MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Melioribacter roseus P3M chromosome

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018178	GATAAT	2	12	155583	155594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018178	CCGATA	2	12	155616	155627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018178	TAATAC	2	12	165936	165947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018178	TATATT	2	12	166098	166109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018178	AAAATA	2	12	344967	344978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018178	TTTTCT	2	12	371033	371044	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018178	TTATAT	2	12	401010	401021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018178	TCCTTC	2	12	413334	413345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018178	AAATTT	2	12	429714	429725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018178	AACAAA	2	12	491288	491299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018178	TCTTTG	2	12	596943	596954	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018178	TTACGA	2	12	648554	648565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018178	GGCGAA	2	12	659761	659772	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018178	GAAAAA	2	12	662520	662531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018178	ATTAAT	2	12	662635	662646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018178	CGCTGT	2	12	665178	665189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018178	TCTTTT	2	12	665982	665993	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018178	TTTTTG	2	12	687856	687867	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018178	TAAATT	2	12	799391	799402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018178	CGATAT	2	12	815786	815797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018178	CAATTT	2	12	896903	896914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018178	TTTCTG	2	12	922008	922019	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018178	CGTCGG	2	12	929557	929568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018178	CGCGGG	2	12	943591	943602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018178	TGAATA	2	12	964778	964789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018178	GAAAAA	2	12	988507	988518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018178	TGGGTA	2	12	1031636	1031647	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018178	ACCGAA	2	12	1031676	1031687	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018178	TTTTAT	2	12	1058307	1058318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018178	ATTTAA	2	12	1080343	1080354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018178	GATAAA	2	12	1165249	1165260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018178	GGCTTT	2	12	1165618	1165629	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018178	ATTAAA	2	12	1320957	1320968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018178	TCTTTT	2	12	1337053	1337064	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018178	GGACCG	2	12	1337909	1337920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018178	TTCCGT	2	12	1359210	1359221	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018178	TTCATA	2	12	1359616	1359627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018178	ATAAGT	2	12	1363296	1363307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018178	GTTGAA	2	12	1400640	1400651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018178	TTTTCA	2	12	1495399	1495410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018178	ATTTTG	2	12	1498475	1498486	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018178	ATATAA	2	12	1540433	1540444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018178	AGCGTA	2	12	1540609	1540620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018178	GGAAAG	2	12	1598110	1598121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018178	AATTGT	2	12	1644018	1644029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018178	TGAACT	2	12	1678212	1678223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018178	ATAAAT	2	12	1773602	1773613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018178	AAAGTA	2	12	1822718	1822729	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018178	TTTATT	2	12	1843028	1843039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018178	AAATAA	2	12	1946126	1946137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018178	ATATTT	2	12	1956821	1956832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018178	CAACTG	2	12	2006083	2006094	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018178	TTTTTA	2	12	2035218	2035229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018178	GTGACC	2	12	2050034	2050045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018178	TGATAA	2	12	2051572	2051583	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018178	AAATAA	2	12	2086226	2086237	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018178	ATGAAA	2	12	2097590	2097601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018178	TTATTC	2	12	2109352	2109363	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018178	AAATTA	2	12	2119005	2119016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018178	TTGATT	2	12	2125639	2125650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018178	TTTTTA	2	12	2181787	2181798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018178	AGCAAA	2	12	2202941	2202952	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018178	ACGTAA	2	12	2297262	2297273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018178	ACGTAA	2	12	2297570	2297581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018178	TGTAAA	2	12	2339773	2339784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018178	AGAAAA	2	12	2366466	2366477	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018178	CTCTTC	2	12	2375466	2375477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018178	GAAAAG	2	12	2376427	2376438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018178	AATTAT	2	12	2398354	2398365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018178	GTTATT	2	12	2468483	2468494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018178	TCCCTC	2	12	2554256	2554267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018178	ATTTTT	2	12	2565236	2565247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018178	ATGTGA	2	12	2612438	2612449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018178	AATAAA	2	12	2620690	2620701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018178	TTCGGA	2	12	2638038	2638049	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018178	TTTCAT	2	12	2690293	2690304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018178	TTTTTC	2	12	2754901	2754912	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018178	ATATTT	2	12	2888351	2888362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018178	TAACAA	2	12	2942999	2943010	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018178	TATAAT	2	12	2981816	2981827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018178	TGTGGT	2	12	3006007	3006018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018178	TTTAAT	2	12	3028664	3028675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018178	CTATAG	2	12	3095993	3096004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018178	CTAATC	2	12	3122166	3122177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018178	TAAGAA	2	12	3125380	3125391	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018178	TTTAAT	2	12	3135367	3135378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018178	TATTTT	2	12	3163131	3163142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018178	ATAATT	2	12	3213540	3213551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018178	TCTAAA	2	12	3263401	3263412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018178	AATAAA	2	12	3282590	3282601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018178	TTTTAT	2	12	3297586	3297597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.