MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 3528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018143	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	397671779
2	NC_018143	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	397671780
3	NC_018143	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	397671780
4	NC_018143	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	397671782
5	NC_018143	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	397671784
6	NC_018143	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	397671784
7	NC_018143	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	397671784
8	NC_018143	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	397671785
9	NC_018143	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	397671785
10	NC_018143	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_018143	CGACC	2	10	13672	13681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_018143	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	397671792
13	NC_018143	GGGCC	2	10	14437	14446	0 %	0 %	60 %	40 %	397671792
14	NC_018143	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	397671793
15	NC_018143	CCAGC	2	10	15722	15731	20 %	0 %	20 %	60 %	397671794
16	NC_018143	ACCGA	2	10	16485	16494	40 %	0 %	20 %	40 %	397671794
17	NC_018143	ATCGG	2	10	16877	16886	20 %	20 %	40 %	20 %	397671794
18	NC_018143	CGGCC	2	10	17886	17895	0 %	0 %	40 %	60 %	397671795
19	NC_018143	TTAGC	2	10	19037	19046	20 %	40 %	20 %	20 %	397671796
20	NC_018143	GGTCC	2	10	19109	19118	0 %	20 %	40 %	40 %	397671796
21	NC_018143	GTCGT	2	10	21628	21637	0 %	40 %	40 %	20 %	397671797
22	NC_018143	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	397671800
23	NC_018143	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	397671800
24	NC_018143	CGAGC	2	10	26968	26977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018143	GGCAA	2	10	29301	29310	40 %	0 %	40 %	20 %	397671805
26	NC_018143	CGATC	2	10	30127	30136	20 %	20 %	20 %	40 %	397671806
27	NC_018143	CGACG	2	10	32310	32319	20 %	0 %	40 %	40 %	397671809
28	NC_018143	GCGTC	2	10	32365	32374	0 %	20 %	40 %	40 %	397671809
29	NC_018143	GACAC	2	10	32462	32471	40 %	0 %	20 %	40 %	397671809
30	NC_018143	CCGCC	2	10	33808	33817	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_018143	TCCTG	2	10	37467	37476	0 %	40 %	20 %	40 %	397671815
32	NC_018143	CTCGG	2	10	37560	37569	0 %	20 %	40 %	40 %	397671815
33	NC_018143	GGCGC	2	10	38103	38112	0 %	0 %	60 %	40 %	397671815
34	NC_018143	TGGCC	2	10	38251	38260	0 %	20 %	40 %	40 %	397671815
35	NC_018143	CGGCG	2	10	38783	38792	0 %	0 %	60 %	40 %	397671815
36	NC_018143	GTCCA	2	10	39395	39404	20 %	20 %	20 %	40 %	397671816
37	NC_018143	GCCAA	2	10	41529	41538	40 %	0 %	20 %	40 %	397671818
38	NC_018143	GCGTC	2	10	41944	41953	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018143	GCACA	2	10	42328	42337	40 %	0 %	20 %	40 %	397671819
40	NC_018143	GGTAC	2	10	44862	44871	20 %	20 %	40 %	20 %	397671821
41	NC_018143	TCGAA	2	10	45094	45103	40 %	20 %	20 %	20 %	397671821
42	NC_018143	GCACC	2	10	46024	46033	20 %	0 %	20 %	60 %	397671821
43	NC_018143	CGGTG	2	10	47058	47067	0 %	20 %	60 %	20 %	397671822
44	NC_018143	TCATG	2	10	47204	47213	20 %	40 %	20 %	20 %	397671822
45	NC_018143	ATCGG	2	10	47351	47360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018143	GCAGC	2	10	48598	48607	20 %	0 %	40 %	40 %	397671824
47	NC_018143	CCCGA	2	10	48681	48690	20 %	0 %	20 %	60 %	397671824
48	NC_018143	CAGCG	2	10	49806	49815	20 %	0 %	40 %	40 %	397671825
49	NC_018143	CTCCC	2	10	56237	56246	0 %	20 %	0 %	80 %	397671831
50	NC_018143	CGGCG	2	10	56686	56695	0 %	0 %	60 %	40 %	397671831
51	NC_018143	CGACC	2	10	58218	58227	20 %	0 %	20 %	60 %	397671833
52	NC_018143	CTTCG	2	10	58905	58914	0 %	40 %	20 %	40 %	397671834
53	NC_018143	CGGTG	2	10	59961	59970	0 %	20 %	60 %	20 %	397671837
54	NC_018143	TCAGG	2	10	62447	62456	20 %	20 %	40 %	20 %	397671838
