MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 10350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018143	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	397671779
2	NC_018143	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	397671779
3	NC_018143	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	397671779
4	NC_018143	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	397671779
5	NC_018143	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	397671779
6	NC_018143	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	397671780
7	NC_018143	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	397671780
8	NC_018143	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	397671780
9	NC_018143	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	397671780
10	NC_018143	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	397671780
11	NC_018143	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	397671780
12	NC_018143	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	397671781
13	NC_018143	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	397671781
14	NC_018143	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	397671781
15	NC_018143	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	397671781
16	NC_018143	ATCG	2	8	4012	4019	25 %	25 %	25 %	25 %	397671781
17	NC_018143	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	397671783
18	NC_018143	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	397671783
19	NC_018143	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	397671783
20	NC_018143	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	397671783
21	NC_018143	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	397671783
22	NC_018143	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	397671784
23	NC_018143	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	397671784
24	NC_018143	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	397671784
25	NC_018143	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	397671784
26	NC_018143	CGGC	2	8	9298	9305	0 %	0 %	50 %	50 %	397671784
27	NC_018143	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	397671784
28	NC_018143	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	397671784
29	NC_018143	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	397671785
30	NC_018143	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	397671787
31	NC_018143	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	397671788
32	NC_018143	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	397671788
33	NC_018143	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	397671790
34	NC_018143	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	397671790
35	NC_018143	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	397671792
36	NC_018143	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	397671792
37	NC_018143	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	397671792
38	NC_018143	GCCC	2	8	14669	14676	0 %	0 %	25 %	75 %	397671792
39	NC_018143	GGGC	2	8	15450	15457	0 %	0 %	75 %	25 %	397671793
40	NC_018143	CTGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	397671794
41	NC_018143	TGGC	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	397671794
42	NC_018143	GCTT	2	8	16107	16114	0 %	50 %	25 %	25 %	397671794
43	NC_018143	CAGT	2	8	16135	16142	25 %	25 %	25 %	25 %	397671794
44	NC_018143	CGGT	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	397671794
45	NC_018143	GCCG	2	8	16565	16572	0 %	0 %	50 %	50 %	397671794
46	NC_018143	CGGG	2	8	17800	17807	0 %	0 %	75 %	25 %	397671795
47	NC_018143	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	397671795
48	NC_018143	GTGC	2	8	18408	18415	0 %	25 %	50 %	25 %	397671795
49	NC_018143	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	397671795
50	NC_018143	CCGC	2	8	18791	18798	0 %	0 %	25 %	75 %	397671796
51	NC_018143	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	397671797
52	NC_018143	CCAG	2	8	20743	20750	25 %	0 %	25 %	50 %	397671797
53	NC_018143	CACC	2	8	20926	20933	25 %	0 %	0 %	75 %	397671797
54	NC_018143	CGGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	397671798
55	NC_018143	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	397671798
56	NC_018143	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	397671798
57	NC_018143	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	397671798
58	NC_018143	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	397671798
59	NC_018143	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	397671798
60	NC_018143	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	397671800
61	NC_018143	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	397671800
62	NC_018143	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	397671800
63	NC_018143	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	397671800
