MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Lorraine plasmid pLELO

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018141	TATCCA	2	12	398	409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397668687
2	NC_018141	GCAAAA	2	12	5822	5833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018141	AGTATT	2	12	10910	10921	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397668701
4	NC_018141	GTAAAG	2	12	11806	11817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397668702
5	NC_018141	ATCTTT	2	12	13210	13221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397668705
6	NC_018141	CAGGAA	2	12	16653	16664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397668709
7	NC_018141	AGGTTT	2	12	17561	17572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397668711
8	NC_018141	TGATTT	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018141	GGAAGA	2	12	25003	25014	50 %	0 %	50 %	0 %	397668719
10	NC_018141	TTGATT	2	12	36127	36138	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397668731
11	NC_018141	TATTAA	2	12	43354	43365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018141	TATCTT	2	12	53935	53946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397668749
13	NC_018141	GCATGA	2	12	57912	57923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397668751
14	NC_018141	TGTTCT	2	12	59510	59521	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397668753
15	NC_018141	AGGCAA	2	12	63114	63125	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397668756
16	NC_018141	ATTTCG	2	12	66142	66153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397668758
17	NC_018141	CTACCG	2	12	69334	69345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397668763
18	NC_018141	TTATTG	2	12	73424	73435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397668766
19	NC_018141	AAAATA	2	12	75620	75631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397668769
20	NC_018141	TATAAA	2	12	77379	77390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397668769
21	NC_018141	ATATGG	2	12	77832	77843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397668769
22	NC_018141	TTGAAA	2	12	81326	81337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397668771
23	NC_018141	TTTAAA	2	12	82263	82274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018141	TATTTT	2	12	82962	82973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397668774
25	NC_018141	GCCTTA	2	12	98928	98939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397668787
26	NC_018141	GTTCTT	2	12	101306	101317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018141	TCTCTT	2	12	104625	104636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397668794
28	NC_018141	TTAAAA	2	12	108080	108091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397668797
29	NC_018141	TTTTCA	2	12	112984	112995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397668806
30	NC_018141	TTGTCT	2	12	115043	115054	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397668808
31	NC_018141	GACTTG	2	12	120674	120685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397668809
32	NC_018141	CTGCAG	2	12	124281	124292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397668811
33	NC_018141	ATTACG	2	12	126552	126563	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397668812
34	NC_018141	AGCATC	2	12	133833	133844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397668820
35	NC_018141	TAAAAT	2	12	144516	144527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397668836
36	NC_018141	TGGTTT	2	12	146776	146787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397668837
37	NC_018141	GATAAA	2	12	147634	147645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.