MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.02

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018147	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677567
2	NC_018147	CTG	2	6	296	301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677567
3	NC_018147	GAT	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677567
4	NC_018147	AGC	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677567
5	NC_018147	CTT	2	6	413	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677567
6	NC_018147	ATC	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677567
7	NC_018147	ATA	2	6	432	437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677567
8	NC_018147	TAA	2	6	468	473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677567
9	NC_018147	TCC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677567
10	NC_018147	CTT	2	6	679	684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677568
11	NC_018147	TGA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677569
12	NC_018147	ATA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677569
13	NC_018147	TCA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677569
14	NC_018147	TTG	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677569
15	NC_018147	CTA	2	6	2274	2279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677569
16	NC_018147	CTG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677569
17	NC_018147	GCT	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677569
18	NC_018147	GGC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677570
19	NC_018147	GTG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677570
20	NC_018147	TAA	2	6	3492	3497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677571
21	NC_018147	GAA	2	6	3533	3538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677571
22	NC_018147	TCT	2	6	3557	3562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677571
23	NC_018147	CAT	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677571
24	NC_018147	TGT	2	6	3576	3581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677571
25	NC_018147	TCT	3	9	3604	3612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677571
26	NC_018147	AAG	2	6	3620	3625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677571
27	NC_018147	TAC	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677571
28	NC_018147	TGT	2	6	3742	3747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677571
29	NC_018147	TGC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677571
30	NC_018147	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677572
31	NC_018147	TCG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677572
32	NC_018147	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677572
33	NC_018147	CGA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677572
34	NC_018147	TCT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677573
35	NC_018147	ATT	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677574
36	NC_018147	GAA	3	9	4838	4846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677574
37	NC_018147	AAG	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677574
38	NC_018147	ACC	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677575
39	NC_018147	TCT	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
40	NC_018147	ATC	2	6	5156	5161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677575
41	NC_018147	CGT	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
42	NC_018147	TTC	2	6	5189	5194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
43	NC_018147	TCT	2	6	5211	5216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
44	NC_018147	TGC	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
45	NC_018147	GAA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
46	NC_018147	ACC	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677575
47	NC_018147	GCC	2	6	5484	5489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677575
48	NC_018147	CGA	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677575
49	NC_018147	TGG	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677575
50	NC_018147	GTC	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
51	NC_018147	TGC	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
52	NC_018147	CGC	2	6	6024	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677575
53	NC_018147	GGA	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677575
54	NC_018147	TGA	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677575
55	NC_018147	CCT	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677575
56	NC_018147	AAC	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677575
57	NC_018147	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
58	NC_018147	AAG	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
59	NC_018147	AGG	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677575
60	NC_018147	CGA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677575
61	NC_018147	AGA	3	9	6491	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
62	NC_018147	GTT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677575
63	NC_018147	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677575
64	NC_018147	TGA	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
65	NC_018147	TAA	2	6	7217	7222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677576
66	NC_018147	TTC	2	6	7250	7255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
67	NC_018147	TAT	2	6	7367	7372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
68	NC_018147	ATT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
69	NC_018147	AAG	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
70	NC_018147	GAT	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
71	NC_018147	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
72	NC_018147	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
73	NC_018147	TCT	2	6	7545	7550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
74	NC_018147	AAG	3	9	7591	7599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
75	NC_018147	GAT	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
76	NC_018147	GCT	2	6	7740	7745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
77	NC_018147	GCT	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
78	NC_018147	TAG	2	6	7864	7869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
79	NC_018147	ATT	2	6	7877	7882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
80	NC_018147	AAT	2	6	7892	7897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677576
81	NC_018147	TCT	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
82	NC_018147	TAC	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677576
83	NC_018147	TCA	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677576
84	NC_018147	CTG	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
85	NC_018147	GTT	2	6	8307	8312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677576
86	NC_018147	ACA	2	6	8315	8320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677576
87	NC_018147	CGT	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
88	NC_018147	ATT	3	9	8409	8417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
89	NC_018147	TGC	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677576
90	NC_018147	AAG	2	6	8614	8619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
