MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Melioribacter roseus P3M chromosome

Total Repeats: 1226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018178	TTTCCG	2	12	6362	6373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397689008
2	NC_018178	TTGCTA	2	12	8115	8126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397689011
3	NC_018178	CTTTCC	2	12	8813	8824	0 %	50 %	0 %	50 %	397689012
4	NC_018178	TCTTTT	2	12	13474	13485	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397689016
5	NC_018178	CCGATT	2	12	14330	14341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397689017
6	NC_018178	CTTTTA	2	12	15742	15753	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397689018
7	NC_018178	TTTCGA	2	12	16894	16905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397689020
8	NC_018178	CTTAGC	2	12	18380	18391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397689021
9	NC_018178	CTGTCC	2	12	26479	26490	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397689029
10	NC_018178	TCCGGT	2	12	28061	28072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397689031
11	NC_018178	TTTCAC	2	12	34162	34173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397689035
12	NC_018178	TCGGCC	2	12	34902	34913	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397689036
13	NC_018178	CCAATC	2	12	35956	35967	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	397689036
14	NC_018178	TCCCGC	2	12	36813	36824	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	397689037
15	NC_018178	TCTCTT	2	12	36913	36924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397689037
16	NC_018178	ATTTCA	2	12	37400	37411	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397689038
17	NC_018178	AACATA	2	12	39979	39990	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397689041
18	NC_018178	TTTCGT	2	12	43858	43869	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397689045
19	NC_018178	TTGTAA	2	12	47463	47474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397689047
20	NC_018178	CGAAAA	2	12	60938	60949	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397689058
21	NC_018178	ATTGTA	2	12	64251	64262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397689061
22	NC_018178	GGCTTT	2	12	69287	69298	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397689066
23	NC_018178	TAATTT	2	12	72504	72515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397689069
24	NC_018178	TTTCTT	2	12	74576	74587	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397689072
25	NC_018178	TTTAAT	2	12	75762	75773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397689074
26	NC_018178	GATATC	2	12	76857	76868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397689074
27	NC_018178	CACTTC	2	12	79194	79205	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397689075
28	NC_018178	ATACCG	2	12	82706	82717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397689077
29	NC_018178	CGTTTC	2	12	92617	92628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397689084
30	NC_018178	CGTTGC	2	12	93337	93348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397689084
31	NC_018178	TCTTTC	2	12	96073	96084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397689085
32	NC_018178	ATTAAT	2	12	104699	104710	50 %	50 %	0 %	0 %	397689088
33	NC_018178	CGCCAG	2	12	106156	106167	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397689089
34	NC_018178	TCCGTC	2	12	109591	109602	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397689090
35	NC_018178	TATAAT	2	12	113258	113269	50 %	50 %	0 %	0 %	397689092
36	NC_018178	CGGCGT	2	12	114425	114436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397689092
37	NC_018178	TCGATT	2	12	120066	120077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397689095
38	NC_018178	TTTCTT	2	12	122022	122033	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397689097
39	NC_018178	TTGAGG	2	12	122254	122265	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397689098
40	NC_018178	CTGCAA	2	12	122640	122651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397689098
41	NC_018178	AATCGA	2	12	129508	129519	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397689110
42	NC_018178	TATTTT	2	12	132985	132996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397689112
43	NC_018178	GTACTC	2	12	133081	133092	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397689112
44	NC_018178	TTTCTC	2	12	134603	134614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397689113
45	NC_018178	CGTAAC	2	12	137917	137928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397689114
46	NC_018178	GTATAA	2	12	138915	138926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397689115
47	NC_018178	CATAAT	2	12	139597	139608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397689115
48	NC_018178	CCGGCG	2	12	140481	140492	0 %	0 %	50 %	50 %	397689115
49	NC_018178	AGTCGA	2	12	143097	143108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397689116
50	NC_018178	CAAACA	2	12	143169	143180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397689116
51	NC_018178	TTTTGT	2	12	158238	158249	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	397689123
52	NC_018178	AAATAA	2	12	159499	159510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397689124
53	NC_018178	TCGTAT	2	12	161819	161830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397689125
54	NC_018178	CCAGAA	2	12	163756	163767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397689126
55	NC_018178	TTCAAG	2	12	164592	164603	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397689126
56	NC_018178	TGCATC	2	12	173191	173202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397689134
57	NC_018178	CATTAT	2	12	173361	173372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397689134
58	NC_018178	AAACAA	2	12	180264	180275	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	397689139
59	NC_018178	TAAGAA	2	12	181694	181705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397689141
60	NC_018178	GCAAGA	2	12	182068	182079	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397689142
61	NC_018178	TCGATT	2	12	186999	187010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397689146
62	NC_018178	CGAAAT	2	12	190654	190665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397689150
