MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma wenyonii str. Massachusetts chromosome

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018149	ACTAA	2	10	6184	6193	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018149	CAGAA	2	10	8193	8202	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018149	ATTCA	2	10	8445	8454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018149	GAGCA	2	10	8580	8589	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018149	GATTT	2	10	13578	13587	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018149	TTAAG	2	10	13911	13920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018149	ATCTA	2	10	27544	27553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018149	TTTAG	2	10	28899	28908	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018149	CTCTA	2	10	35472	35481	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018149	AAATT	2	10	40795	40804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018149	GTTGA	2	10	47733	47742	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018149	CAAGT	2	10	51962	51971	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018149	TTTCT	2	10	52423	52432	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018149	TTTAC	2	10	52610	52619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018149	GAAAT	2	10	52913	52922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018149	TTTTA	2	10	54844	54853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018149	TTAAA	2	10	56130	56139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018149	CATTA	2	10	99729	99738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018149	GTTTT	2	10	105146	105155	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018149	TTTGT	2	10	113213	113222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018149	ATTTT	2	10	115971	115980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018149	TAATC	2	10	122773	122782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018149	AATTT	2	10	124523	124532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018149	TTTTC	2	10	126149	126158	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018149	CTTTT	2	10	126619	126628	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018149	GTTAA	2	10	149508	149517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018149	AAGAA	2	10	149546	149555	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018149	AGAAA	2	10	191877	191886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018149	TGGAG	2	10	191900	191909	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018149	TAAAG	2	10	209922	209931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018149	AAATT	2	10	209978	209987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018149	TAATT	2	10	229731	229740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018149	TTAAT	2	10	230836	230845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018149	TCGAA	2	10	232756	232765	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018149	TTTAA	2	10	234569	234578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018149	TTAAA	2	10	240256	240265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018149	TTATT	2	10	263350	263359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018149	GTTGA	2	10	285673	285682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018149	TTTTC	2	10	286992	287001	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018149	AAATT	2	10	288863	288872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018149	AGAAA	2	10	289899	289908	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018149	TTGAA	2	10	290987	290996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018149	AAAAG	2	10	292736	292745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018149	AAAGA	2	10	293038	293047	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018149	TTAAT	2	10	294332	294341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018149	GAATT	2	10	296201	296210	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018149	AATTA	2	10	297432	297441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018149	TTTAA	2	10	298922	298931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018149	CTTTT	2	10	298948	298957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018149	AAAAT	2	10	300043	300052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018149	AAAAT	2	10	316379	316388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018149	ATTTT	2	10	329504	329513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018149	ATCAA	2	10	337107	337116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018149	AACTA	2	10	338979	338988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018149	ACTAA	2	10	340100	340109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018149	TAAAT	2	10	356121	356130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018149	TTGTT	2	10	360261	360270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018149	ATTTT	2	10	362879	362888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018149	GTTTC	2	10	363138	363147	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018149	ATTTT	2	10	363505	363514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018149	ATTTT	2	10	364207	364216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018149	ATTTT	2	10	364860	364869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018149	CTTCT	2	10	372192	372201	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018149	GGAAA	2	10	373194	373203	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018149	TTTAC	2	10	374606	374615	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018149	ATTTT	2	10	378540	378549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018149	ACTTC	2	10	380248	380257	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_018149	CTAAA	2	10	392423	392432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018149	AGAGA	2	10	393660	393669	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018149	ATTTG	2	10	404371	404380	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018149	AAAAG	2	10	409742	409751	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018149	CAAAA	2	10	415320	415329	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018149	CATGG	2	10	415333	415342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018149	ACTAG	2	10	415867	415876	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018149	TTAAA	2	10	420678	420687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018149	AAGAA	2	10	420688	420697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018149	AAACT	2	10	425995	426004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018149	CCAGC	2	10	435327	435336	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_018149	TTAAG	2	10	448548	448557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018149	TGAGG	2	10	473483	473492	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018149	CCTTT	2	10	473913	473922	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_018149	ATTAA	2	10	473984	473993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018149	AAGGG	2	10	488452	488461	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018149	AAAAG	2	10	492086	492095	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018149	ATCTA	2	10	493419	493428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018149	ATAAA	2	10	497692	497701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018149	TCAGT	2	10	506961	506970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018149	TTAAC	2	10	510187	510196	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018149	ATTAG	2	10	549969	549978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018149	ACCTA	2	10	555138	555147	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018149	GAAAC	2	10	563106	563115	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018149	GATTT	2	10	572348	572357	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018149	AATTA	2	10	580536	580545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018149	TTTCC	2	10	584382	584391	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018149	GAAAA	2	10	587875	587884	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018149	ATTTT	2	10	589222	589231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018149	ATTTT	2	10	590311	590320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018149	TAAAT	2	10	593034	593043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018149	TGGAG	2	10	593140	593149	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018149	AAGCC	2	10	607210	607219	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_018149	GTAAC	2	10	620231	620240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018149	GAAAA	2	10	620522	620531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018149	TTTCC	2	10	621798	621807	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_018149	GTTTT	2	10	623995	624004	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018149	TCTCT	2	10	626255	626264	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018149	AGTTA	2	10	630207	630216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018149	TAATT	2	10	646487	646496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.