MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 1802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018179	TGC	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752654
2	NC_018179	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752655
3	NC_018179	CTT	2	6	1251	1256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752655
4	NC_018179	GGA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752655
5	NC_018179	GTC	2	6	1521	1526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752655
6	NC_018179	GAA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752655
7	NC_018179	TTG	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752655
8	NC_018179	CTC	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752656
9	NC_018179	GCG	2	6	2105	2110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752656
10	NC_018179	GAT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
11	NC_018179	TAG	2	6	2515	2520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
12	NC_018179	CGA	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752657
13	NC_018179	GAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752657
14	NC_018179	CCA	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752657
15	NC_018179	AGC	2	6	2908	2913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752657
16	NC_018179	GCC	2	6	2928	2933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752657
17	NC_018179	GTC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752657
18	NC_018179	ATG	2	6	3039	3044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
19	NC_018179	CAT	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752658
20	NC_018179	CGC	2	6	3279	3284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752658
21	NC_018179	ATC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752658
22	NC_018179	GAT	2	6	3383	3388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752658
23	NC_018179	GAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752658
24	NC_018179	GAG	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752658
25	NC_018179	GCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752658
26	NC_018179	CGG	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752658
27	NC_018179	AGC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752659
28	NC_018179	CAG	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752659
29	NC_018179	CGG	2	6	4656	4661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
30	NC_018179	GGC	2	6	4687	4692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
31	NC_018179	CGG	2	6	4769	4774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
32	NC_018179	CCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752660
33	NC_018179	GGT	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752660
34	NC_018179	GAA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752660
35	NC_018179	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752660
36	NC_018179	CTG	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
37	NC_018179	CGT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
38	NC_018179	CGA	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
39	NC_018179	GAG	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752660
40	NC_018179	TCG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
41	NC_018179	CAT	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752660
42	NC_018179	TGC	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
43	NC_018179	TGG	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752660
44	NC_018179	CAG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
45	NC_018179	GCA	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
46	NC_018179	CGC	2	6	6072	6077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752661
47	NC_018179	GCC	2	6	6167	6172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752661
48	NC_018179	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752661
49	NC_018179	TCT	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752661
50	NC_018179	CTG	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752661
51	NC_018179	CGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752661
52	NC_018179	GTC	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752661
53	NC_018179	ATA	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400752661
54	NC_018179	TGA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752662
55	NC_018179	CGG	3	9	6416	6424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752662
56	NC_018179	GGA	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752662
57	NC_018179	CGT	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752662
58	NC_018179	TGC	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752663
59	NC_018179	CTT	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752663
60	NC_018179	ATG	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752663
61	NC_018179	TCC	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752663
62	NC_018179	AAT	2	6	7341	7346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400752663
63	NC_018179	CTG	2	6	7773	7778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752664
64	NC_018179	GCA	2	6	7787	7792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752664
65	NC_018179	GCC	2	6	7824	7829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752664
66	NC_018179	GAG	2	6	7878	7883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752664
67	NC_018179	CGG	2	6	7991	7996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752664
68	NC_018179	GCG	2	6	8057	8062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
69	NC_018179	GGC	2	6	8092	8097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
70	NC_018179	CGT	2	6	8231	8236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752665
71	NC_018179	ATT	2	6	8266	8271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400752665
72	NC_018179	GGC	2	6	8320	8325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
73	NC_018179	GTG	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752665
74	NC_018179	GCC	2	6	8408	8413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752665
75	NC_018179	CGG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752665
76	NC_018179	CTT	2	6	8488	8493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752665
77	NC_018179	CCA	2	6	8505	8510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752665
78	NC_018179	TCG	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752665
79	NC_018179	GAT	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752665
80	NC_018179	CGA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752665
81	NC_018179	GCT	3	9	8933	8941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752666
82	NC_018179	GCC	2	6	8982	8987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752666
83	NC_018179	TCG	2	6	8992	8997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752666
84	NC_018179	CGA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752666
85	NC_018179	AGG	2	6	9289	9294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752666
86	NC_018179	ATC	2	6	9350	9355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752667
87	NC_018179	TGC	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752667
88	NC_018179	CGG	2	6	9415	9420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752667
89	NC_018179	TCA	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752667
90	NC_018179	CGT	2	6	9502	9507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752667
91	NC_018179	TGT	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752667
92	NC_018179	ATC	2	6	9546	9551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752667
93	NC_018179	GCC	2	6	9664	9669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752668
94	NC_018179	AGG	2	6	9814	9819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752669
95	NC_018179	CTT	2	6	9822	9827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752669
96	NC_018179	CAA	2	6	9879	9884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752669
97	NC_018179	CGA	2	6	9918	9923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752669
98	NC_018179	TCC	2	6	9926	9931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752669
99	NC_018179	TCG	2	6	10185	10190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752670
100	NC_018179	ACT	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752671
101	NC_018179	GGC	2	6	10403	10408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752671
102	NC_018179	GCC	2	6	10542	10547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752671
103	NC_018179	GCC	2	6	10575	10580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752671
104	NC_018179	ACA	2	6	10612	10617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752671
105	NC_018179	GCG	2	6	10646	10651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752671
106	NC_018179	TTC	2	6	10674	10679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752671
107	NC_018179	ATC	2	6	10779	10784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752671
108	NC_018179	CAT	2	6	10982	10987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752671
109	NC_018179	TCA	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752671
110	NC_018179	CGC	2	6	11026	11031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752671
111	NC_018179	GCC	3	9	11096	11104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752671
112	NC_018179	CGA	2	6	11182	11187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752671
113	NC_018179	GAA	2	6	11279	11284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752671
114	NC_018179	GAA	2	6	11357	11362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752671
115	NC_018179	CCA	2	6	11371	11376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752671
116	NC_018179	TGT	2	6	11377	11382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752671
117	NC_018179	TGA	2	6	11398	11403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752671
118	NC_018179	CCG	2	6	11441	11446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752671
119	NC_018179	CGT	2	6	11609	11614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752672
120	NC_018179	GGA	2	6	11689	11694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752672
121	NC_018179	TGC	2	6	11833	11838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752672
122	NC_018179	ACC	2	6	11843	11848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752672
123	NC_018179	CCA	2	6	11861	11866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752672
124	NC_018179	GCT	2	6	12116	12121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752672
125	NC_018179	TCG	2	6	12386	12391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752673
126	NC_018179	CAT	2	6	12491	12496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752673
127	NC_018179	CGA	2	6	12602	12607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752673
128	NC_018179	AAG	2	6	12630	12635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752673
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498	NC_018179	CGT	2	6	40757	40762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752701
499	NC_018179	CGG	2	6	40856	40861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752701
500	NC_018179	GGC	2	6	40981	40986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752701

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