MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri DSM 10701 chromosome

Total Repeats: 65380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018177	GCA	2	6	476	481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
2	NC_018177	CGA	2	6	563	568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
3	NC_018177	GCA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
4	NC_018177	CCT	2	6	706	711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685124
5	NC_018177	GCG	2	6	798	803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685124
6	NC_018177	TCG	2	6	937	942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
7	NC_018177	CGC	2	6	968	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685124
8	NC_018177	GGC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685124
9	NC_018177	AGA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685124
10	NC_018177	GGT	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685124
11	NC_018177	GCT	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
12	NC_018177	CGA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
13	NC_018177	AAG	2	6	1239	1244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685124
14	NC_018177	AGG	2	6	1255	1260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397685124
15	NC_018177	GGC	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685124
16	NC_018177	CAG	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
17	NC_018177	GCC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685124
18	NC_018177	TGA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685124
19	NC_018177	ATG	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685124
20	NC_018177	TTC	2	6	1482	1487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685124
21	NC_018177	TAC	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685124
22	NC_018177	CGT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
23	NC_018177	TGG	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685124
24	NC_018177	CTG	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
25	NC_018177	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397685125
26	NC_018177	TGG	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685125
27	NC_018177	GTC	2	6	2016	2021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
28	NC_018177	GCG	2	6	2024	2029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685125
29	NC_018177	CCG	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685125
30	NC_018177	CAG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685125
31	NC_018177	TGC	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
32	NC_018177	TCA	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685125
33	NC_018177	TGG	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685125
34	NC_018177	TGG	3	9	2725	2733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685125
35	NC_018177	GCT	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
36	NC_018177	GCT	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
37	NC_018177	CAA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685125
38	NC_018177	GAA	2	6	2859	2864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685125
39	NC_018177	CTG	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
40	NC_018177	TGA	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685125
41	NC_018177	CAG	2	6	2993	2998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685125
42	NC_018177	ACG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685125
43	NC_018177	CGT	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
44	NC_018177	GCA	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
45	NC_018177	CGG	2	6	3301	3306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685126
46	NC_018177	GCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685126
47	NC_018177	CCT	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685126
48	NC_018177	GGC	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685126
49	NC_018177	TAC	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685126
50	NC_018177	GCC	2	6	3783	3788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685126
51	NC_018177	CAG	2	6	3897	3902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
52	NC_018177	TGG	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685126
53	NC_018177	TCG	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685126
54	NC_018177	GAC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
55	NC_018177	TTG	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397685126
56	NC_018177	TCA	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685126
57	NC_018177	GAC	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
58	NC_018177	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
59	NC_018177	GCT	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
60	NC_018177	TCA	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685127
61	NC_018177	CGG	2	6	4486	4491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
62	NC_018177	CGG	2	6	4522	4527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
63	NC_018177	CGT	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
64	NC_018177	GCT	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
65	NC_018177	CGG	2	6	4701	4706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
66	NC_018177	TCC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685127
67	NC_018177	TGA	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
68	NC_018177	GGC	2	6	4841	4846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
69	NC_018177	CAA	2	6	4876	4881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685127
70	NC_018177	GAT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
71	NC_018177	CAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685127
72	NC_018177	AAG	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685127
73	NC_018177	CCA	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397685127
74	NC_018177	TGA	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
75	NC_018177	AGT	2	6	5293	5298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
76	NC_018177	GAT	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
77	NC_018177	CGC	2	6	5314	5319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685127
78	NC_018177	GGC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
79	NC_018177	CGC	2	6	5360	5365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685127
80	NC_018177	GAT	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
81	NC_018177	CTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685127
82	NC_018177	ACA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685127
83	NC_018177	CAT	4	12	5659	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685127
84	NC_018177	CTT	3	9	5719	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685127
85	NC_018177	GCC	2	6	5776	5781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685127
86	NC_018177	GAC	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685127
87	NC_018177	AGC	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685127
88	NC_018177	AGC	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685127
89	NC_018177	GAA	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685127
90	NC_018177	TTC	2	6	6224	6229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685127
91	NC_018177	TCT	2	6	6280	6285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685127
92	NC_018177	CCT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685127
93	NC_018177	TGA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
94	NC_018177	CGC	2	6	6377	6382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685127
95	NC_018177	ACC	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397685127
96	NC_018177	AAC	3	9	7440	7448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685128
97	NC_018177	CTT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685128
98	NC_018177	GTT	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397685128
99	NC_018177	CAT	2	6	7995	8000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685129
100	NC_018177	CGA	2	6	8012	8017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685129
101	NC_018177	CGT	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685129
102	NC_018177	TGG	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685129
103	NC_018177	AGC	2	6	8360	8365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685129
104	NC_018177	ATG	2	6	8552	8557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685129
105	NC_018177	GCC	2	6	8590	8595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685129
106	NC_018177	ACC	2	6	8596	8601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397685129
107	NC_018177	GCT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685129
108	NC_018177	TCC	3	9	8720	8728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685129
109	NC_018177	ACG	2	6	8784	8789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685129
110	NC_018177	CTC	2	6	8896	8901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685129
111	NC_018177	GCC	2	6	8944	8949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685129
112	NC_018177	CTG	2	6	8995	9000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685129
113	NC_018177	TTG	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397685129
114	NC_018177	GTA	2	6	9070	9075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685129
115	NC_018177	CTT	2	6	9088	9093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685129
116	NC_018177	GCA	2	6	9222	9227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685129
117	NC_018177	TCA	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685129
118	NC_018177	TCT	3	9	9342	9350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685129
119	NC_018177	CGC	2	6	9351	9356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685129
120	NC_018177	GCC	2	6	9490	9495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685129
121	NC_018177	TAA	2	6	9584	9589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397685129
122	NC_018177	TCT	2	6	9594	9599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685129
123	NC_018177	CCA	2	6	9684	9689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397685129
124	NC_018177	TTC	2	6	9739	9744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685129
125	NC_018177	TCT	2	6	9780	9785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685129
126	NC_018177	AAC	2	6	9791	9796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685129
127	NC_018177	TCC	2	6	9911	9916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685129
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129	NC_018177	GCC	2	6	9976	9981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685129
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253	NC_018177	GTC	2	6	18832	18837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685136
254	NC_018177	TGA	2	6	18876	18881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685136
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256	NC_018177	CAT	2	6	19023	19028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685136
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259	NC_018177	CAT	2	6	19236	19241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685136
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273	NC_018177	GTG	3	9	20353	20361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685136
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281	NC_018177	TGG	2	6	20671	20676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685137
282	NC_018177	GAA	2	6	20684	20689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685137
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499	NC_018177	GCA	2	6	38345	38350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685156
500	NC_018177	CGG	2	6	38395	38400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685156

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