64	NC_018143	GCTC	2	8	26505	26512	0 %	25 %	25 %	50 %	397671801
65	NC_018143	CCAA	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	397671801
66	NC_018143	CAGC	2	8	26788	26795	25 %	0 %	25 %	50 %	397671801
67	NC_018143	CGGC	2	8	27608	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	397671803
68	NC_018143	CCGG	2	8	28094	28101	0 %	0 %	50 %	50 %	397671803
69	NC_018143	GCTC	2	8	28650	28657	0 %	25 %	25 %	50 %	397671804
70	NC_018143	TGCG	2	8	28789	28796	0 %	25 %	50 %	25 %	397671804
71	NC_018143	CCGG	2	8	29054	29061	0 %	0 %	50 %	50 %	397671804
72	NC_018143	CGTC	2	8	29385	29392	0 %	25 %	25 %	50 %	397671805
73	NC_018143	CACG	2	8	29745	29752	25 %	0 %	25 %	50 %	397671806
74	NC_018143	ACCG	2	8	29826	29833	25 %	0 %	25 %	50 %	397671806
75	NC_018143	CCGG	2	8	30145	30152	0 %	0 %	50 %	50 %	397671806
76	NC_018143	GTCG	2	8	30321	30328	0 %	25 %	50 %	25 %	397671806
77	NC_018143	CCCG	2	8	30943	30950	0 %	0 %	25 %	75 %	397671806
78	NC_018143	CGAG	2	8	31455	31462	25 %	0 %	50 %	25 %	397671807
79	NC_018143	CGAC	2	8	31752	31759	25 %	0 %	25 %	50 %	397671808
80	NC_018143	GCCG	2	8	32479	32486	0 %	0 %	50 %	50 %	397671809
81	NC_018143	CCGA	2	8	33468	33475	25 %	0 %	25 %	50 %	397671810
82	NC_018143	GGCC	2	8	34603	34610	0 %	0 %	50 %	50 %	397671812
83	NC_018143	ATCG	2	8	35096	35103	25 %	25 %	25 %	25 %	397671812
84	NC_018143	GATC	2	8	35434	35441	25 %	25 %	25 %	25 %	397671812
85	NC_018143	CCAC	2	8	36255	36262	25 %	0 %	0 %	75 %	397671812
86	NC_018143	ACCG	2	8	36649	36656	25 %	0 %	25 %	50 %	397671813
87	NC_018143	CTGG	2	8	36993	37000	0 %	25 %	50 %	25 %	397671814
88	NC_018143	TGCC	2	8	37028	37035	0 %	25 %	25 %	50 %	397671814
89	NC_018143	GCAT	2	8	37388	37395	25 %	25 %	25 %	25 %	397671815
90	NC_018143	GCTG	2	8	37902	37909	0 %	25 %	50 %	25 %	397671815
91	NC_018143	AACG	2	8	38657	38664	50 %	0 %	25 %	25 %	397671815
92	NC_018143	CCGA	2	8	38718	38725	25 %	0 %	25 %	50 %	397671815
93	NC_018143	CCAC	2	8	38874	38881	25 %	0 %	0 %	75 %	397671815
94	NC_018143	CAGC	2	8	39101	39108	25 %	0 %	25 %	50 %	397671816
95	NC_018143	CCGG	2	8	39597	39604	0 %	0 %	50 %	50 %	397671816
96	NC_018143	GGCC	2	8	40128	40135	0 %	0 %	50 %	50 %	397671817
97	NC_018143	CGAT	2	8	40578	40585	25 %	25 %	25 %	25 %	397671817
98	NC_018143	GCCG	2	8	40878	40885	0 %	0 %	50 %	50 %	397671817
99	NC_018143	CACC	2	8	40903	40910	25 %	0 %	0 %	75 %	397671817
100	NC_018143	ACCG	2	8	41126	41133	25 %	0 %	25 %	50 %	397671817
101	NC_018143	GCGT	2	8	41152	41159	0 %	25 %	50 %	25 %	397671817
102	NC_018143	CCAC	2	8	41881	41888	25 %	0 %	0 %	75 %	397671818
103	NC_018143	CGAT	2	8	41890	41897	25 %	25 %	25 %	25 %	397671818
104	NC_018143	GGCC	2	8	42586	42593	0 %	0 %	50 %	50 %	397671820
105	NC_018143	CCCG	2	8	43177	43184	0 %	0 %	25 %	75 %	397671820
106	NC_018143	CGGG	2	8	43206	43213	0 %	0 %	75 %	25 %	397671820
107	NC_018143	CGAC	2	8	43845	43852	25 %	0 %	25 %	50 %	397671821
108	NC_018143	GAGC	2	8	44225	44232	25 %	0 %	50 %	25 %	397671821
109	NC_018143	GGGC	2	8	45384	45391	0 %	0 %	75 %	25 %	397671821
110	NC_018143	CGGC	2	8	45479	45486	0 %	0 %	50 %	50 %	397671821
111	NC_018143	GCCG	2	8	46442	46449	0 %	0 %	50 %	50 %	397671821
112	NC_018143	TTGC	2	8	46606	46613	0 %	50 %	25 %	25 %	397671822
113	NC_018143	CCGC	2	8	46754	46761	0 %	0 %	25 %	75 %	397671822
114	NC_018143	CCGC	2	8	46787	46794	0 %	0 %	25 %	75 %	397671822
115	NC_018143	GGTC	2	8	46895	46902	0 %	25 %	50 %	25 %	397671822
116	NC_018143	CGGG	2	8	47446	47453	0 %	0 %	75 %	25 %	397671823
117	NC_018143	GCAG	2	8	47519	47526	25 %	0 %	50 %	25 %	397671823
118	NC_018143	GTGC	2	8	48419	48426	0 %	25 %	50 %	25 %	397671824
119	NC_018143	GCCG	2	8	48703	48710	0 %	0 %	50 %	50 %	397671824
120	NC_018143	CAGC	2	8	49888	49895	25 %	0 %	25 %	50 %	397671825
121	NC_018143	CGGG	2	8	50077	50084	0 %	0 %	75 %	25 %	397671826
122	NC_018143	GCCG	2	8	50177	50184	0 %	0 %	50 %	50 %	397671826
123	NC_018143	GGTG	2	8	50500	50507	0 %	25 %	75 %	0 %	397671826
124	NC_018143	CTCA	2	8	51116	51123	25 %	25 %	0 %	50 %	397671826
125	NC_018143	CGCT	2	8	51255	51262	0 %	25 %	25 %	50 %	397671827
126	NC_018143	GGTA	2	8	52121	52128	25 %	25 %	50 %	0 %	397671828
127	NC_018143	ACCA	2	8	53741	53748	50 %	0 %	0 %	50 %	397671830
128	NC_018143	GTGC	2	8	54626	54633	0 %	25 %	50 %	25 %	397671830
129	NC_018143	ACCG	2	8	55504	55511	25 %	0 %	25 %	50 %	397671830
130	NC_018143	CCCG	2	8	55663	55670	0 %	0 %	25 %	75 %	397671830
131	NC_018143	GGCC	2	8	56337	56344	0 %	0 %	50 %	50 %	397671831
132	NC_018143	CGCT	2	8	57064	57071	0 %	25 %	25 %	50 %	397671831
133	NC_018143	GCGG	2	8	58821	58828	0 %	0 %	75 %	25 %	397671834
134	NC_018143	GTTC	2	8	59040	59047	0 %	50 %	25 %	25 %	397671834
135	NC_018143	AGCG	2	8	59245	59252	25 %	0 %	50 %	25 %	397671835
136	NC_018143	CGGC	2	8	59987	59994	0 %	0 %	50 %	50 %	397671837
137	NC_018143	GCGG	2	8	59999	60006	0 %	0 %	75 %	25 %	397671837
138	NC_018143	CAGC	2	8	61517	61524	25 %	0 %	25 %	50 %	397671838
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