63	NC_018178	TTCTGG	2	12	193758	193769	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397689153
64	NC_018178	ATAACG	2	12	199299	199310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397689158
65	NC_018178	GCGCCT	2	12	199758	199769	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397689158
66	NC_018178	CATCGG	2	12	202940	202951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397689162
67	NC_018178	TAATAT	2	12	205446	205457	50 %	50 %	0 %	0 %	397689165
68	NC_018178	TAAAAA	2	12	205823	205834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397689166
69	NC_018178	AATTCC	2	12	212933	212944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397689173
70	NC_018178	TTTCAT	2	12	215479	215490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397689175
71	NC_018178	ATTTAT	2	12	216299	216310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397689176
72	NC_018178	TCGCCT	2	12	216773	216784	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397689176
73	NC_018178	TCGCCG	2	12	217026	217037	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397689177
74	NC_018178	TCTTTG	2	12	220729	220740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397689178
75	NC_018178	GCGGTT	2	12	229569	229580	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397689190
76	NC_018178	TTTCGT	2	12	230732	230743	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397689192
77	NC_018178	GTAACT	2	12	231289	231300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397689192
78	NC_018178	TGTTTA	2	12	233087	233098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397689196
79	NC_018178	TCGAGC	2	12	234065	234076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397689198
80	NC_018178	CCTTTG	2	12	237282	237293	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397689204
81	NC_018178	TCGAAA	2	12	243557	243568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397689218
82	NC_018178	ACTTTA	2	12	244261	244272	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397689219
83	NC_018178	GACCGA	2	12	245447	245458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397689221
84	NC_018178	CTCTTT	2	12	246038	246049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397689221
85	NC_018178	TTCAAA	2	12	246787	246798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397689222
86	NC_018178	CAAAGC	2	12	248550	248561	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397689223
87	NC_018178	TGTTCG	2	12	251567	251578	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397689225
88	NC_018178	CAGACC	2	12	253630	253641	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397689226
89	NC_018178	TCGAGA	2	12	254660	254671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397689226
90	NC_018178	CAGCGG	2	12	261888	261899	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397689234
91	NC_018178	GTTTCG	2	12	268858	268869	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397689240
92	NC_018178	TTTGAT	2	12	271088	271099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397689242
93	NC_018178	CCCATT	2	12	272003	272014	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397689243
94	NC_018178	GTCCCG	2	12	275673	275684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397689245
95	NC_018178	GAAGGC	2	12	276770	276781	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	397689246
96	NC_018178	CGCCAG	2	12	277420	277431	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397689246
97	NC_018178	ATTTTT	2	12	278734	278745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397689247
98	NC_018178	GTTTCG	2	12	279824	279835	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397689247
99	NC_018178	ATTTTT	2	12	281477	281488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397689247
100	NC_018178	TTGCAA	2	12	282141	282152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397689249
101	NC_018178	TTCGAG	2	12	282760	282771	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397689249
102	NC_018178	ATGTCG	2	12	282980	282991	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397689249
103	NC_018178	TACCCA	2	12	283645	283656	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	397689249
104	NC_018178	TGTAAT	2	12	287393	287404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397689252
105	NC_018178	TTTCTT	2	12	288521	288532	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397689253
106	NC_018178	AGTCCC	2	12	288741	288752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397689254
107	NC_018178	CTGCCG	2	12	289527	289538	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397689254
108	NC_018178	ATGAAA	2	12	291499	291510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397689255
109	NC_018178	ATCGAA	2	12	292315	292326	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397689256
110	NC_018178	TCTTTC	2	12	294780	294791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397689257
111	NC_018178	ATCTTT	2	12	296783	296794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397689258
112	NC_018178	TATTCA	2	12	300168	300179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397689262
113	NC_018178	CTGAAT	2	12	304122	304133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397689266
114	NC_018178	CAATAT	2	12	304163	304174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397689266
115	NC_018178	ACAACC	2	12	310107	310118	50 %	0 %	0 %	50 %	397689274
116	NC_018178	CAAATT	2	12	310174	310185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397689274
117	NC_018178	AACTTC	2	12	312107	312118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397689275
118	NC_018178	GCTTCG	2	12	313033	313044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397689277
119	NC_018178	GCTGTC	2	12	319844	319855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397689287
120	NC_018178	TGCGCC	2	12	321312	321323	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397689288
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232	NC_018178	CGTAAT	2	12	594658	594669	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397689527
233	NC_018178	ATCAAA	2	12	595805	595816	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397689529
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