MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma wenyonii str. Massachusetts chromosome

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018149	CTAAGA	2	12	983	994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677604
2	NC_018149	AAAAGA	2	12	2589	2600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397677606
3	NC_018149	CTAGAA	2	12	5479	5490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677608
4	NC_018149	GTCATA	2	12	5622	5633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397677609
5	NC_018149	TTTATC	2	12	6872	6883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397677612
6	NC_018149	GAGTTG	2	12	7589	7600	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397677613
7	NC_018149	GAAGAT	2	12	7615	7626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397677613
8	NC_018149	AAAAGA	2	12	7800	7811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397677613
9	NC_018149	TGGCTC	2	12	9897	9908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677615
10	NC_018149	TTTCCT	2	12	12553	12564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677617
11	NC_018149	ACTTCA	2	12	17808	17819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677623
12	NC_018149	ATCTCA	2	12	20508	20519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677624
13	NC_018149	TTTCAC	2	12	22264	22275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677626
14	NC_018149	TTTCAC	2	12	25545	25556	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677628
15	NC_018149	ATTGAT	2	12	33699	33710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397677633
16	NC_018149	CTAAAG	2	12	34151	34162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677634
17	NC_018149	TAGTTG	2	12	39027	39038	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397677639
18	NC_018149	TCAAGA	2	12	46416	46427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677647
19	NC_018149	TTGAAA	2	12	46758	46769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397677647
20	NC_018149	ATTTCA	2	12	47914	47925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397677649
21	NC_018149	TGGTTG	2	12	49688	49699	0 %	50 %	50 %	0 %	397677651
22	NC_018149	CAACTT	2	12	53231	53242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677653
23	NC_018149	ATGTGC	2	12	55562	55573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397677655
24	NC_018149	CTAGAA	2	12	62669	62680	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677662
25	NC_018149	CTAAGA	2	12	66610	66621	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677667
26	NC_018149	AATACT	2	12	68095	68106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397677668
27	NC_018149	AAAGTA	2	12	73347	73358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397677671
28	NC_018149	TCTTCC	2	12	75210	75221	0 %	50 %	0 %	50 %	397677673
29	NC_018149	AGAGTT	2	12	76839	76850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677676
30	NC_018149	AACTAA	2	12	77560	77571	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397677677
31	NC_018149	TTCCTT	2	12	78644	78655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677678
32	NC_018149	TAAAAG	2	12	82228	82239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397677683
33	NC_018149	CTTACT	2	12	83987	83998	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677686
34	NC_018149	TCAACT	2	12	84122	84133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677686
35	NC_018149	TGAGTG	2	12	85034	85045	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397677686
36	NC_018149	AGAGAT	2	12	85244	85255	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397677686
37	NC_018149	CTCTAA	2	12	93701	93712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677695
38	NC_018149	GTATTT	2	12	96329	96340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397677699
39	NC_018149	AAGAAA	2	12	96657	96668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397677700
40	NC_018149	AAGAAA	2	12	96783	96794	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397677700
41	NC_018149	AAATAC	2	12	98842	98853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397677702
42	NC_018149	CTCAAA	2	12	100314	100325	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397677704
43	NC_018149	GTTATT	2	12	102552	102563	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397677704
44	NC_018149	TAGATA	2	12	106428	106439	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397677708
45	NC_018149	ACTAAG	2	12	107465	107476	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677709
46	NC_018149	TCTAGT	2	12	112757	112768	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397677715
47	NC_018149	GCTATA	2	12	113723	113734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397677716
48	NC_018149	TCTTTT	2	12	116407	116418	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397677718
49	NC_018149	TTCATC	2	12	118609	118620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677719
50	NC_018149	TTTGTT	2	12	120715	120726	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	397677721
51	NC_018149	GAGGGA	2	12	120736	120747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677721
52	NC_018149	GGTTTC	2	12	121518	121529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397677721
53	NC_018149	AATAAG	2	12	129951	129962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397677728
54	NC_018149	TTGGAG	2	12	131699	131710	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397677731
55	NC_018149	TCTTTT	2	12	133239	133250	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397677733
56	NC_018149	GATAGT	2	12	134674	134685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677733
57	NC_018149	TTTTTA	2	12	137570	137581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397677736
58	NC_018149	TCTTTT	2	12	138134	138145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397677736
59	NC_018149	AATAGC	2	12	140967	140978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677738
60	NC_018149	CAATCT	2	12	141649	141660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677738
61	NC_018149	CTGCAA	2	12	142474	142485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397677738
62	NC_018149	ACAAAG	2	12	144136	144147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397677738