91	NC_018147	TTA	2	6	8629	8634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677576
92	NC_018147	AGA	2	6	8780	8785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
93	NC_018147	TCT	2	6	8859	8864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
94	NC_018147	TTG	2	6	8882	8887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677576
95	NC_018147	CTT	2	6	8916	8921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
96	NC_018147	TTG	2	6	8983	8988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677576
97	NC_018147	TTC	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677576
98	NC_018147	ATG	2	6	9066	9071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677576
99	NC_018147	GCG	2	6	9075	9080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677576
100	NC_018147	GAA	2	6	9095	9100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677576
101	NC_018147	CCG	2	6	9134	9139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677577
102	NC_018147	CAT	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677577
103	NC_018147	TGC	2	6	9320	9325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677577
104	NC_018147	CAG	2	6	9338	9343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677577
105	NC_018147	GTC	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677577
106	NC_018147	GGC	2	6	9466	9471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677577
107	NC_018147	CAT	2	6	9580	9585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677577
108	NC_018147	CGG	2	6	9716	9721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677577
109	NC_018147	TCA	2	6	9722	9727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677577
110	NC_018147	CAC	2	6	9978	9983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677578
111	NC_018147	ATC	2	6	10010	10015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677578
112	NC_018147	TTC	3	9	10066	10074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677578
113	NC_018147	GCT	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677578
114	NC_018147	ATA	2	6	10136	10141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677578
115	NC_018147	GCT	2	6	10144	10149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677578
116	NC_018147	GGA	2	6	10265	10270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677578
117	NC_018147	GAT	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677578
118	NC_018147	CCG	2	6	10343	10348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677578
119	NC_018147	AAG	2	6	10366	10371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677578
120	NC_018147	TCT	2	6	10382	10387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677578
121	NC_018147	TTC	2	6	10582	10587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677578
122	NC_018147	TCT	2	6	10799	10804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677578
123	NC_018147	ATC	2	6	10876	10881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677578
124	NC_018147	TCC	2	6	10927	10932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677578
125	NC_018147	AAG	2	6	10987	10992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677578
126	NC_018147	ATG	2	6	11193	11198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677579
127	NC_018147	ATA	2	6	11214	11219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677579
128	NC_018147	CGA	2	6	11281	11286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677579
129	NC_018147	TAA	2	6	11389	11394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677579
130	NC_018147	AAG	2	6	11414	11419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677579
131	NC_018147	AAG	3	9	11515	11523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677579
132	NC_018147	ACC	2	6	11538	11543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677579
133	NC_018147	TAA	2	6	11647	11652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677579
134	NC_018147	TTA	2	6	11663	11668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677579
135	NC_018147	GAT	2	6	11858	11863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677579
136	NC_018147	TGA	2	6	12342	12347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677580
137	NC_018147	ATC	2	6	12349	12354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677580
138	NC_018147	GCC	2	6	12359	12364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677580
139	NC_018147	TCC	2	6	12446	12451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677581
140	NC_018147	TTG	2	6	12488	12493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677581
141	NC_018147	ATG	2	6	12533	12538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677581
142	NC_018147	ATG	2	6	12552	12557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677581
143	NC_018147	AGA	2	6	12568	12573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677581
144	NC_018147	ATC	2	6	12582	12587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677581
145	NC_018147	GCA	2	6	12605	12610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677581
146	NC_018147	TTA	2	6	12805	12810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677582
147	NC_018147	GCA	2	6	12870	12875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677582
148	NC_018147	CAT	2	6	12899	12904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677582
149	NC_018147	CAA	2	6	12928	12933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677582
150	NC_018147	ATT	2	6	13041	13046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677582
151	NC_018147	TGC	2	6	13061	13066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677582
152	NC_018147	CGA	2	6	13089	13094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677582
153	NC_018147	GCT	2	6	13140	13145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677582
154	NC_018147	ATT	2	6	13164	13169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677582
155	NC_018147	TTG	2	6	13288	13293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677582
156	NC_018147	CAC	2	6	13319	13324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677582
157	NC_018147	GCT	2	6	13362	13367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677582
158	NC_018147	CAT	2	6	13377	13382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677582
159	NC_018147	TAA	2	6	13397	13402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677582
160	NC_018147	GCT	2	6	13482	13487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677583
161	NC_018147	AAC	2	6	13664	13669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677583
162	NC_018147	TGA	2	6	13963	13968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677584
163	NC_018147	CGT	2	6	13970	13975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677584
164	NC_018147	ATG	2	6	14105	14110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677584
165	NC_018147	CTT	2	6	14298	14303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677585
166	NC_018147	CAG	2	6	14309	14314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677585
167	NC_018147	GGA	2	6	14424	14429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677585
168	NC_018147	TCT	3	9	14588	14596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677585
169	NC_018147	TGC	2	6	14610	14615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677585

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.