55	NC_018143	TGCCG	2	10	65478	65487	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018143	GGCGA	2	10	66410	66419	20 %	0 %	60 %	20 %	397671842
57	NC_018143	GGTGT	2	10	68986	68995	0 %	40 %	60 %	0 %	397671844
58	NC_018143	ATCGG	2	10	69623	69632	20 %	20 %	40 %	20 %	397671844
59	NC_018143	CCGCG	2	10	70160	70169	0 %	0 %	40 %	60 %	397671844
60	NC_018143	GGCAA	2	10	70511	70520	40 %	0 %	40 %	20 %	397671844
61	NC_018143	CGACC	2	10	70800	70809	20 %	0 %	20 %	60 %	397671844
62	NC_018143	CGGGT	2	10	71254	71263	0 %	20 %	60 %	20 %	397671844
63	NC_018143	GGTCG	2	10	71314	71323	0 %	20 %	60 %	20 %	397671844
64	NC_018143	TGCCT	2	10	72018	72027	0 %	40 %	20 %	40 %	397671846
65	NC_018143	GTCCA	2	10	72889	72898	20 %	20 %	20 %	40 %	397671847
66	NC_018143	TGACC	2	10	75513	75522	20 %	20 %	20 %	40 %	397671849
67	NC_018143	GCCAA	2	10	75827	75836	40 %	0 %	20 %	40 %	397671849
68	NC_018143	GTCGC	2	10	75904	75913	0 %	20 %	40 %	40 %	397671849
69	NC_018143	GCGCG	2	10	76992	77001	0 %	0 %	60 %	40 %	397671850
70	NC_018143	CACGA	2	10	79849	79858	40 %	0 %	20 %	40 %	397671852
71	NC_018143	GCACC	2	10	80289	80298	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_018143	CCACC	2	10	80482	80491	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_018143	GAGCA	2	10	82387	82396	40 %	0 %	40 %	20 %	397671854
74	NC_018143	GCCGG	2	10	82486	82495	0 %	0 %	60 %	40 %	397671854
75	NC_018143	GCGAC	2	10	82562	82571	20 %	0 %	40 %	40 %	397671854
76	NC_018143	ATCCG	2	10	83332	83341	20 %	20 %	20 %	40 %	397671855
77	NC_018143	CACCG	2	10	84112	84121	20 %	0 %	20 %	60 %	397671856
78	NC_018143	TGGTC	2	10	86247	86256	0 %	40 %	40 %	20 %	397671858
79	NC_018143	GCTGG	2	10	86884	86893	0 %	20 %	60 %	20 %	397671859
80	NC_018143	TGGGT	2	10	89922	89931	0 %	40 %	60 %	0 %	397671865
81	NC_018143	TCGCC	2	10	90129	90138	0 %	20 %	20 %	60 %	397671865
82	NC_018143	GGGCC	2	10	91102	91111	0 %	0 %	60 %	40 %	397671866
83	NC_018143	GGCCG	2	10	92421	92430	0 %	0 %	60 %	40 %	397671867
84	NC_018143	GCGCC	2	10	93073	93082	0 %	0 %	40 %	60 %	397671867
85	NC_018143	GCTTG	2	10	95105	95114	0 %	40 %	40 %	20 %	397671869
86	NC_018143	CGTGT	2	10	95537	95546	0 %	40 %	40 %	20 %	397671870
87	NC_018143	AGATC	2	10	95616	95625	40 %	20 %	20 %	20 %	397671870
88	NC_018143	CGGCG	2	10	99197	99206	0 %	0 %	60 %	40 %	397671873
89	NC_018143	CGGCG	2	10	99324	99333	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018143	GCGGT	2	10	100273	100282	0 %	20 %	60 %	20 %	397671875
91	NC_018143	GGTGA	2	10	100491	100500	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018143	GCGCC	2	10	103105	103114	0 %	0 %	40 %	60 %	397671877
93	NC_018143	GGTGG	2	10	103793	103802	0 %	20 %	80 %	0 %	397671878
94	NC_018143	GGCTT	2	10	104806	104815	0 %	40 %	40 %	20 %	397671879
95	NC_018143	CTGGC	2	10	105528	105537	0 %	20 %	40 %	40 %	397671880
96	NC_018143	GCACA	2	10	106649	106658	40 %	0 %	20 %	40 %	397671880
97	NC_018143	CTGAA	2	10	108979	108988	40 %	20 %	20 %	20 %	397671883
98	NC_018143	ATCGC	2	10	109474	109483	20 %	20 %	20 %	40 %	397671883
99	NC_018143	TCTGA	2	10	110808	110817	20 %	40 %	20 %	20 %	397671885
100	NC_018143	CGGTC	2	10	111083	111092	0 %	20 %	40 %	40 %	397671885
101	NC_018143	GACCA	2	10	112221	112230	40 %	0 %	20 %	40 %	397671885
102	NC_018143	GGCTG	2	10	114785	114794	0 %	20 %	60 %	20 %	397671885
103	NC_018143	CCGCG	2	10	118705	118714	0 %	0 %	40 %	60 %	397671886
104	NC_018143	TCGTG	2	10	122658	122667	0 %	40 %	40 %	20 %	397671888
105	NC_018143	GCACG	2	10	124313	124322	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018143	CCGGA	2	10	124439	124448	20 %	0 %	40 %	40 %	397671890
107	NC_018143	TGCGC	2	10	126911	126920	0 %	20 %	40 %	40 %	397671891
108	NC_018143	GCGAG	2	10	127422	127431	20 %	0 %	60 %	20 %	397671891
109	NC_018143	GGGGT	2	10	128431	128440	0 %	20 %	80 %	0 %	397671891
110	NC_018143	CCCAC	2	10	128993	129002	20 %	0 %	0 %	80 %	397671891
111	NC_018143	CCGGC	2	10	129503	129512	0 %	0 %	40 %	60 %	397671891
