MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018179	GT	3	6	99	104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018179	AC	3	6	8892	8897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018179	TA	3	6	12191	12196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018179	TA	3	6	12263	12268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018179	GA	4	8	18195	18202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018179	TC	4	8	19630	19637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018179	AG	3	6	19769	19774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018179	TC	3	6	19981	19986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018179	AC	3	6	22173	22178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018179	CG	3	6	22626	22631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018179	CA	3	6	26377	26382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018179	AC	3	6	27607	27612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018179	CA	3	6	28254	28259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018179	AC	3	6	28356	28361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018179	GT	3	6	28659	28664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018179	CG	3	6	29055	29060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018179	CG	3	6	33181	33186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018179	TA	3	6	33471	33476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018179	AG	3	6	34732	34737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018179	GC	3	6	45544	45549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018179	GC	3	6	60381	60386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018179	CG	3	6	62171	62176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018179	CG	3	6	68938	68943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018179	GC	3	6	74736	74741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018179	CG	3	6	75012	75017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018179	GC	4	8	75514	75521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018179	GC	3	6	78517	78522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018179	CG	3	6	81157	81162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018179	AC	3	6	81215	81220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018179	GT	3	6	85174	85179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018179	CG	3	6	86961	86966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018179	GC	3	6	88298	88303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018179	GC	3	6	94190	94195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018179	GC	3	6	94273	94278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018179	GA	3	6	97719	97724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018179	AC	3	6	101411	101416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018179	CA	3	6	102617	102622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018179	TC	3	6	103974	103979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018179	TC	3	6	104365	104370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018179	CA	3	6	106245	106250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018179	AG	3	6	106986	106991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018179	TC	3	6	107022	107027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018179	GC	3	6	110292	110297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018179	CG	3	6	110320	110325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018179	CT	3	6	110980	110985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018179	GA	4	8	111090	111097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018179	CG	3	6	113053	113058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018179	CG	3	6	129256	129261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018179	GT	3	6	129302	129307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018179	AC	3	6	131129	131134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018179	CG	4	8	138922	138929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018179	CA	3	6	140129	140134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018179	CG	3	6	141301	141306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018179	CG	3	6	141704	141709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018179	GC	3	6	147968	147973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018179	CG	3	6	148051	148056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018179	CG	3	6	148578	148583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018179	TC	3	6	150971	150976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018179	AG	3	6	151069	151074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018179	AG	3	6	151711	151716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018179	CG	3	6	154303	154308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018179	GC	3	6	154663	154668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018179	GT	3	6	154916	154921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.