MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 chromosome

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018145	GCAAA	2	10	212	221	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018145	TATTT	2	10	3859	3868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018145	ACAAA	2	10	3897	3906	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018145	TGACG	2	10	27429	27438	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018145	AAAGC	2	10	34123	34132	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018145	CTTTG	2	10	38142	38151	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018145	ACCCC	2	10	62548	62557	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_018145	TAAAA	2	10	62625	62634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018145	AAGAA	2	10	65566	65575	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018145	AGTGA	2	10	75308	75317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018145	GTCTT	2	10	75677	75686	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018145	TTTCT	2	10	89923	89932	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018145	TGTTC	2	10	103861	103870	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018145	AATAT	2	10	111006	111015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018145	ATATT	2	10	114921	114930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018145	GAAAT	2	10	114969	114978	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018145	GAAAA	2	10	129098	129107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018145	AAAGG	2	10	133166	133175	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018145	ATATT	2	10	134868	134877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018145	TCCTA	2	10	137022	137031	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018145	AAATC	2	10	137620	137629	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018145	AATAA	2	10	139970	139979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018145	TAAAA	2	10	144282	144291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018145	ATGTT	2	10	158130	158139	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018145	TTCCT	2	10	161885	161894	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018145	TTTCT	2	10	167605	167614	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018145	AATCT	2	10	186583	186592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018145	TTGTT	2	10	192650	192659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018145	GGGGT	2	10	199897	199906	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018145	TTTTA	2	10	213237	213246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018145	GATAG	2	10	217476	217485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018145	GGTCT	2	10	219734	219743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018145	TCCAA	2	10	227716	227725	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_018145	TCTAG	2	10	227745	227754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018145	TTGAT	2	10	227784	227793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018145	AGGGC	2	10	261170	261179	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018145	GAAAA	2	10	284761	284770	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018145	AAAAC	2	10	293360	293369	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018145	TTATC	2	10	308230	308239	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018145	AAAAT	2	10	308828	308837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018145	TACCA	2	10	311788	311797	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018145	ATTTT	2	10	315246	315255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018145	ACCCT	2	10	330864	330873	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_018145	AAGAA	2	10	333210	333219	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018145	TTTAA	2	10	343286	343295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018145	GATAA	2	10	356828	356837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018145	CAATC	2	10	359648	359657	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018145	CTGTC	2	10	373427	373436	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018145	ATGCA	2	10	392444	392453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018145	CTACT	2	10	395905	395914	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018145	AATCA	2	10	396914	396923	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018145	TTTTC	2	10	406958	406967	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018145	ATTAT	2	10	411765	411774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018145	CCCTT	2	10	413225	413234	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_018145	AATAG	2	10	414284	414293	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018145	AGTTT	2	10	433839	433848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018145	AAAAT	2	10	433978	433987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018145	TTATT	2	10	448260	448269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018145	CATCC	2	10	455388	455397	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_018145	CATTT	2	10	455420	455429	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018145	ATGTT	2	10	455470	455479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018145	TTTTA	2	10	470050	470059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018145	AAATT	2	10	470077	470086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018145	TTATA	2	10	471657	471666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018145	ACCTT	2	10	475282	475291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_018145	GGAAC	2	10	475539	475548	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018145	TTTAT	2	10	476470	476479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018145	TTTAA	2	10	478406	478415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018145	TTTTA	2	10	492580	492589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018145	CTTTA	2	10	499680	499689	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018145	ATTAA	2	10	506933	506942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018145	TGATT	2	10	507057	507066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018145	GAAAA	2	10	543040	543049	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018145	CTCAT	2	10	543968	543977	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018145	AATCA	2	10	544808	544817	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018145	AAACT	2	10	544959	544968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018145	TTTAA	2	10	550871	550880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018145	TAGGA	2	10	570215	570224	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018145	ATGTT	2	10	571213	571222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018145	GATAT	2	10	571487	571496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018145	AAAGG	2	10	578943	578952	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018145	GAACC	2	10	589232	589241	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018145	ATAAA	2	10	622022	622031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018145	TTTTA	2	10	625303	625312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018145	AAAAG	2	10	625379	625388	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018145	TTCAT	2	10	627631	627640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018145	CAAAG	2	10	628079	628088	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018145	CATGA	2	10	631351	631360	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018145	AAAAG	2	10	632390	632399	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018145	ACCGC	2	10	641808	641817	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_018145	AAGGA	2	10	671915	671924	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018145	GGATA	2	10	690272	690281	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018145	ATTTT	2	10	690682	690691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018145	CCCCT	2	10	690791	690800	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
