MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018179	A	6	6	90	95	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018179	A	6	6	892	897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018179	G	6	6	7074	7079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018179	G	6	6	7921	7926	0 %	0 %	100 %	0 %	400752664
5	NC_018179	T	6	6	9826	9831	0 %	100 %	0 %	0 %	400752669
6	NC_018179	T	6	6	10551	10556	0 %	100 %	0 %	0 %	400752671
7	NC_018179	T	6	6	11943	11948	0 %	100 %	0 %	0 %	400752672
8	NC_018179	A	6	6	14859	14864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018179	T	6	6	18517	18522	0 %	100 %	0 %	0 %	400752677
10	NC_018179	A	6	6	18923	18928	100 %	0 %	0 %	0 %	400752678
11	NC_018179	G	6	6	20186	20191	0 %	0 %	100 %	0 %	400752680
12	NC_018179	A	6	6	27104	27109	100 %	0 %	0 %	0 %	400752688
13	NC_018179	T	7	7	29245	29251	0 %	100 %	0 %	0 %	400752691
14	NC_018179	G	6	6	38227	38232	0 %	0 %	100 %	0 %	400752698
15	NC_018179	T	6	6	38476	38481	0 %	100 %	0 %	0 %	400752698
16	NC_018179	A	6	6	40821	40826	100 %	0 %	0 %	0 %	400752701
17	NC_018179	A	6	6	43376	43381	100 %	0 %	0 %	0 %	400752704
18	NC_018179	G	7	7	43655	43661	0 %	0 %	100 %	0 %	400752704
19	NC_018179	G	6	6	45409	45414	0 %	0 %	100 %	0 %	400752706
20	NC_018179	G	6	6	52044	52049	0 %	0 %	100 %	0 %	400752715
21	NC_018179	A	6	6	52777	52782	100 %	0 %	0 %	0 %	400752716
22	NC_018179	T	7	7	53885	53891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018179	A	6	6	54216	54221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018179	T	7	7	55502	55508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018179	T	6	6	55669	55674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018179	G	6	6	55810	55815	0 %	0 %	100 %	0 %	400752721
27	NC_018179	T	6	6	58436	58441	0 %	100 %	0 %	0 %	400752723
28	NC_018179	G	6	6	66476	66481	0 %	0 %	100 %	0 %	400752734
29	NC_018179	T	6	6	66724	66729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018179	T	6	6	67384	67389	0 %	100 %	0 %	0 %	400752736
31	NC_018179	T	6	6	67493	67498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018179	T	6	6	69819	69824	0 %	100 %	0 %	0 %	400752739
33	NC_018179	T	6	6	72901	72906	0 %	100 %	0 %	0 %	400752740
34	NC_018179	T	6	6	75461	75466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018179	T	6	6	75674	75679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018179	T	6	6	75831	75836	0 %	100 %	0 %	0 %	400752744
37	NC_018179	C	7	7	76539	76545	0 %	0 %	0 %	100 %	400752745
38	NC_018179	A	6	6	78153	78158	100 %	0 %	0 %	0 %	400752746
39	NC_018179	A	6	6	79378	79383	100 %	0 %	0 %	0 %	400752747
40	NC_018179	T	7	7	81288	81294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018179	T	7	7	83254	83260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018179	T	6	6	84309	84314	0 %	100 %	0 %	0 %	400752754
43	NC_018179	T	7	7	85406	85412	0 %	100 %	0 %	0 %	400752755
44	NC_018179	T	6	6	87133	87138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018179	A	6	6	89052	89057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018179	T	8	8	89502	89509	0 %	100 %	0 %	0 %	400752764
47	NC_018179	A	7	7	97607	97613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018179	C	6	6	103118	103123	0 %	0 %	0 %	100 %	400752779
49	NC_018179	A	6	6	104458	104463	100 %	0 %	0 %	0 %	400752781
50	NC_018179	A	6	6	105859	105864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018179	C	6	6	110901	110906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_018179	A	6	6	112087	112092	100 %	0 %	0 %	0 %	400752790
53	NC_018179	A	8	8	112681	112688	100 %	0 %	0 %	0 %	400752791
54	NC_018179	T	7	7	113680	113686	0 %	100 %	0 %	0 %	400752792
55	NC_018179	T	6	6	113714	113719	0 %	100 %	0 %	0 %	400752792
56	NC_018179	A	6	6	114535	114540	100 %	0 %	0 %	0 %	400752793
57	NC_018179	T	6	6	120301	120306	0 %	100 %	0 %	0 %	400752796
58	NC_018179	A	6	6	122839	122844	100 %	0 %	0 %	0 %	400752798
59	NC_018179	G	6	6	126337	126342	0 %	0 %	100 %	0 %	400752801
60	NC_018179	C	6	6	126737	126742	0 %	0 %	0 %	100 %	400752802
61	NC_018179	C	6	6	129002	129007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_018179	T	6	6	129491	129496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018179	A	7	7	129523	129529	100 %	0 %	0 %	0 %	400752804
64	NC_018179	A	6	6	136077	136082	100 %	0 %	0 %	0 %	400752810
65	NC_018179	G	6	6	143992	143997	0 %	0 %	100 %	0 %	400752823
66	NC_018179	T	6	6	146821	146826	0 %	100 %	0 %	0 %	400752827
67	NC_018179	T	6	6	148373	148378	0 %	100 %	0 %	0 %	400752828
68	NC_018179	A	6	6	149375	149380	100 %	0 %	0 %	0 %	400752830
69	NC_018179	A	6	6	149999	150004	100 %	0 %	0 %	0 %	400752830
70	NC_018179	G	6	6	150915	150920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018179	T	7	7	151671	151677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.