112	NC_018143	TGCGG	2	10	129913	129922	0 %	20 %	60 %	20 %	397671891
113	NC_018143	ATCAC	2	10	131392	131401	40 %	20 %	0 %	40 %	397671893
114	NC_018143	ATCGG	2	10	131440	131449	20 %	20 %	40 %	20 %	397671893
115	NC_018143	CGGGC	2	10	132531	132540	0 %	0 %	60 %	40 %	397671893
116	NC_018143	GCGAT	2	10	134336	134345	20 %	20 %	40 %	20 %	397671895
117	NC_018143	GTTCG	2	10	134557	134566	0 %	40 %	40 %	20 %	397671895
118	NC_018143	CCTGG	2	10	134949	134958	0 %	20 %	40 %	40 %	397671895
119	NC_018143	GGCCC	2	10	135055	135064	0 %	0 %	40 %	60 %	397671895
120	NC_018143	CGTTG	2	10	135567	135576	0 %	40 %	40 %	20 %	397671895
121	NC_018143	CGACC	2	10	135639	135648	20 %	0 %	20 %	60 %	397671895
122	NC_018143	GAGAT	2	10	138659	138668	40 %	20 %	40 %	0 %	397671899
123	NC_018143	CGGCG	2	10	140813	140822	0 %	0 %	60 %	40 %	397671901
124	NC_018143	TGCGG	2	10	141446	141455	0 %	20 %	60 %	20 %	397671902
125	NC_018143	CGCTG	2	10	142153	142162	0 %	20 %	40 %	40 %	397671903
126	NC_018143	GTTGC	2	10	142699	142708	0 %	40 %	40 %	20 %	397671903
127	NC_018143	CCGAT	2	10	143447	143456	20 %	20 %	20 %	40 %	397671903
128	NC_018143	ATCGC	2	10	144138	144147	20 %	20 %	20 %	40 %	397671904
129	NC_018143	AACCG	2	10	144877	144886	40 %	0 %	20 %	40 %	397671904
130	NC_018143	CCGCC	2	10	145464	145473	0 %	0 %	20 %	80 %	397671904
131	NC_018143	CCGCC	2	10	146107	146116	0 %	0 %	20 %	80 %	397671905
132	NC_018143	GGGTC	2	10	147861	147870	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018143	ATCGG	2	10	149591	149600	20 %	20 %	40 %	20 %	397671909
134	NC_018143	ATTGG	2	10	152246	152255	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018143	AGCGA	2	10	154149	154158	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018143	AGCGA	2	10	154202	154211	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018143	TCGTC	2	10	154549	154558	0 %	40 %	20 %	40 %	397671912
138	NC_018143	CACGC	2	10	155013	155022	20 %	0 %	20 %	60 %	397671912
139	NC_018143	ATTCT	2	10	155857	155866	20 %	60 %	0 %	20 %	397671913
140	NC_018143	AGGCG	2	10	156385	156394	20 %	0 %	60 %	20 %	397671913
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146	NC_018143	CGGTT	2	10	161389	161398	0 %	40 %	40 %	20 %	397671918
147	NC_018143	GTCGC	2	10	161551	161560	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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150	NC_018143	CTGGG	2	10	164186	164195	0 %	20 %	60 %	20 %	397671921
151	NC_018143	GCCGG	2	10	164779	164788	0 %	0 %	60 %	40 %	397671922
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196	NC_018143	CCGTG	2	10	222075	222084	0 %	20 %	40 %	40 %	397671976
197	NC_018143	GGTGC	2	10	222199	222208	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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237	NC_018143	GCAGT	2	10	276003	276012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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240	NC_018143	AACCG	2	10	280551	280560	40 %	0 %	20 %	40 %	397672022
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249	NC_018143	TGCGC	2	10	302190	302199	0 %	20 %	40 %	40 %	397672040
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251	NC_018143	TCGAC	2	10	305348	305357	20 %	20 %	20 %	40 %	397672041
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254	NC_018143	TGCCA	2	10	310803	310812	20 %	20 %	20 %	40 %	397672048
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259	NC_018143	AGCGG	2	10	314298	314307	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_018143	CGCAG	2	10	314620	314629	20 %	0 %	40 %	40 %	397672051
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263	NC_018143	TCGGC	2	10	316461	316470	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_018143	CCTGG	2	10	317009	317018	0 %	20 %	40 %	40 %	397672054
265	NC_018143	GGCCG	2	10	320114	320123	0 %	0 %	60 %	40 %	397672055
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