95	NC_018145	ATTTT	2	10	693415	693424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018145	AAATA	2	10	702295	702304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018145	ATTTT	2	10	748575	748584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018145	ATTTT	2	10	750038	750047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018145	GAAAA	2	10	752212	752221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018145	GCAAA	2	10	760926	760935	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018145	AGCAT	2	10	773083	773092	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018145	AAAAT	2	10	792576	792585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018145	CAATA	2	10	802573	802582	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018145	CTTTT	2	10	811992	812001	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018145	TGACT	2	10	827909	827918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018145	GATAA	2	10	832702	832711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018145	CCCTT	2	10	837128	837137	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_018145	ATCTC	2	10	839717	839726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_018145	GCCTA	2	10	842380	842389	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018145	CAAAA	2	10	842955	842964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018145	CCCTT	2	10	851938	851947	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_018145	TATTG	2	10	853671	853680	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018145	AATTA	2	10	856786	856795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018145	TGAAT	2	10	865838	865847	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018145	TTATC	2	10	868215	868224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018145	GAAAA	2	10	892008	892017	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018145	ATTAA	2	10	905615	905624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018145	CAGAA	2	10	919748	919757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018145	TTATC	2	10	926034	926043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018145	ATGCT	2	10	934616	934625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018145	CTAAT	2	10	936286	936295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018145	TGATT	2	10	945932	945941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018145	GCAAA	2	10	946005	946014	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018145	AAAGA	2	10	946274	946283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018145	AAAAT	2	10	964070	964079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018145	AGGAC	2	10	964544	964553	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018145	ATAAA	2	10	973515	973524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018145	AGCCC	2	10	978192	978201	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_018145	TAAAA	2	10	985065	985074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018145	AAATT	2	10	991435	991444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018145	GGCAT	2	10	993050	993059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018145	TAATT	2	10	993839	993848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018145	ATCAA	2	10	993993	994002	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018145	AAAAT	2	10	1007808	1007817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018145	AAAAG	2	10	1028146	1028155	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018145	AGTAA	2	10	1033321	1033330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018145	AGAAA	2	10	1037086	1037095	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018145	GAAAG	2	10	1049160	1049169	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018145	TTTTA	2	10	1051591	1051600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018145	AAATA	2	10	1052930	1052939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018145	AATAA	2	10	1058923	1058932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018145	ATAAA	2	10	1062126	1062135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018145	TTCTT	2	10	1062721	1062730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018145	CTTTT	2	10	1068789	1068798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018145	AAAGA	2	10	1070275	1070284	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018145	GATTT	2	10	1071875	1071884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018145	CTATT	2	10	1085205	1085214	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018145	CTATT	2	10	1085228	1085237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018145	AATCA	2	10	1091798	1091807	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_018145	TTGAT	2	10	1097665	1097674	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018145	CTATT	2	10	1100864	1100873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_018145	TTGAT	2	10	1104152	1104161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_018145	GGCTC	2	10	1235470	1235479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_018145	GGCTC	2	10	1235535	1235544	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_018145	GGCTC	2	10	1235548	1235557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
193	NC_018145	GGCTC	2	10	1235561	1235570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
194	NC_018145	GGCTC	2	10	1235574	1235583	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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287	NC_018145	AAGGT	2	10	1738649	1738658	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018145	AAGAT	2	10	1740598	1740607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018145	TTCCA	2	10	1740947	1740956	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
290	NC_018145	ATCGT	2	10	1742313	1742322	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_018145	AAATA	2	10	1745285	1745294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018145	AGCCT	2	10	1748870	1748879	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018145	AACCC	2	10	1752957	1752966	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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302	NC_018145	AAATT	2	10	1815661	1815670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_018145	CATGA	2	10	1947824	1947833	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
323	NC_018145	AAATA	2	10	1949220	1949229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_018145	AAAAT	2	10	1956147	1956156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_018145	TTTTC	2	10	1960493	1960502	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
326	NC_018145	AAAAG	2	10	1960555	1960564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.