_018180	GAA	2	6	15547	15552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_018180	CAG	2	6	15681	15686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752854
249	NC_018180	TCC	2	6	15837	15842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_018180	AAC	2	6	15878	15883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_018180	GCG	2	6	15889	15894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_018180	CTT	2	6	15952	15957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_018180	GAT	2	6	16089	16094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752855
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256	NC_018180	CCG	2	6	16225	16230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752855
257	NC_018180	ATG	2	6	16231	16236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752855
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259	NC_018180	CTC	2	6	16500	16505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752855
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261	NC_018180	TCT	2	6	16540	16545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752855
262	NC_018180	CGA	2	6	16598	16603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752855
263	NC_018180	TCG	2	6	16629	16634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752855
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286	NC_018180	GCC	2	6	18812	18817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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294	NC_018180	GCG	2	6	19435	19440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752857
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382	NC_018180	GCG	2	6	24944	24949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_018180	CCT	2	6	25342	25347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752865
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392	NC_018180	TTG	2	6	25965	25970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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