63	NC_018149	AAGAAC	2	12	146630	146641	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397677739
64	NC_018149	ATCCAA	2	12	150068	150079	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397677741
65	NC_018149	CTTGAA	2	12	152738	152749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397677743
66	NC_018149	GTTCTT	2	12	155266	155277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397677745
67	NC_018149	TTGTTT	2	12	155370	155381	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	397677745
68	NC_018149	AGTTCT	2	12	155413	155424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397677745
69	NC_018149	CAAACT	2	12	159957	159968	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397677750
70	NC_018149	GAGTTA	2	12	160777	160788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677751
71	NC_018149	GTTAAG	2	12	163149	163160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677754
72	NC_018149	CGGAAG	2	12	166234	166245	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	397677756
73	NC_018149	CTAAAG	2	12	167978	167989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677758
74	NC_018149	TCTGAA	2	12	174743	174754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397677763
75	NC_018149	TACAAC	2	12	179332	179343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397677767
76	NC_018149	TTCTCT	2	12	180096	180107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677768
77	NC_018149	AGAAAA	2	12	181148	181159	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397677769
78	NC_018149	GCAATA	2	12	181384	181395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677769
79	NC_018149	TGGAAT	2	12	181808	181819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677770
80	NC_018149	GTTTTG	2	12	183495	183506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677771
81	NC_018149	AATAGA	2	12	193859	193870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397677779
82	NC_018149	CTAAAG	2	12	197538	197549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677783
83	NC_018149	CTTTAC	2	12	202884	202895	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677788
84	NC_018149	ACACTC	2	12	203782	203793	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	397677789
85	NC_018149	CTACAG	2	12	204470	204481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397677790
86	NC_018149	AAGAAC	2	12	204848	204859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397677790
87	NC_018149	TTAGTC	2	12	207172	207183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397677792
88	NC_018149	AAGGAG	2	12	210687	210698	50 %	0 %	50 %	0 %	397677795
89	NC_018149	TTTTTC	2	12	211573	211584	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397677796
90	NC_018149	GTTGAA	2	12	215521	215532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677801
91	NC_018149	ATCTCT	2	12	216845	216856	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677802
92	NC_018149	CTCTAA	2	12	217493	217504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677802
93	NC_018149	AAGACA	2	12	218421	218432	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397677803
94	NC_018149	TCACTC	2	12	225060	225071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397677811
95	NC_018149	AAAGAC	2	12	226448	226459	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397677812
96	NC_018149	GAAGCT	2	12	226593	226604	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397677812
97	NC_018149	AAAAGA	2	12	234004	234015	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397677821
98	NC_018149	AAAGTA	2	12	235622	235633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397677825
99	NC_018149	ATTTAA	2	12	236363	236374	50 %	50 %	0 %	0 %	397677827
100	NC_018149	CTTTGA	2	12	239511	239522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397677828
101	NC_018149	GAAGTT	2	12	240185	240196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677828
102	NC_018149	GAACTA	2	12	244190	244201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397677832
103	NC_018149	GAAATA	2	12	244624	244635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397677832
104	NC_018149	TCTAGA	2	12	250741	250752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397677835
105	NC_018149	ACTTTC	2	12	251610	251621	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677835
106	NC_018149	GTAGAA	2	12	258436	258447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397677838
107	NC_018149	CTTTAT	2	12	268888	268899	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397677849
108	NC_018149	TACCTT	2	12	269631	269642	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397677850
109	NC_018149	TCTTAG	2	12	269667	269678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397677850
110	NC_018149	TCTCTT	2	12	277608	277619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677858
111	NC_018149	TGTAAA	2	12	277880	277891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397677859
112	NC_018149	GTATTT	2	12	289571	289582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397677864
113	NC_018149	TAAAAG	2	12	296566	296577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397677871
114	NC_018149	TTAGTG	2	12	297298	297309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397677872
115	NC_018149	ATTTTC	2	12	300878	300889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397677877
116	NC_018149	GAAAGA	2	12	302433	302444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677879
117	NC_018149	AAACAA	2	12	302479	302490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	397677879
118	NC_018149	AGGATT	2	12	306012	306023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677884
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234	NC_018149	ACTTCA	2	12	586955	586966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397678199
235	NC_018149	TGAAGT	2	12	589003	589014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397678200
236	NC_018149	TGAAGT	2	12	590092	590103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397678201
237	NC_018149	TTCTTG	2	12	591296	591307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397678203
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272	NC_018149	TTGAAC	2	12	649592	649603	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397678253

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.