MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018143	ACCGCG	2	12	31089	31100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018143	CGTCGG	2	12	66733	66744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018143	CAACGG	2	12	76218	76229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018143	TCACCT	2	12	80393	80404	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018143	GCGGTG	2	12	104741	104752	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018143	CTCGGT	2	12	149372	149383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018143	GCCGCG	2	12	180930	180941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018143	ACAGCC	2	12	218478	218489	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018143	CCCCGA	2	12	293630	293641	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018143	AGATTC	2	12	330363	330374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018143	GGTCGC	2	12	342061	342072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018143	ATAGTC	2	12	542975	542986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018143	ACCAGT	2	12	591002	591013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018143	CGCCGT	2	12	719928	719939	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018143	CGCGGG	2	12	829825	829836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018143	CCGGCG	2	12	863162	863173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018143	ACCGGG	2	12	869883	869894	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018143	GCGGCC	2	12	908131	908142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018143	ACAGCA	2	12	909504	909515	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018143	CTGGGT	2	12	924343	924354	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018143	TCGGGT	2	12	965582	965593	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018143	CAACGG	2	12	1029362	1029373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018143	GATCGA	2	12	1029413	1029424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018143	GACTGC	2	12	1033817	1033828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018143	CGCCGG	2	12	1052681	1052692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018143	GGCGCA	2	12	1094467	1094478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018143	CAATGC	2	12	1123654	1123665	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018143	TTGGTG	2	12	1151790	1151801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018143	TTCCGT	2	12	1162483	1162494	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018143	TAGCCA	2	12	1196254	1196265	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018143	AGTTAC	2	12	1221949	1221960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018143	AGGCCA	2	12	1341301	1341312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018143	TCGACA	2	12	1368750	1368761	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018143	CCGAGT	2	12	1419828	1419839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018143	CACGCG	2	12	1525011	1525022	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018143	ATATTC	2	12	1561396	1561407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018143	GCCCCT	2	12	1634651	1634662	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018143	GCCCCT	2	12	1638253	1638264	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018143	CGAGTG	2	12	1790114	1790125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018143	GGCGCC	2	12	1836339	1836350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018143	CCGCGG	2	12	1900054	1900065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018143	TAGCGG	2	12	1927159	1927170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018143	ACCGCA	2	12	1929096	1929107	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018143	GGTGAT	2	12	2041750	2041761	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018143	TTCGGC	2	12	2055659	2055670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018143	AGAGGG	2	12	2075840	2075851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018143	GCTGGG	2	12	2144923	2144934	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018143	CGCGAG	2	12	2176536	2176547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018143	CGGTTG	2	12	2230952	2230963	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018143	GCCGCA	2	12	2233857	2233868	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018143	CGGCTC	2	12	2263170	2263181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018143	TGCACT	2	12	2338592	2338603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018143	ATAGAA	2	12	2367011	2367022	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018143	CTCAAC	2	12	2409588	2409599	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018143	CCGCTG	2	12	2431549	2431560	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018143	CACCGC	2	12	2440006	2440017	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018143	GCGTCG	2	12	2492378	2492389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018143	GCAACC	2	12	2632212	2632223	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018143	CACGTG	2	12	2715371	2715382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018143	GAGGTC	2	12	2718983	2718994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018143	CCGGCA	2	12	2733034	2733045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018143	CGCCAC	2	12	2792581	2792592	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018143	TCAAAC	2	12	2794334	2794345	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018143	GCACCC	2	12	2822404	2822415	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018143	CGACGG	2	12	2870685	2870696	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018143	GCCCGA	2	12	2877780	2877791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018143	GTATTG	2	12	2916217	2916228	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018143	CCGTTG	2	12	2926153	2926164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018143	GGCGCC	2	12	2945841	2945852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018143	CGGAAG	2	12	2953310	2953321	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018143	CATATT	2	12	3015089	3015100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018143	CCGGCA	2	12	3079166	3079177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018143	CGTTGC	2	12	3100180	3100191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018143	CGCGCC	2	12	3289826	3289837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018143	TCGCCG	2	12	3291442	3291453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018143	TCGCCG	2	12	3291499	3291510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018143	CGCCAC	2	12	3307520	3307531	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018143	GGCCGG	2	12	3313219	3313230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018143	CGTAGG	2	12	3381168	3381179	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018143	TGTACA	2	12	3430351	3430362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018143	ACCAAC	2	12	3435700	3435711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018143	CCGTTG	2	12	3457398	3457409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018143	GCTCCT	2	12	3487775	3487786	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018143	TCCGCT	2	12	3547008	3547019	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018143	GCCTCC	2	12	3640241	3640252	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018143	TGCCGC	2	12	3738228	3738239	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018143	CGCAGC	2	12	3755563	3755574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018143	GCGCAG	2	12	3778588	3778599	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018143	TGTACA	2	12	3799293	3799304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018143	CACGTT	2	12	3874961	3874972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018143	TCCTCT	2	12	3880260	3880271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018143	TCGGAG	2	12	3905897	3905908	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018143	CCGCTC	2	12	3909926	3909937	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018143	CGTTGG	2	12	3922566	3922577	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018143	CGGCCG	2	12	3926706	3926717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018143	GGCACC	2	12	3942065	3942076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018143	CGCGGG	2	12	3942517	3942528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018143	GCCGGT	2	12	3942839	3942850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018143	CAACGG	2	12	3943936	3943947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018143	GGCCGG	2	12	3944311	3944322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018143	CGGCGA	2	12	4008826	4008837	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018143	CGAACA	2	12	4016610	4016621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018143	CCGGGT	2	12	4076947	4076958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018143	GGCGAG	2	12	4110965	4110976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018143	GCGCCG	2	12	4151254	4151265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018143	TGGCGG	2	12	4199306	4199317	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018143	CTGCGG	2	12	4221989	4222000	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018143	AACGCG	2	12	4222699	4222710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018143	CTCATC	2	12	4266847	4266858	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018143	GGGTTG	2	12	4324112	4324123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.