MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 77921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018143	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671779
2	NC_018143	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671779
3	NC_018143	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
4	NC_018143	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
5	NC_018143	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671779
6	NC_018143	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
7	NC_018143	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
8	NC_018143	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
9	NC_018143	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
10	NC_018143	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
11	NC_018143	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
12	NC_018143	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671779
13	NC_018143	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
14	NC_018143	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671779
15	NC_018143	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
16	NC_018143	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671779
17	NC_018143	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671779
18	NC_018143	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
19	NC_018143	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671779
20	NC_018143	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
21	NC_018143	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
22	NC_018143	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671779
23	NC_018143	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
24	NC_018143	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671779
25	NC_018143	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
26	NC_018143	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671780
27	NC_018143	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
28	NC_018143	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671780
29	NC_018143	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
30	NC_018143	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397671780
31	NC_018143	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671780
32	NC_018143	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671780
33	NC_018143	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671780
34	NC_018143	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671780
35	NC_018143	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671780
36	NC_018143	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671780
37	NC_018143	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671780
38	NC_018143	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671780
39	NC_018143	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671780
40	NC_018143	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671780
41	NC_018143	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
42	NC_018143	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671780
43	NC_018143	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671781
44	NC_018143	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
45	NC_018143	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
46	NC_018143	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
47	NC_018143	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671781
48	NC_018143	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671781
49	NC_018143	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671781
50	NC_018143	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
51	NC_018143	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671781
52	NC_018143	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
53	NC_018143	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671781
54	NC_018143	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
55	NC_018143	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
56	NC_018143	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
57	NC_018143	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
58	NC_018143	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
59	NC_018143	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
60	NC_018143	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671781
61	NC_018143	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
62	NC_018143	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
63	NC_018143	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671781
64	NC_018143	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671781
65	NC_018143	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
66	NC_018143	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671782
67	NC_018143	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671782
68	NC_018143	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671782
69	NC_018143	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671782
70	NC_018143	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671782
71	NC_018143	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671782
72	NC_018143	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671782
73	NC_018143	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671783
74	NC_018143	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
75	NC_018143	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
76	NC_018143	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671783
77	NC_018143	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671783
78	NC_018143	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
79	NC_018143	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
80	NC_018143	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671783
81	NC_018143	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
82	NC_018143	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
83	NC_018143	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
84	NC_018143	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
85	NC_018143	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
86	NC_018143	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671783
87	NC_018143	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671783
88	NC_018143	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
89	NC_018143	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671783
90	NC_018143	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
91	NC_018143	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
92	NC_018143	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
93	NC_018143	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
94	NC_018143	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
95	NC_018143	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671783
96	NC_018143	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671783
97	NC_018143	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
98	NC_018143	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671783
99	NC_018143	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671783
100	NC_018143	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671783
101	NC_018143	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671783
102	NC_018143	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671783
103	NC_018143	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671783
104	NC_018143	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671783
105	NC_018143	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
106	NC_018143	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671783
107	NC_018143	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671783
108	NC_018143	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671784
109	NC_018143	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
110	NC_018143	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671784
111	NC_018143	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671784
112	NC_018143	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671784
113	NC_018143	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671784
114	NC_018143	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
115	NC_018143	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
116	NC_018143	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671784
117	NC_018143	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671784
118	NC_018143	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671784
119	NC_018143	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
120	NC_018143	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
121	NC_018143	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671784
122	NC_018143	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671784
123	NC_018143	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671784
124	NC_018143	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671784
125	NC_018143	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671784
126	NC_018143	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671784
127	NC_018143	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671784
128	NC_018143	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671784
129	NC_018143	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671784
130	NC_018143	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671784
131	NC_018143	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671784
132	NC_018143	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
133	NC_018143	GCG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671784
134	NC_018143	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671784
135	NC_018143	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
136	NC_018143	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
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138	NC_018143	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671784
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250	NC_018143	CCG	2	6	16669	16674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671794
251	NC_018143	ACG	2	6	16719	16724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671794
252	NC_018143	CGG	2	6	16735	16740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671794
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499	NC_018143	ACG	2	6	32268	32273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671809
500	NC_018143	AGA	3	9	32323	32331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671809

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