MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Melioribacter roseus P3M chromosome

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018178	ATTTG	2	10	24865	24874	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018178	GATAA	2	10	24896	24905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018178	ATTTA	2	10	77310	77319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018178	ATTTA	2	10	77446	77455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018178	ATTTA	2	10	77582	77591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018178	ATTTA	2	10	77718	77727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018178	ATTTA	2	10	77854	77863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018178	TGTTA	2	10	81606	81615	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018178	ATTAA	2	10	112064	112073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018178	AAAGA	2	10	131959	131968	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018178	GAGGG	2	10	155866	155875	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018178	TAATT	2	10	162601	162610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018178	TTGTG	2	10	165373	165382	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018178	CTTTA	2	10	166136	166145	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018178	AATTA	2	10	166325	166334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018178	GTTTT	2	10	167727	167736	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018178	ATCTT	2	10	172612	172621	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018178	AAAAT	2	10	189228	189237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018178	TTTAA	2	10	193956	193965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018178	ATTAT	2	10	273458	273467	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018178	ATATT	2	10	285397	285406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018178	CTCGG	2	10	286024	286033	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018178	CTTTT	2	10	305980	305989	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018178	AATGA	2	10	319613	319622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018178	GCTTT	2	10	327244	327253	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018178	GGATT	2	10	335461	335470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018178	GAAAA	2	10	344883	344892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018178	AAACC	2	10	345416	345425	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018178	AATAT	2	10	345442	345451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018178	AAAGA	2	10	345472	345481	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018178	ATCTT	2	10	370958	370967	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018178	CTTTC	2	10	390721	390730	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018178	TTTAA	2	10	403045	403054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018178	TTTCG	2	10	404149	404158	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018178	CCATA	2	10	404854	404863	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018178	CCTTA	2	10	405363	405372	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018178	TTTTA	2	10	418079	418088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018178	AAGAA	2	10	418194	418203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018178	ATTTT	2	10	420897	420906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018178	TCATA	2	10	429668	429677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018178	TAAAA	2	10	429684	429693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018178	TAAAA	2	10	438081	438090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018178	GGAAT	2	10	466303	466312	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018178	AATGA	2	10	521222	521231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018178	GACAG	2	10	526882	526891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018178	AGTAA	2	10	571901	571910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018178	GAAAA	2	10	572876	572885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018178	AGCAA	2	10	576822	576831	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018178	CTAAA	2	10	579203	579212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018178	TATTT	2	10	581894	581903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018178	GAGCG	2	10	582137	582146	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018178	GAGCG	2	10	582297	582306	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018178	GAGCG	2	10	582613	582622	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018178	AATTT	2	10	584767	584776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018178	CGCTC	2	10	591898	591907	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018178	GAGCG	2	10	597073	597082	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018178	GAGCG	2	10	603779	603788	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018178	AAACA	2	10	603804	603813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018178	CGGAT	2	10	604081	604090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018178	TTAAA	2	10	608961	608970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018178	TTTTG	2	10	613301	613310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018178	AATTA	2	10	636528	636537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018178	CCAAG	2	10	648233	648242	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018178	TATGT	2	10	658756	658765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018178	ACCAC	2	10	659881	659890	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_018178	AATTA	2	10	661064	661073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018178	ATTTA	2	10	663608	663617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018178	ATAAA	2	10	665210	665219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018178	AAAAT	2	10	666283	666292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018178	TGTTA	2	10	681680	681689	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018178	AATTA	2	10	684731	684740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018178	TAAGA	2	10	705208	705217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018178	TAAAA	2	10	705240	705249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018178	ATATA	2	10	712697	712706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018178	AACAA	2	10	712876	712885	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018178	GAAAT	2	10	715972	715981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018178	AGTTA	2	10	717471	717480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018178	AGGAA	2	10	717671	717680	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018178	AAATA	2	10	766552	766561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018178	ATTTT	2	10	784460	784469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018178	GAAAA	2	10	816042	816051	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018178	GCTAC	2	10	873184	873193	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018178	AATTA	2	10	884889	884898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018178	GTTTT	2	10	890935	890944	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018178	GAGCA	2	10	891051	891060	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018178	TCCGG	2	10	891167	891176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018178	ACGGC	2	10	899191	899200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018178	ATTTA	2	10	915518	915527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018178	CATAA	2	10	916158	916167	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018178	TTCCA	2	10	916182	916191	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018178	AATTT	2	10	922188	922197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018178	AAAGT	2	10	923228	923237	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018178	AACAT	2	10	928044	928053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018178	CTTCG	2	10	928618	928627	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018178	ACCCT	2	10	929845	929854	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_018178	TCGAG	2	10	930470	930479	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018178	ATAAA	2	10	968247	968256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018178	TTATT	2	10	986943	986952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018178	AACTA	2	10	986977	986986	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018178	GACTT	2	10	1000945	1000954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018178	TTTAC	2	10	1011034	1011043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018178	TAGAT	2	10	1011066	1011075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018178	ATTTG	2	10	1030614	1030623	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018178	AATTT	2	10	1036500	1036509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018178	ATTTC	2	10	1036945	1036954	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018178	AATTT	2	10	1040263	1040272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018178	GTTGC	2	10	1040329	1040338	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018178	ATTTT	2	10	1047151	1047160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018178	CCTTT	2	10	1150032	1150041	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018178	CGATC	2	10	1165261	1165270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018178	TCTTT	2	10	1165665	1165674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018178	ATCGA	2	10	1165846	1165855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018178	ATCCC	2	10	1168670	1168679	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_018178	AAAAT	2	10	1177250	1177259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018178	TAAAA	2	10	1187418	1187427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018178	GGAAA	2	10	1192268	1192277	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018178	TTTTC	2	10	1192728	1192737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018178	GAAAA	2	10	1200350	1200359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018178	TAAAA	2	10	1202346	1202355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018178	TTTTA	2	10	1213732	1213741	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018178	TTTAA	2	10	1219856	1219865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018178	TGAAA	2	10	1225043	1225052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018178	TATAC	2	10	1231219	1231228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018178	AGCGA	2	10	1235883	1235892	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018178	CTTCC	2	10	1236213	1236222	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_018178	GAACA	2	10	1236256	1236265	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018178	GAAAA	2	10	1240519	1240528	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018178	CCCCG	2	10	1251232	1251241	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
129	NC_018178	TGTCA	2	10	1251263	1251272	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018178	TTCTG	2	10	1264949	1264958	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018178	ATTTT	2	10	1265055	1265064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018178	TGATT	2	10	1265082	1265091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018178	GAAAG	2	10	1266678	1266687	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018178	AATTA	2	10	1288003	1288012	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018178	TCGGT	2	10	1320913	1320922	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018178	AAAAT	2	10	1329890	1329899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018178	GTTCG	2	10	1336785	1336794	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018178	ACCAA	2	10	1354634	1354643	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_018178	ATAAA	2	10	1355348	1355357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018178	TTTGT	3	15	1357046	1357060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018178	TCGTT	2	10	1358520	1358529	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018178	ATTTT	2	10	1360799	1360808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018178	TTCTT	2	10	1361560	1361569	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018178	CTTTT	2	10	1361670	1361679	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018178	CTTTT	2	10	1362169	1362178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018178	TATTT	2	10	1362596	1362605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_018178	ATTAA	2	10	3282571	3282580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_018178	AAGAA	2	10	3287712	3287721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.