MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018179	GACCAA	2	12	5377	5388	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	400752660
2	NC_018179	GCAGCC	2	12	5727	5738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	400752660
3	NC_018179	GAACTC	2	12	6249	6260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	400752661
4	NC_018179	CGATGC	2	12	11898	11909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	400752672
5	NC_018179	TCGAGG	2	12	14105	14116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	400752674
6	NC_018179	GCCTGC	2	12	17926	17937	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	400752676
7	NC_018179	CTGCGA	2	12	18845	18856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	400752678
8	NC_018179	TTGAGC	2	12	21720	21731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	400752682
9	NC_018179	CCAACC	2	12	31135	31146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752692
10	NC_018179	CTGCGC	2	12	44345	44356	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	400752705
11	NC_018179	CGTCAT	2	12	45092	45103	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	400752706
12	NC_018179	GCGCGA	2	12	49074	49085	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	400752711
13	NC_018179	GGCCGA	2	12	61186	61197	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	400752725
14	NC_018179	CAGCGC	2	12	62876	62887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	400752729
15	NC_018179	TTCGCT	2	12	70578	70589	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	400752739
16	NC_018179	TGCATC	2	12	80859	80870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	400752749
17	NC_018179	GGATAC	2	12	81890	81901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	400752750
18	NC_018179	GAAGCC	2	12	87651	87662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752760
19	NC_018179	TCCGCG	2	12	96153	96164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	400752769
20	NC_018179	CAAGCT	2	12	96652	96663	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	400752769
21	NC_018179	CCGAAG	2	12	103273	103284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752779
22	NC_018179	CGAAGC	2	12	113293	113304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752792
23	NC_018179	GTCCTC	2	12	113696	113707	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	400752792
24	NC_018179	GCGATC	2	12	114575	114586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	400752793
25	NC_018179	CGCCGG	2	12	114658	114669	0 %	0 %	50 %	50 %	400752793
26	NC_018179	CCTCGA	2	12	121049	121060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	400752797
27	NC_018179	TCGAAC	2	12	122586	122597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	400752798
28	NC_018179	CGAGCA	2	12	127318	127329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752802
29	NC_018179	CGGCCT	2	12	127591	127602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	400752802
30	NC_018179	GTTGCC	2	12	128721	128732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752803
31	NC_018179	CCCTTG	3	18	139684	139701	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	400752815
32	NC_018179	GGCGTC	2	12	139943	139954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	400752816
33	NC_018179	CTTGAC	2	12	149258	149269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	400752830
34	NC_018179	GGACAA	2	12	149647	149658	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	400752830

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.